34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4624 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4624  hypothetical protein  100 
 
 		 638 aa  1308    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.706425  normal  0.495642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2641  hypothetical protein  47.46 
 
 		 603 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5363  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  33.44 
 
 		 607 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5155  hypothetical protein  28.01 
 
 		 623 aa  187  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  hitchhiker  0.000451709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4552  histidine kinase  28.66 
 
 		 738 aa  167  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00113459  normal  0.0314449 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1046  transcriptional regulator, LuxR family  28.89 
 
 		 947 aa  75.9  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3977  signal transduction histidine kinase, LytS  25.52 
 
 		 675 aa  72  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.932944  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2397  TPR repeat-containing protein  22.04 
 
 		 571 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4178  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  29.03 
 
 		 976 aa  68.6  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5110  Two component regulator three Y domain protein  26.1 
 
 		 966 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58811  normal  0.312264 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3526  response regulator receiver protein  28.26 
 
 		 921 aa  65.5  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2430  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  28.19 
 
 		 918 aa  64.3  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1127  two component regulator propeller domain protein  28.3 
 
 		 924 aa  62.4  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1559  two component regulator  25.53 
 
 		 959 aa  59.3  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4722  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 		 560 aa  58.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3632  Two component regulator three Y domain protein  23.94 
 
 		 966 aa  58.2  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1033  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 545 aa  57.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4076  histidine kinase  21.85 
 
 		 667 aa  57.4  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.249378  normal  0.142572 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4457  transcriptional regulator, LuxR family  24.26 
 
 		 966 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.547155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1854  hypothetical protein  26.63 
 
 		 409 aa  52.4  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.56 
 
 		 549 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01475  histidine kinase sensor protein  32.41 
 
 		 668 aa  48.5  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.399099  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  21.2 
 
 		 648 aa  48.5  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3413  histidine kinase internal region  30.63 
 
 		 671 aa  48.1  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2054  hypothetical protein  30.61 
 
 		 407 aa  47  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.247121  normal  0.0331118 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2052  hypothetical protein  26.5 
 
 		 403 aa  47  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000379131  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1344  histidine kinase  26.11 
 
 		 696 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 		 813 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0683  hypothetical protein  24.34 
 
 		 169 aa  46.6  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0430882  normal  0.218421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2284  hypothetical protein  26.36 
 
 		 584 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  23.28 
 
 		 755 aa  45.4  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0216  response regulator receiver domain-containing protein  35.21 
 
 		 398 aa  44.3  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0122145  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1857  hypothetical protein  28.38 
 
 		 412 aa  43.9  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4503  histidine kinase  28.12 
 
 		 643 aa  43.9  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.604782 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>