131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1127 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2430  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  42.08 
 
 		 918 aa  777    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1127  two component regulator propeller domain protein  100 
 
 		 924 aa  1915    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3632  Two component regulator three Y domain protein  33.44 
 
 		 966 aa  513  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4178  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  29.24 
 
 		 976 aa  427  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5110  Two component regulator three Y domain protein  30.68 
 
 		 966 aa  418  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58811  normal  0.312264 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1559  two component regulator  29.11 
 
 		 959 aa  412  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1046  transcriptional regulator, LuxR family  28.15 
 
 		 947 aa  345  2.9999999999999997e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4457  transcriptional regulator, LuxR family  33.94 
 
 		 966 aa  278  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.547155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3526  response regulator receiver protein  28.38 
 
 		 921 aa  229  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  26.32 
 
 		 1366 aa  217  7e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1852  histidine kinase  23.05 
 
 		 1074 aa  111  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.496494  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1719  histidine kinase  24.47 
 
 		 1257 aa  110  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0583268  normal  0.402469 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  21.07 
 
 		 1341 aa  102  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4246  histidine kinase  26.42 
 
 		 1280 aa  95.5  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.921248  normal  0.11404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1033  TPR repeat-containing protein  35.67 
 
 		 545 aa  95.5  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2397  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 571 aa  94.7  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 549 aa  91.3  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4722  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 		 560 aa  90.9  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  22.78 
 
 		 1093 aa  86.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  22.45 
 
 		 1086 aa  84  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2054  hypothetical protein  28.87 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.247121  normal  0.0331118 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2600  diguanylate cyclase with beta propeller sensor  23.13 
 
 		 977 aa  73.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_84  histidine kinase  21.69 
 
 		 1084 aa  72.8  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1857  hypothetical protein  26.63 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0390  hypothetical protein  30.94 
 
 		 400 aa  72  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000281987  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1685  GGDEF domain-containing protein  32.56 
 
 		 987 aa  71.2  0.00000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00461565  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  22.09 
 
 		 1526 aa  70.5  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1854  hypothetical protein  26.14 
 
 		 409 aa  69.3  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4161  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.87 
 
 		 1295 aa  68.9  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.086012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1856  hypothetical protein  28.17 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5155  hypothetical protein  26.16 
 
 		 623 aa  68.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  hitchhiker  0.000451709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4624  hypothetical protein  28.32 
 
 		 638 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.706425  normal  0.495642 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  21.11 
 
 		 1278 aa  66.6  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1214  hypothetical protein  23.33 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.636618 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1855  hypothetical protein  24.42 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1301  two component regulator propeller domain protein  21.05 
 
 		 1008 aa  65.5  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.503431  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1280  signal transduction histidine kinase, LytS  22.78 
 
 		 1015 aa  65.5  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0152278  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  21.92 
 
 		 1334 aa  65.1  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0846  response regulator receiver domain-containing protein  35.44 
 
 		 155 aa  64.7  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2052  hypothetical protein  25 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000379131  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2641  hypothetical protein  27.08 
 
 		 603 aa  64.3  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0683  hypothetical protein  23.84 
 
 		 169 aa  63.5  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0430882  normal  0.218421 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  20.03 
 
 		 1031 aa  62.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  21.68 
 
 		 1355 aa  62.4  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5363  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  25.63 
 
 		 607 aa  62.4  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1027  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.19 
 
 		 1276 aa  62  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  23.06 
 
 		 1024 aa  62  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1617  ATP-binding region ATPase domain protein  23.05 
 
 		 975 aa  61.2  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269144  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  27.54 
 
 		 1034 aa  59.7  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01691  histidine kinase/response regulator hybrid protein  20.74 
 
 		 1185 aa  60.1  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.578363  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0389  hypothetical protein  26.84 
 
 		 404 aa  59.7  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000587209  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02778  GGDEF protein  29.68 
 
 		 946 aa  60.1  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  23.08 
 
 		 1340 aa  59.7  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  22.07 
 
 		 1327 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0216  response regulator receiver domain-containing protein  27.62 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0122145  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  20.61 
 
 		 1407 aa  58.9  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3354  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.89 
 
 		 1242 aa  58.5  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02697  sensory box protein  21.3 
 
 		 1510 aa  58.5  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05925  GGDEF domain protein  23.1 
 
 		 1005 aa  58.2  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2043  hypothetical protein  28.24 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000980864  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  19.74 
 
 		 1033 aa  57.4  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  20.55 
 
 		 1054 aa  57  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  25.95 
 
 		 1498 aa  56.6  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.51 
 
 		 1338 aa  56.6  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.216357  normal  0.0407933 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  24.08 
 
 		 1351 aa  57  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  22.62 
 
 		 1306 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  22.3 
 
 		 1384 aa  56.2  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2055  hypothetical protein  27.27 
 
 		 412 aa  56.2  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322363 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  21.01 
 
 		 1313 aa  55.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2398  hypothetical protein  26.96 
 
 		 167 aa  55.1  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.63 
 
 		 1079 aa  54.7  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0522  sigma-70, region 4 type 2  32.73 
 
 		 408 aa  53.9  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0967  GGDEF family protein  20.59 
 
 		 976 aa  53.9  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.1127  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0142  hypothetical protein  25 
 
 		 421 aa  53.9  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0129237  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  21.88 
 
 		 1370 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4115  two component regulator propeller domain-containing protein  30.19 
 
 		 357 aa  53.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0684737 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00967  Putative signal protein with GGDEF domain  22.86 
 
 		 990 aa  52.8  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0579558  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06199  Putative signal protein with GGDEF domain  22.86 
 
 		 990 aa  52.8  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368142  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1225  diguanylate cyclase with beta propeller sensor  24.71 
 
 		 985 aa  52.8  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.90661  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0156  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  22.4 
 
 		 1075 aa  52  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000640114  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  22.1 
 
 		 1378 aa  52  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  23.23 
 
 		 1378 aa  51.6  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3521  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.09 
 
 		 1237 aa  51.6  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  21.89 
 
 		 1342 aa  51.6  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5256  histidine kinase  20.14 
 
 		 1063 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.015523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  20.52 
 
 		 1335 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0353  hypothetical protein  31.58 
 
 		 409 aa  50.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000783451  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2421  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  29.63 
 
 		 1437 aa  50.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.261308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  26.32 
 
 		 1105 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 		 1211 aa  50.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  30.1 
 
 		 1374 aa  50.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0585  hypothetical protein  36.11 
 
 		 413 aa  49.3  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.227182  normal  0.394141 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3749  putative signal transduction histidine kinase  23.64 
 
 		 1018 aa  49.3  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0973084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1680  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  20.24 
 
 		 1524 aa  49.7  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.482461  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2733  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  27.12 
 
 		 965 aa  49.7  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2053  regulatory protein LuxR  32.89 
 
 		 410 aa  49.7  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00334599  normal  0.0797865 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  21.65 
 
 		 1343 aa  49.7  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  28.57 
 
 		 1324 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  32.14 
 
 		 1397 aa  48.9  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  21.15 
 
 		 1048 aa  48.5  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>