35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0683 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0683  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  347  5e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0430882  normal  0.218421 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0846  response regulator receiver domain-containing protein  52.67 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2054  hypothetical protein  45.83 
 
 		 407 aa  131  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.247121  normal  0.0331118 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2052  hypothetical protein  43.24 
 
 		 403 aa  124  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000379131  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0353  hypothetical protein  45.95 
 
 		 409 aa  122  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000783451  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1854  hypothetical protein  41.67 
 
 		 409 aa  120  8e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0389  hypothetical protein  46.53 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000587209  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1856  hypothetical protein  42.66 
 
 		 407 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2398  hypothetical protein  44.3 
 
 		 167 aa  117  7.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2043  hypothetical protein  44.44 
 
 		 356 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000980864  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1855  hypothetical protein  49.44 
 
 		 409 aa  100  7e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0585  hypothetical protein  40.28 
 
 		 413 aa  100  8e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.227182  normal  0.394141 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0142  hypothetical protein  42.86 
 
 		 421 aa  97.8  7e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0129237  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0522  sigma-70, region 4 type 2  42.11 
 
 		 408 aa  92.8  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1857  hypothetical protein  36.55 
 
 		 412 aa  91.7  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2053  regulatory protein LuxR  46.07 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00334599  normal  0.0797865 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2055  hypothetical protein  36.18 
 
 		 412 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322363 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1214  hypothetical protein  33.33 
 
 		 411 aa  78.2  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.636618 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0390  hypothetical protein  44.19 
 
 		 400 aa  74.7  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000281987  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0216  response regulator receiver domain-containing protein  38.36 
 
 		 398 aa  64.7  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0122145  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1127  two component regulator propeller domain protein  23.84 
 
 		 924 aa  63.5  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1046  transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 		 947 aa  62  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4178  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  36.36 
 
 		 976 aa  57.4  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2430  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  24.52 
 
 		 918 aa  57.4  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1559  two component regulator  38.03 
 
 		 959 aa  56.6  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3526  response regulator receiver protein  25.9 
 
 		 921 aa  56.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3632  Two component regulator three Y domain protein  25.48 
 
 		 966 aa  55.5  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5110  Two component regulator three Y domain protein  35.62 
 
 		 966 aa  55.1  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58811  normal  0.312264 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4457  transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 966 aa  47.8  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.547155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4624  hypothetical protein  24.34 
 
 		 638 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.706425  normal  0.495642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5155  hypothetical protein  31.91 
 
 		 623 aa  44.7  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  hitchhiker  0.000451709 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2244  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 446 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.793377  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2397  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 571 aa  42.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 218 aa  42  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1033  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 		 545 aa  40.8  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>