More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3413 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3413  histidine kinase internal region  100 
 
 		 671 aa  1374    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  25.79 
 
 		 650 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01910  Autolysin sensor kinase  37.38 
 
 		 729 aa  147  5e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.665726  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1280  signal transduction histidine kinase, LytS  40.76 
 
 		 1015 aa  144  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0152278  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0149  signal transduction histidine kinase, LytS  38.07 
 
 		 1192 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.413609 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5951  signal transduction histidine kinase, LytS  36.78 
 
 		 975 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.580279  normal  0.0504112 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1007  signal transduction histidine kinase, LytS  35.68 
 
 		 684 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  26.38 
 
 		 782 aa  126  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6581  signal transduction histidine kinase, LytS  34.74 
 
 		 541 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1503  putative phytochrome sensor protein  35.41 
 
 		 1182 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.531436 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3977  signal transduction histidine kinase, LytS  29.39 
 
 		 675 aa  124  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.932944  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1400  signal transduction histidine kinase, LytS  31.42 
 
 		 1051 aa  123  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 1313 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00390  putative regulator of cell autolysis  34.25 
 
 		 431 aa  110  7.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.848872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3306  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 483 aa  105  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  30.88 
 
 		 393 aa  104  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1005  signal transduction histidine kinase, LytS  30.72 
 
 		 390 aa  104  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000807756  normal  0.310499 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3044  signal transduction histidine kinase, LytS  35.43 
 
 		 438 aa  104  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2452  signal transduction histidine kinase, LytS  30.99 
 
 		 408 aa  103  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00298598  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1380  histidine kinase internal region  27.14 
 
 		 390 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  29.95 
 
 		 391 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01150  putative regulator of cell autolysis  30.88 
 
 		 440 aa  101  4e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1324  signal transduction histidine kinase, LytS  31.82 
 
 		 433 aa  101  6e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0634382  hitchhiker  0.00226936 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  23.39 
 
 		 985 aa  100  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01917  sensor histidine kinase  33.52 
 
 		 357 aa  100  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0189  histidine kinase internal region  31.34 
 
 		 642 aa  99.8  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0228  histidine kinase internal region  29.02 
 
 		 381 aa  99.8  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0985365  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.85 
 
 		 991 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 388 aa  98.6  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 1060 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  30.9 
 
 		 369 aa  98.6  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  29.36 
 
 		 428 aa  97.8  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  30.88 
 
 		 405 aa  97.4  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  30.05 
 
 		 374 aa  96.7  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0700  histidine kinase internal region  30.45 
 
 		 402 aa  95.9  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1584  histidine kinase internal region  33.33 
 
 		 304 aa  95.1  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  32 
 
 		 358 aa  95.1  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  31.6 
 
 		 568 aa  95.1  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  29.83 
 
 		 831 aa  94.7  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  21.88 
 
 		 1238 aa  94.4  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  31.93 
 
 		 374 aa  94.4  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0945  histidine kinase  28.37 
 
 		 600 aa  94  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  26.09 
 
 		 367 aa  94  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5007  signal transduction histidine kinase, LytS  28.19 
 
 		 408 aa  93.6  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  decreased coverage  0.00000540633 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0411  signal transduction histidine kinase, LytS  28.78 
 
 		 1018 aa  94  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000411039  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1351  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  27.14 
 
 		 414 aa  93.6  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3715  histidine kinase  27.51 
 
 		 695 aa  93.6  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223291 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2386  signal transduction histidine kinase, LytS  30.16 
 
 		 360 aa  92.4  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  24.1 
 
 		 1101 aa  92.8  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0672  signal transduction histidine kinase, LytS  29.46 
 
 		 289 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0617  signal transduction histidine kinase, LytS  28.11 
 
 		 601 aa  92.4  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000118268  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4381  signal transduction histidine kinase, LytS  27.76 
 
 		 377 aa  92  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  28.05 
 
 		 398 aa  92  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0103  signal transduction histidine kinase, LytS  30.05 
 
 		 495 aa  92  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1017  sensor histidine kinase, putative  27.55 
 
 		 579 aa  91.7  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  29.51 
 
 		 400 aa  91.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2252  histidine kinase internal region  28.44 
 
 		 569 aa  91.7  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1959  histidine kinase  28.91 
 
 		 414 aa  91.7  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2114  putative sensor with HAMP domain  32.47 
 
 		 627 aa  91.3  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.28006  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1966  sensor histidine kinase  27.23 
 
 		 389 aa  91.3  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  25.43 
 
 		 828 aa  91.3  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 446 aa  90.9  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  27.15 
 
 		 394 aa  90.5  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  24.34 
 
 		 645 aa  90.5  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4493  histidine kinase internal region  27.75 
 
 		 408 aa  90.5  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal  0.320157 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3406  histidine kinase internal region  27.27 
 
 		 603 aa  90.1  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.264135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5296  sensor histidine kinase LytS  31.58 
 
 		 589 aa  90.1  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5123  sensor histidine kinase  31.58 
 
 		 589 aa  90.1  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  27.68 
 
 		 394 aa  90.1  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5138  sensor histidine kinase  31.58 
 
 		 589 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5692  sensor histidine kinase LytS  31.58 
 
 		 589 aa  90.1  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5622  sensor histidine kinase LytS  31.58 
 
 		 589 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5566  sensor histidine kinase LytS  31.58 
 
 		 589 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0068  signal transduction histidine kinase, LytS  29.11 
 
 		 366 aa  90.1  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.361346  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4050  signal transduction histidine kinase, LytS  32.48 
 
 		 403 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4125  signal transduction histidine kinase, LytS  32.48 
 
 		 403 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal  0.628392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4279  signal transduction histidine kinase, LytS  32.48 
 
 		 403 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0064  signal transduction histidine kinase, LytS  25.91 
 
 		 428 aa  89.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5383  sensor histidine kinase LytS  31.58 
 
 		 522 aa  90.5  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.498572  normal  0.326696 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5537  sensor histidine kinase LytS  31.58 
 
 		 589 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1289  histidine kinase  26.17 
 
 		 420 aa  89.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847717  normal  0.228137 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 		 502 aa  89.4  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12050  putative regulator of cell autolysis  26.61 
 
 		 490 aa  89.7  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.236782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0764  histidine kinase internal region  25.27 
 
 		 582 aa  89.7  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.294756 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  29.91 
 
 		 432 aa  89  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 		 760 aa  89.4  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5574  sensor histidine kinase LytS  30.92 
 
 		 589 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 585 aa  89  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0255  sensor protein  32.95 
 
 		 631 aa  88.6  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0148  putative sensor with HAMP domain  26.58 
 
 		 594 aa  88.6  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  30.65 
 
 		 394 aa  88.6  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  23.42 
 
 		 648 aa  88.6  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0493  signal transduction histidine kinase, LytS  32.68 
 
 		 1022 aa  88.6  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000359244  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  28.95 
 
 		 362 aa  88.6  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1585  signal transduction histidine kinase, LytS  27.71 
 
 		 574 aa  88.6  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1582  signal transduction histidine kinase, LytS  27.13 
 
 		 498 aa  88.2  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0045193  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5235  signal transduction histidine kinase, LytS  26.85 
 
 		 589 aa  87.8  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  33.54 
 
 		 403 aa  87.8  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 357 aa  87.8  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  26.02 
 
 		 957 aa  87.8  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>