106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4722 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4722  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 560 aa  1137    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1033  TPR repeat-containing protein  52.68 
 
 		 545 aa  506  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2397  TPR repeat-containing protein  48.37 
 
 		 571 aa  489  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1046  transcriptional regulator, LuxR family  31.66 
 
 		 947 aa  103  7e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4457  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 966 aa  101  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.547155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4178  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  28.36 
 
 		 976 aa  97.8  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2430  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  29.44 
 
 		 918 aa  95.9  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3632  Two component regulator three Y domain protein  31.58 
 
 		 966 aa  95.9  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3526  response regulator receiver protein  28.3 
 
 		 921 aa  95.1  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1127  two component regulator propeller domain protein  34 
 
 		 924 aa  90.1  9e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.34 
 
 		 549 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5110  Two component regulator three Y domain protein  29.69 
 
 		 966 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58811  normal  0.312264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.29 
 
 		 991 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1559  two component regulator  27.89 
 
 		 959 aa  78.2  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2284  hypothetical protein  26.33 
 
 		 584 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  24.89 
 
 		 782 aa  75.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 		 1060 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2641  hypothetical protein  25.22 
 
 		 603 aa  71.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  22.46 
 
 		 650 aa  70.9  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0415  histidine kinase  21.57 
 
 		 600 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5363  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  24.04 
 
 		 607 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  23.39 
 
 		 1313 aa  68.6  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  25.88 
 
 		 828 aa  66.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  23.95 
 
 		 1101 aa  65.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1857  hypothetical protein  29.23 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  28.44 
 
 		 2145 aa  63.9  0.000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  23.91 
 
 		 985 aa  63.5  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4624  hypothetical protein  21.05 
 
 		 638 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.706425  normal  0.495642 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  22.43 
 
 		 809 aa  60.8  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  21.69 
 
 		 1266 aa  60.1  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3413  histidine kinase internal region  29.41 
 
 		 671 aa  60.1  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.29 
 
 		 852 aa  60.1  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2390  TPR repeat-containing diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase  22.99 
 
 		 600 aa  58.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  22.62 
 
 		 609 aa  58.2  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  25.1 
 
 		 1009 aa  57.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  23.69 
 
 		 941 aa  57.4  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.73 
 
 		 760 aa  56.2  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  24.89 
 
 		 1212 aa  57  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 438 aa  56.2  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 		 923 aa  56.2  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  20 
 
 		 1063 aa  55.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  29.21 
 
 		 1550 aa  55.8  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3471  Tetratricopeptide domain protein  26.95 
 
 		 526 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2645  Tetratricopeptide domain protein  26.95 
 
 		 526 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.528519 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  22.14 
 
 		 1238 aa  55.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  22.78 
 
 		 957 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  30.81 
 
 		 2413 aa  55.5  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  24.89 
 
 		 746 aa  53.9  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4076  histidine kinase  26.46 
 
 		 667 aa  53.5  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.249378  normal  0.142572 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4245  hypothetical protein  24.81 
 
 		 388 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275514  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  23.79 
 
 		 1404 aa  52.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3715  histidine kinase  25.26 
 
 		 695 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 872 aa  51.6  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  23.71 
 
 		 340 aa  51.2  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6069  signal transduction histidine kinase  21.62 
 
 		 659 aa  50.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  20.8 
 
 		 343 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1817  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 		 945 aa  49.7  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.703136  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0939  TPR repeat-containing protein  22.27 
 
 		 714 aa  50.1  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5155  hypothetical protein  27.34 
 
 		 623 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  hitchhiker  0.000451709 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3156  tetratricopeptide TPR_4  20.32 
 
 		 357 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.605618  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.17 
 
 		 1279 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 448 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1382  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  22.88 
 
 		 868 aa  48.5  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0126588  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1420  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 809 aa  48.5  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128456  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0522  sigma-70, region 4 type 2  35.14 
 
 		 408 aa  48.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 408 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2052  hypothetical protein  31.48 
 
 		 403 aa  48.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000379131  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.27 
 
 		 636 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  21.88 
 
 		 364 aa  47.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2835  TPR repeat-containing protein  23.04 
 
 		 287 aa  47.8  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356723  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2054  hypothetical protein  36.23 
 
 		 407 aa  47.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.247121  normal  0.0331118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0116  signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 698 aa  48.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 854 aa  47.4  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2043  hypothetical protein  26.94 
 
 		 356 aa  47.4  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000980864  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  27.96 
 
 		 875 aa  47  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  22.47 
 
 		 1180 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  26.9 
 
 		 913 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2055  hypothetical protein  27.11 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  30.17 
 
 		 1022 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  21.25 
 
 		 928 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 		 750 aa  45.8  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 1261 aa  46.2  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 329 aa  46.2  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3010  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 		 421 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122789  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0038  transcriptional regulator, LuxR family  28.16 
 
 		 307 aa  45.8  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  22.34 
 
 		 1360 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.26 
 
 		 1162 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  22.87 
 
 		 1666 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 		 1450 aa  45.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4503  histidine kinase  22.9 
 
 		 643 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1856  hypothetical protein  36.36 
 
 		 407 aa  44.3  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  25.89 
 
 		 1020 aa  44.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  26.45 
 
 		 585 aa  44.3  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 1162 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  29.81 
 
 		 919 aa  44.3  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  25.22 
 
 		 775 aa  44.3  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4574  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 729 aa  43.9  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.543152  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  23.33 
 
 		 1025 aa  43.9  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1854  hypothetical protein  33.33 
 
 		 409 aa  43.9  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>