59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3526 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3526  response regulator receiver protein  100 
 
 		 921 aa  1853    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3632  Two component regulator three Y domain protein  30.7 
 
 		 966 aa  396  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4457  transcriptional regulator, LuxR family  27.65 
 
 		 966 aa  347  5e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.547155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1559  two component regulator  27.75 
 
 		 959 aa  302  2e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1127  two component regulator propeller domain protein  28.79 
 
 		 924 aa  230  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2430  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  30.47 
 
 		 918 aa  215  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1046  transcriptional regulator, LuxR family  26.84 
 
 		 947 aa  194  5e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5110  Two component regulator three Y domain protein  25 
 
 		 966 aa  174  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58811  normal  0.312264 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4178  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  23.85 
 
 		 976 aa  162  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  25.07 
 
 		 1366 aa  122  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1719  histidine kinase  20.91 
 
 		 1257 aa  119  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0583268  normal  0.402469 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1852  histidine kinase  23.47 
 
 		 1074 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.496494  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2397  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 		 571 aa  92  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4722  TPR repeat-containing protein  30.57 
 
 		 560 aa  89.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1033  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 545 aa  84  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4246  histidine kinase  20.16 
 
 		 1280 aa  82  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.921248  normal  0.11404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.26 
 
 		 549 aa  76.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1857  hypothetical protein  27.39 
 
 		 412 aa  76.6  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1854  hypothetical protein  28.95 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5155  hypothetical protein  26.63 
 
 		 623 aa  69.3  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  hitchhiker  0.000451709 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2054  hypothetical protein  29.44 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.247121  normal  0.0331118 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  19.09 
 
 		 1341 aa  68.9  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5363  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  29.88 
 
 		 607 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0216  response regulator receiver domain-containing protein  34.36 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0122145  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1214  hypothetical protein  26.63 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.636618 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2043  hypothetical protein  24.15 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000980864  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1856  hypothetical protein  28.95 
 
 		 407 aa  64.3  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0389  hypothetical protein  28.83 
 
 		 404 aa  63.2  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000587209  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4624  hypothetical protein  28.74 
 
 		 638 aa  63.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.706425  normal  0.495642 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2052  hypothetical protein  27.63 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000379131  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  30.21 
 
 		 1404 aa  58.9  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2398  hypothetical protein  25.48 
 
 		 167 aa  58.9  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0142  hypothetical protein  26.35 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0129237  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0846  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 155 aa  57.8  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0683  hypothetical protein  25.9 
 
 		 169 aa  56.6  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0430882  normal  0.218421 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0585  hypothetical protein  27.56 
 
 		 413 aa  56.6  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.227182  normal  0.394141 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2173  LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 269 aa  55.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0522  sigma-70, region 4 type 2  28.65 
 
 		 408 aa  55.8  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0390  hypothetical protein  40.3 
 
 		 400 aa  55.5  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000281987  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2055  hypothetical protein  40.91 
 
 		 412 aa  54.3  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322363 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0353  hypothetical protein  26.97 
 
 		 409 aa  53.1  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000783451  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2641  hypothetical protein  24.88 
 
 		 603 aa  53.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2053  regulatory protein LuxR  38.46 
 
 		 410 aa  52  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00334599  normal  0.0797865 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1855  hypothetical protein  25.9 
 
 		 409 aa  51.6  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  20.74 
 
 		 1346 aa  47  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0038  transcriptional regulator, LuxR family  30.12 
 
 		 307 aa  46.6  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.33 
 
 		 212 aa  46.2  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 213 aa  45.8  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20.81 
 
 		 1453 aa  46.2  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  31.9 
 
 		 1400 aa  45.1  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3740  LuxR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 403 aa  45.1  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  18.04 
 
 		 1338 aa  45.1  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.216357  normal  0.0407933 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1617  ATP-binding region ATPase domain protein  23.43 
 
 		 975 aa  44.7  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3523  two component LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 224 aa  44.7  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1366  probable regulatory protein, LuxR domain protein  33.75 
 
 		 324 aa  44.7  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2193  histidine kinase  25 
 
 		 1035 aa  44.7  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41040  Two-component response regulator, LuxR family  40 
 
 		 208 aa  44.3  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.136918  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01362  hypothetical protein  26.55 
 
 		 1141 aa  44.3  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3354  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 1242 aa  44.3  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>