More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1344 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1344  histidine kinase  100 
 
 
696 aa  1415    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6126  histidine kinase  26.16 
 
 
628 aa  107  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0345  histidine kinase  28.99 
 
 
454 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0306383  normal  0.0156916 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 
576 aa  96.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1899  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 
407 aa  94  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.512504  normal  0.0507183 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4076  histidine kinase  22.18 
 
 
667 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.249378  normal  0.142572 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5059  histidine kinase  22.59 
 
 
614 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00156812  normal  0.0126668 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  26.91 
 
 
1169 aa  88.6  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3961  histidine kinase  28.69 
 
 
475 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321682  normal  0.0949422 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1627  two-component system sensor protein  28.57 
 
 
988 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255919  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0180  response regulator/sensor histidine kinase  28.57 
 
 
1014 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.696748  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0159  response regulator/sensor histidine kinase  28.57 
 
 
1032 aa  84  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636877  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1523  ATP-binding region ATPase domain protein  27.39 
 
 
433 aa  84  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925921  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
975 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2835  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.87 
 
 
964 aa  82.4  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.106901  decreased coverage  0.00127572 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.68 
 
 
1145 aa  83.2  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.6 
 
 
1022 aa  82.8  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  28.24 
 
 
1196 aa  81.6  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0099  signal transduction histidine kinase-like protein  25.19 
 
 
938 aa  82  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.878773 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1730  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.64 
 
 
1195 aa  81.6  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479441  normal  0.752594 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 
582 aa  81.3  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4481  sensor histidine kinase/response regulator  24.29 
 
 
982 aa  81.3  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0659  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.31 
 
 
570 aa  81.3  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0803  histidine kinase  27.76 
 
 
718 aa  80.9  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0571523  hitchhiker  0.00843936 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  28.26 
 
 
918 aa  80.5  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.56 
 
 
713 aa  80.5  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  28.26 
 
 
918 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1421  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 
404 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2974  histidine kinase  26.09 
 
 
298 aa  79.7  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.355012 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0072  putative sensor/response hybrid  27.57 
 
 
527 aa  79.3  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0111636 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0762  ATP-binding region ATPase domain protein  23.2 
 
 
630 aa  79.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 
569 aa  79  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1432  sensor histidine kinase  24.74 
 
 
621 aa  79  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.197546 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0125  Histidine kinase  27.76 
 
 
615 aa  79  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0141  two-component system sensor protein  29.76 
 
 
952 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3540  sensor for ctr capsule biosynthesis, histidine kinase acting on RcsB  28.79 
 
 
446 aa  79  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.168985  normal  0.341625 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.84 
 
 
1168 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.38 
 
 
827 aa  78.6  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.66 
 
 
870 aa  78.2  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.6 
 
 
781 aa  78.2  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.41 
 
 
1303 aa  78.2  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1560  response regulator, histidine kinase  29.43 
 
 
697 aa  78.2  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0213368  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  26.98 
 
 
1160 aa  78.2  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 
1155 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 
465 aa  77.8  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  26.49 
 
 
1356 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1714  ATP-binding region ATPase domain protein  26.62 
 
 
666 aa  77.8  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84327  hitchhiker  0.000293695 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2639  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 
396 aa  77.8  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.717158 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2257  GAF sensor hybrid histidine kinase  25.79 
 
 
1162 aa  77.8  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.73 
 
 
940 aa  77.4  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1599  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 
556 aa  77.8  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.928385  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.55 
 
 
725 aa  77.4  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.302229  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.21 
 
 
823 aa  77.4  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4079  sensor histidine kinase/response regulator  24.9 
 
 
1161 aa  77.4  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2415  PAS sensor protein  27.84 
 
 
810 aa  77.4  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1596  Diverse 7TM receptor transmembrane region  26.44 
 
 
660 aa  77.4  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.351374 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.03 
 
 
627 aa  77  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2221  Signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 
605 aa  77  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.763849  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.32 
 
 
862 aa  76.6  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 
587 aa  76.6  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03280  hybrid sensory histidine protein kinase  23.65 
 
 
957 aa  77  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.558043  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.94 
 
 
1480 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 
599 aa  75.9  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0970  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 
729 aa  76.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3009  histidine kinase  28 
 
 
603 aa  75.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3515  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 
627 aa  76.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.1939  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.42 
 
 
1323 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1998  ATP-binding region, ATPase-like protein  27.84 
 
 
856 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1193  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 
387 aa  76.6  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.257298  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5153  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.2 
 
 
1002 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437111  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0609  histidine kinase  26.94 
 
 
1016 aa  75.5  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.574226  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  27.56 
 
 
1170 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0265  sensor histidine kinase  26.51 
 
 
697 aa  75.9  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3285  ATP-binding region ATPase domain protein  29.66 
 
 
588 aa  75.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.255364 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3398  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  23.85 
 
 
1202 aa  75.5  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.613847  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1411  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.4 
 
 
673 aa  75.9  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352206  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.61 
 
 
974 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  29.93 
 
 
732 aa  75.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1216  histidine kinase  26.69 
 
 
441 aa  75.1  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2823  histidine kinase  25.91 
 
 
501 aa  75.1  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.69 
 
 
1163 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04304  two-component system sensor protein  27.17 
 
 
603 aa  74.7  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2080  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  26.32 
 
 
1158 aa  74.7  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.264996 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.88 
 
 
1155 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2759  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 
785 aa  74.7  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3453  GAF sensor signal transduction histidine kinase  21.83 
 
 
412 aa  74.7  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4096  histidine kinase  23.88 
 
 
604 aa  74.3  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005496 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.67 
 
 
1155 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.06 
 
 
1149 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  24.9 
 
 
1142 aa  74.3  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  24.8 
 
 
1111 aa  74.3  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5435  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 
737 aa  74.3  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.72924  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.3 
 
 
1029 aa  74.3  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.34 
 
 
1141 aa  74.3  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.27 
 
 
1452 aa  74.3  0.000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1353  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  24.53 
 
 
1197 aa  73.9  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.53 
 
 
1174 aa  74.3  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  25.2 
 
 
1323 aa  74.3  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 
1516 aa  73.9  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1944  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 
607 aa  73.9  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0645132 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>