167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2430 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2430  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  100 
 
 		 918 aa  1873    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1127  two component regulator propeller domain protein  42.08 
 
 		 924 aa  764    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3632  Two component regulator three Y domain protein  32.98 
 
 		 966 aa  502  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4457  transcriptional regulator, LuxR family  30.08 
 
 		 966 aa  460  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.547155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5110  Two component regulator three Y domain protein  30.84 
 
 		 966 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58811  normal  0.312264 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4178  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  29.66 
 
 		 976 aa  419  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1559  two component regulator  30.92 
 
 		 959 aa  402  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1046  transcriptional regulator, LuxR family  28.36 
 
 		 947 aa  368  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3526  response regulator receiver protein  30.47 
 
 		 921 aa  216  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  24.06 
 
 		 1366 aa  215  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1852  histidine kinase  20.74 
 
 		 1074 aa  164  9e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.496494  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1719  histidine kinase  20.44 
 
 		 1257 aa  110  9.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0583268  normal  0.402469 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  20.61 
 
 		 1341 aa  95.5  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4722  TPR repeat-containing protein  32.02 
 
 		 560 aa  94.7  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1033  TPR repeat-containing protein  32.07 
 
 		 545 aa  93.2  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  22.7 
 
 		 1093 aa  90.5  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  22.45 
 
 		 1373 aa  89  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4246  histidine kinase  22.81 
 
 		 1280 aa  88.2  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.921248  normal  0.11404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2397  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 		 571 aa  87.4  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  20.98 
 
 		 1114 aa  80.5  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.25 
 
 		 549 aa  80.9  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  22.52 
 
 		 1344 aa  78.2  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  22.13 
 
 		 1316 aa  77.8  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  22.53 
 
 		 1086 aa  77.4  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4161  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20.16 
 
 		 1295 aa  73.9  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.086012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1857  hypothetical protein  33.33 
 
 		 412 aa  73.2  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  25.54 
 
 		 1418 aa  72.8  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1685  GGDEF domain-containing protein  22.29 
 
 		 987 aa  72.4  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00461565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  19.59 
 
 		 1024 aa  72.4  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  20.69 
 
 		 1407 aa  69.3  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 1258 aa  68.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  19.9 
 
 		 1335 aa  68.6  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  23.72 
 
 		 1355 aa  68.6  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  24.84 
 
 		 1378 aa  68.6  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05925  GGDEF domain protein  27.46 
 
 		 1005 aa  68.2  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1280  signal transduction histidine kinase, LytS  19.88 
 
 		 1015 aa  68.2  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0152278  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  33.91 
 
 		 1334 aa  68.2  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.91 
 
 		 1498 aa  66.6  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2641  hypothetical protein  29.25 
 
 		 603 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2456  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  21.65 
 
 		 1438 aa  66.2  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4624  hypothetical protein  28.57 
 
 		 638 aa  64.7  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.706425  normal  0.495642 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3424  GGDEF domain-containing protein  24.44 
 
 		 1502 aa  64.3  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  30.43 
 
 		 1378 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  21.84 
 
 		 1374 aa  62.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  24.14 
 
 		 1313 aa  62.4  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2733  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  19.92 
 
 		 965 aa  62.4  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  18.42 
 
 		 1338 aa  61.6  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.216357  normal  0.0407933 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5363  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  28.93 
 
 		 607 aa  61.6  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  20.7 
 
 		 1278 aa  61.2  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2054  hypothetical protein  29.38 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.247121  normal  0.0331118 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0341  sensory box protein  22.8 
 
 		 1515 aa  60.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5155  hypothetical protein  23.53 
 
 		 623 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  hitchhiker  0.000451709 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  30 
 
 		 1404 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  22.22 
 
 		 1347 aa  60.8  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1633  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  23.74 
 
 		 1447 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.15537 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  27.5 
 
 		 1324 aa  60.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  28.12 
 
 		 1342 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  22.17 
 
 		 1070 aa  59.3  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0967  GGDEF family protein  22.01 
 
 		 976 aa  59.7  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.1127  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0415  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.46 
 
 		 1486 aa  58.9  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4159  histidine kinase  21.51 
 
 		 1017 aa  59.3  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0934723  normal  0.139569 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0846  response regulator receiver domain-containing protein  37.04 
 
 		 155 aa  58.9  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  20.14 
 
 		 1526 aa  58.5  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  40.91 
 
 		 1306 aa  58.9  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3298  sensory box protein  23.48 
 
 		 1494 aa  58.5  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.217559 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3354  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20.72 
 
 		 1242 aa  58.5  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0585  hypothetical protein  29.14 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.227182  normal  0.394141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  21.13 
 
 		 1105 aa  58.2  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1411  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.74 
 
 		 1430 aa  57.8  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.017718 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1476  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.74 
 
 		 1430 aa  57.8  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65929  normal  0.14467 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0683  hypothetical protein  24.52 
 
 		 169 aa  57.4  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0430882  normal  0.218421 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1214  hypothetical protein  20.97 
 
 		 411 aa  57  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.636618 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  21.93 
 
 		 1505 aa  57  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  21.37 
 
 		 1400 aa  57  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0142  hypothetical protein  27.61 
 
 		 421 aa  56.6  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0129237  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2052  hypothetical protein  29.14 
 
 		 403 aa  57  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000379131  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1854  hypothetical protein  29.29 
 
 		 409 aa  56.2  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3749  putative signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 		 1018 aa  56.2  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0973084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  19.56 
 
 		 1211 aa  56.2  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  18.03 
 
 		 1175 aa  56.2  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1602  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.33 
 
 		 1410 aa  56.2  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.583296  hitchhiker  0.00283749 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  19.14 
 
 		 1355 aa  55.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2043  hypothetical protein  27.97 
 
 		 356 aa  55.8  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000980864  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3521  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.26 
 
 		 1237 aa  55.8  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  29.19 
 
 		 1034 aa  55.1  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  22.81 
 
 		 1374 aa  55.5  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2791  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.89 
 
 		 1226 aa  55.1  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.544858 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2600  diguanylate cyclase with beta propeller sensor  23.58 
 
 		 977 aa  55.1  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1856  hypothetical protein  32.17 
 
 		 407 aa  55.1  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0156  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  24.81 
 
 		 1075 aa  54.7  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000640114  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  21.65 
 
 		 1048 aa  54.7  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  21.33 
 
 		 1054 aa  54.3  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  29.32 
 
 		 1374 aa  54.3  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0390  hypothetical protein  39.71 
 
 		 400 aa  53.9  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000281987  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  27.42 
 
 		 1388 aa  53.5  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3648  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.64 
 
 		 1511 aa  53.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01692  histidine kinase-response regulator hybrid protein  19.81 
 
 		 921 aa  53.5  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.803557  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1464  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.44 
 
 		 1433 aa  52.8  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600207 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  31.39 
 
 		 1370 aa  53.1  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  20.44 
 
 		 1344 aa  52.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>