23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2641 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2641  hypothetical protein  100 
 
 		 603 aa  1228    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4624  hypothetical protein  47.46 
 
 		 638 aa  538  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.706425  normal  0.495642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5363  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  34.8 
 
 		 607 aa  324  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5155  hypothetical protein  26.91 
 
 		 623 aa  176  9e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  hitchhiker  0.000451709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4552  histidine kinase  28.04 
 
 		 738 aa  136  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00113459  normal  0.0314449 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2430  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  29.25 
 
 		 918 aa  65.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2397  TPR repeat-containing protein  23.8 
 
 		 571 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4178  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  25.68 
 
 		 976 aa  65.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1033  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 		 545 aa  65.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4722  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 560 aa  64.3  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1127  two component regulator propeller domain protein  27.39 
 
 		 924 aa  63.2  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3632  Two component regulator three Y domain protein  31.25 
 
 		 966 aa  60.8  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1046  transcriptional regulator, LuxR family  29.03 
 
 		 947 aa  60.5  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3977  signal transduction histidine kinase, LytS  25.06 
 
 		 675 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.932944  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5110  Two component regulator three Y domain protein  41.89 
 
 		 966 aa  58.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58811  normal  0.312264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.43 
 
 		 549 aa  58.9  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1559  two component regulator  28.26 
 
 		 959 aa  55.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3526  response regulator receiver protein  24.88 
 
 		 921 aa  52.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  21.93 
 
 		 648 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4457  transcriptional regulator, LuxR family  26.67 
 
 		 966 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.547155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2284  hypothetical protein  29.89 
 
 		 584 aa  47.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2054  hypothetical protein  31.65 
 
 		 407 aa  46.2  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.247121  normal  0.0331118 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1857  hypothetical protein  29.73 
 
 		 412 aa  44.3  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>