More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5202 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3894  putative sensor histidine kinase  62.97 
 
 		 590 aa  646    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  55.09 
 
 		 1896 aa  1248    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  56.92 
 
 		 1816 aa  1306    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03340  protein-histidine kinase, putative  57.61 
 
 		 1390 aa  659    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.205996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  60.7 
 
 		 1392 aa  1647    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0286  GAF sensor hybrid histidine kinase  74.13 
 
 		 1406 aa  2061    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4253  GAF sensor hybrid histidine kinase  49.93 
 
 		 1843 aa  1278    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  56.13 
 
 		 1917 aa  1296    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4117  GAF sensor hybrid histidine kinase  60.3 
 
 		 1588 aa  1353    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0887298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2644  GAF sensor hybrid histidine kinase  60.57 
 
 		 1303 aa  1441    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229306  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  54.39 
 
 		 1839 aa  1228    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  57.02 
 
 		 1782 aa  1296    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  52.78 
 
 		 1853 aa  1176    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4049  GAF sensor hybrid histidine kinase  53.31 
 
 		 1406 aa  1318    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  50.59 
 
 		 1954 aa  1301    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  49.08 
 
 		 1937 aa  1227    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1943  GAF sensor hybrid histidine kinase  60.79 
 
 		 1468 aa  1343    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  55.04 
 
 		 1937 aa  1222    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4523  GAF sensor hybrid histidine kinase  54.35 
 
 		 1179 aa  1186    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522992  decreased coverage  0.00180703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6993  GAF sensor hybrid histidine kinase  60.65 
 
 		 1159 aa  1013    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.922616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1053  GAF sensor hybrid histidine kinase  55.09 
 
 		 1458 aa  1429    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  49.79 
 
 		 2107 aa  1241    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.32 
 
 		 1150 aa  817    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  55.64 
 
 		 2099 aa  1226    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  65.2 
 
 		 1857 aa  865    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  50.24 
 
 		 1964 aa  1288    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.370442 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3548  GAF sensor hybrid histidine kinase  49.65 
 
 		 1942 aa  1298    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4103  ATPase domain-containing protein  56.97 
 
 		 1179 aa  1030    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.972573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5091  GAF sensor hybrid histidine kinase  54.61 
 
 		 1479 aa  1419    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.493325  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  49.36 
 
 		 2099 aa  1228    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2473  GAF sensor hybrid histidine kinase  55.16 
 
 		 1792 aa  1221    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0144  GAF sensor hybrid histidine kinase  56.53 
 
 		 1119 aa  1220    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  54.79 
 
 		 1936 aa  1211    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0325  GAF sensor hybrid histidine kinase  48.32 
 
 		 2037 aa  1217    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  58.31 
 
 		 1695 aa  1210    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  53.66 
 
 		 1937 aa  1211    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0185  GAF sensor hybrid histidine kinase  56.54 
 
 		 1214 aa  1315    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467777  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3328  GAF sensor hybrid histidine kinase  57.13 
 
 		 1482 aa  1293    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0666  GAF sensor hybrid histidine kinase  54.24 
 
 		 1400 aa  1309    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.982341 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5629  GAF sensor hybrid histidine kinase  50.86 
 
 		 2010 aa  1285    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.117507 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5202  GAF sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1478 aa  2976    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0874625 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4276  GAF sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 		 1847 aa  1280    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04479  Histidine kinase J7 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ24]  61.42 
 
 		 1297 aa  620  1e-176  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930158  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2180  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.56 
 
 		 922 aa  531  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.238731  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3009  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 		 920 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.59521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73542  histidine kinase osmosensor  59.38 
 
 		 1118 aa  457  1e-127  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.69 
 
 		 1195 aa  423  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.87 
 
 		 1155 aa  416  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0907  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 		 896 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1267  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.77 
 
 		 916 aa  399  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  36.64 
 
 		 1137 aa  391  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.94 
 
 		 1713 aa  386  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.95 
 
 		 1137 aa  379  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 		 1163 aa  375  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  34.8 
 
 		 1170 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.12 
 
 		 1158 aa  374  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1960  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 		 1680 aa  372  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.0344276 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.8 
 
 		 1149 aa  373  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  35.08 
 
 		 1172 aa  367  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.65 
 
 		 1177 aa  365  3e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.12 
 
 		 1168 aa  362  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.37 
 
 		 1155 aa  362  3e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4266  sensor histidine kinase/response regulator  37.18 
 
 		 896 aa  359  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252034 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3719  sensor histidine kinase  31.38 
 
 		 1278 aa  355  5e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 		 1203 aa  353  8.999999999999999e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  37.15 
 
 		 1200 aa  353  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.76 
 
 		 1155 aa  353  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0932  sensor histidine kinase/response regulator  36.68 
 
 		 896 aa  352  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0996  sensor histidine kinase/response regulator  36.68 
 
 		 896 aa  352  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0917  sensor histidine kinase  36.86 
 
 		 896 aa  352  3e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0900  sensor histidine kinase  36.63 
 
 		 896 aa  352  3e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1090  sensor histidine kinase/response regulator  36.45 
 
 		 896 aa  352  4e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.358618  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1037  sensor histidine kinase/response regulator  36.67 
 
 		 896 aa  351  6e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1163  sensor histidine kinase/response regulator  36.68 
 
 		 896 aa  350  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1072  sensor histidine kinase/response regulator  36.45 
 
 		 896 aa  350  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.88167e-43 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2642  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.24 
 
 		 1216 aa  350  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.974276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.56 
 
 		 1155 aa  350  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1648  histidine kinase  32.7 
 
 		 1374 aa  348  5e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.7 
 
 		 1159 aa  347  8.999999999999999e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  38.69 
 
 		 1161 aa  346  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2080  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  38.43 
 
 		 1158 aa  344  8e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.264996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 		 1201 aa  343  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 		 1145 aa  342  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1073  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 1158 aa  342  2.9999999999999998e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00830683  normal  0.406928 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3354  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.89 
 
 		 1189 aa  340  1.9999999999999998e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.426502  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.52 
 
 		 1356 aa  338  3.9999999999999995e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  36.58 
 
 		 1196 aa  337  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5390  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 		 1195 aa  336  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596605  hitchhiker  0.00757911 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.53 
 
 		 1165 aa  335  6e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.985282 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.97 
 
 		 1141 aa  334  8e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.65 
 
 		 1038 aa  330  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1216  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 		 1194 aa  328  5e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.469894 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.97 
 
 		 1143 aa  323  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2112  Cache sensor hybrid histidine kinase  31.04 
 
 		 1361 aa  318  7e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1000  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.08 
 
 		 1161 aa  316  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.71 
 
 		 1131 aa  312  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2257  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.03 
 
 		 1162 aa  309  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.85 
 
 		 1142 aa  277  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1737  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.05 
 
 		 1037 aa  269  4e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476029  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1215  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  53.52 
 
 		 944 aa  263  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.960151  normal  0.101285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>