More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2257 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 		 1203 aa  704    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1648  histidine kinase  36.96 
 
 		 1374 aa  653    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102759  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  35.26 
 
 		 1170 aa  649    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  35.42 
 
 		 1172 aa  655    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2257  GAF sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1162 aa  2380    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.6 
 
 		 1356 aa  671    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  45 
 
 		 1131 aa  905    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 1163 aa  640    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  35.26 
 
 		 1200 aa  652    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  35.39 
 
 		 1196 aa  645    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.17 
 
 		 1158 aa  655    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  37.53 
 
 		 1161 aa  718    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.39 
 
 		 1038 aa  644    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2080  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  37.45 
 
 		 1158 aa  696    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.264996 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.76 
 
 		 1149 aa  636    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.66 
 
 		 1201 aa  672    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.42 
 
 		 1155 aa  669    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.13 
 
 		 2107 aa  647    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.03 
 
 		 1168 aa  654    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 		 1159 aa  655    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.13 
 
 		 1155 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.27 
 
 		 1155 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 		 1195 aa  628  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.36 
 
 		 1155 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2642  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.19 
 
 		 1216 aa  628  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.974276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 		 1143 aa  626  1e-178  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  38 
 
 		 1954 aa  627  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 		 1917 aa  625  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3354  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 		 1189 aa  622  1e-176  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.426502  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  37.39 
 
 		 1137 aa  619  1e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 		 1142 aa  614  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.34 
 
 		 1177 aa  615  9.999999999999999e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.7 
 
 		 1137 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.35 
 
 		 1165 aa  610  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.985282 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3719  sensor histidine kinase  38.65 
 
 		 1278 aa  608  9.999999999999999e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 		 1141 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.32 
 
 		 1713 aa  601  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1960  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.93 
 
 		 1680 aa  597  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.0344276 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1216  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.3 
 
 		 1194 aa  598  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.469894 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5390  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.36 
 
 		 1195 aa  599  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596605  hitchhiker  0.00757911 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.84 
 
 		 1896 aa  593  1e-168  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.76 
 
 		 1145 aa  595  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.51 
 
 		 1936 aa  581  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1073  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 1158 aa  582  1e-164  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00830683  normal  0.406928 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.49 
 
 		 1937 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  37.39 
 
 		 1937 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.37 
 
 		 2099 aa  569  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 		 1937 aa  570  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0325  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.24 
 
 		 2037 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 		 1839 aa  561  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.58 
 
 		 2099 aa  559  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  36.94 
 
 		 1695 aa  547  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3548  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.88 
 
 		 1942 aa  540  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.42 
 
 		 1964 aa  539  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.370442 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1737  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.14 
 
 		 1037 aa  538  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476029  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 		 1857 aa  531  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1000  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 		 1161 aa  511  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5629  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.7 
 
 		 2010 aa  491  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.117507 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2473  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 1792 aa  469  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.98 
 
 		 1160 aa  450  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.1 
 
 		 1782 aa  418  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2112  Cache sensor hybrid histidine kinase  31.88 
 
 		 1361 aa  419  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 		 1237 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.11 
 
 		 1816 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  35.34 
 
 		 1392 aa  365  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0144  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 		 1119 aa  365  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1090  sensor histidine kinase/response regulator  29.59 
 
 		 896 aa  364  4e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.358618  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0932  sensor histidine kinase/response regulator  29.78 
 
 		 896 aa  363  1e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0996  sensor histidine kinase/response regulator  29.78 
 
 		 896 aa  363  1e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1037  sensor histidine kinase/response regulator  29.84 
 
 		 896 aa  363  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4266  sensor histidine kinase/response regulator  29.63 
 
 		 896 aa  362  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252034 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1163  sensor histidine kinase/response regulator  29.82 
 
 		 896 aa  362  3e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0900  sensor histidine kinase  29.44 
 
 		 896 aa  361  4e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1072  sensor histidine kinase/response regulator  29.85 
 
 		 896 aa  360  9e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.88167e-43 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0917  sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 896 aa  360  9.999999999999999e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0907  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.27 
 
 		 896 aa  357  6.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5091  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 		 1479 aa  348  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.493325  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2644  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 		 1303 aa  349  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229306  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6993  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 		 1159 aa  345  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.922616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0286  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 		 1406 aa  344  5e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4049  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.2 
 
 		 1406 aa  339  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2180  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.67 
 
 		 922 aa  335  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.238731  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0185  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.03 
 
 		 1214 aa  333  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467777  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0666  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.56 
 
 		 1400 aa  327  6e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.982341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3328  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 		 1482 aa  323  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1053  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.31 
 
 		 1458 aa  319  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  32.5 
 
 		 1361 aa  318  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.89 
 
 		 1362 aa  314  6.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 		 1853 aa  313  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3009  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 920 aa  309  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.59521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4253  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 		 1843 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4276  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 		 1847 aa  305  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1267  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.53 
 
 		 916 aa  303  9e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.69 
 
 		 1271 aa  301  4e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5202  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.7 
 
 		 1478 aa  300  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0874625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4117  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.97 
 
 		 1588 aa  298  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0887298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1943  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.3 
 
 		 1468 aa  297  8e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.37 
 
 		 1172 aa  296  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4523  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 		 1179 aa  296  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522992  decreased coverage  0.00180703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4103  ATPase domain-containing protein  32.83 
 
 		 1179 aa  279  3e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.972573  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>