More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4103 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0144  GAF sensor hybrid histidine kinase  57.76 
 
 		 1119 aa  1190    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  52.16 
 
 		 2099 aa  1061    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  52.3 
 
 		 1896 aa  1057    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1943  GAF sensor hybrid histidine kinase  59.8 
 
 		 1468 aa  1097    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5202  GAF sensor hybrid histidine kinase  56.91 
 
 		 1478 aa  1043    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0874625 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 		 1964 aa  1070    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.370442 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6993  GAF sensor hybrid histidine kinase  57.56 
 
 		 1159 aa  1151    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.922616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0286  GAF sensor hybrid histidine kinase  56.38 
 
 		 1406 aa  1243    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  52.7 
 
 		 1917 aa  1130    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2644  GAF sensor hybrid histidine kinase  57.68 
 
 		 1303 aa  1276    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229306  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  51.87 
 
 		 1937 aa  1057    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3548  GAF sensor hybrid histidine kinase  50.67 
 
 		 1942 aa  1088    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5629  GAF sensor hybrid histidine kinase  52.76 
 
 		 2010 aa  1117    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.117507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  51.87 
 
 		 1937 aa  1055    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4103  ATPase domain-containing protein  100 
 
 		 1179 aa  2346    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.972573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0325  GAF sensor hybrid histidine kinase  50.34 
 
 		 2037 aa  1036    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  52.05 
 
 		 1853 aa  1092    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4049  GAF sensor hybrid histidine kinase  64.94 
 
 		 1406 aa  1188    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1053  GAF sensor hybrid histidine kinase  62.34 
 
 		 1458 aa  1338    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  51.94 
 
 		 1782 aa  1073    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  51.54 
 
 		 1954 aa  1103    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4276  GAF sensor hybrid histidine kinase  51.74 
 
 		 1847 aa  1093    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0185  GAF sensor hybrid histidine kinase  55.77 
 
 		 1214 aa  1238    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467777  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  51.4 
 
 		 2107 aa  1045    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  52.28 
 
 		 1839 aa  1069    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  53.45 
 
 		 1695 aa  1077    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  52.64 
 
 		 2099 aa  1065    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  57.2 
 
 		 1392 aa  1224    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4253  GAF sensor hybrid histidine kinase  52.13 
 
 		 1843 aa  1095    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0666  GAF sensor hybrid histidine kinase  64.84 
 
 		 1400 aa  1191    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.982341 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  54.19 
 
 		 1816 aa  1117    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3328  GAF sensor hybrid histidine kinase  58.24 
 
 		 1482 aa  1067    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  52.31 
 
 		 1937 aa  1068    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5091  GAF sensor hybrid histidine kinase  57.22 
 
 		 1479 aa  1195    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.493325  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  51.63 
 
 		 1936 aa  1053    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2473  GAF sensor hybrid histidine kinase  57.14 
 
 		 1792 aa  1022    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4523  GAF sensor hybrid histidine kinase  93.29 
 
 		 1179 aa  2166    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522992  decreased coverage  0.00180703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  57.67 
 
 		 1857 aa  1041    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4117  GAF sensor hybrid histidine kinase  58.85 
 
 		 1588 aa  1074    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0887298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3894  putative sensor histidine kinase  64.37 
 
 		 590 aa  630  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.96 
 
 		 1150 aa  602  1e-170  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2180  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.85 
 
 		 922 aa  530  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.238731  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1267  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.82 
 
 		 916 aa  527  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3009  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.03 
 
 		 920 aa  511  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.59521  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04479  Histidine kinase J7 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ24]  55.25 
 
 		 1297 aa  504  1e-141  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930158  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03340  protein-histidine kinase, putative  53.17 
 
 		 1390 aa  491  1e-137  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.205996  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 		 1155 aa  481  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1090  sensor histidine kinase/response regulator  37.04 
 
 		 896 aa  466  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.358618  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0917  sensor histidine kinase  36.9 
 
 		 896 aa  464  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.91 
 
 		 1195 aa  465  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1163  sensor histidine kinase/response regulator  36.78 
 
 		 896 aa  465  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0932  sensor histidine kinase/response regulator  36.76 
 
 		 896 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0900  sensor histidine kinase  36.95 
 
 		 896 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73542  histidine kinase osmosensor  57.01 
 
 		 1118 aa  461  9.999999999999999e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0996  sensor histidine kinase/response regulator  36.76 
 
 		 896 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4266  sensor histidine kinase/response regulator  36.99 
 
 		 896 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252034 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1072  sensor histidine kinase/response regulator  36.4 
 
 		 896 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.88167e-43 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0907  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.45 
 
 		 896 aa  459  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1037  sensor histidine kinase/response regulator  36.38 
 
 		 896 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1960  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.71 
 
 		 1680 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.0344276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2642  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.21 
 
 		 1216 aa  398  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.974276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 		 1713 aa  396  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.37 
 
 		 1168 aa  391  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.05 
 
 		 1163 aa  388  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 		 1158 aa  388  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  38.26 
 
 		 1137 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  36.52 
 
 		 1170 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.41 
 
 		 1177 aa  379  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  36.28 
 
 		 1172 aa  379  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 		 1155 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  35.92 
 
 		 1161 aa  379  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.63 
 
 		 1137 aa  375  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 1356 aa  376  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 		 1145 aa  375  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1648  histidine kinase  33.86 
 
 		 1374 aa  373  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102759  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.57 
 
 		 1155 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.57 
 
 		 1155 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2080  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  34.96 
 
 		 1158 aa  370  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.264996 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.98 
 
 		 1149 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 1203 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  33.71 
 
 		 1196 aa  369  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1215  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  46.84 
 
 		 944 aa  368  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.960151  normal  0.101285 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  34.78 
 
 		 1200 aa  367  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1073  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 1158 aa  364  5.0000000000000005e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00830683  normal  0.406928 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.19 
 
 		 1201 aa  362  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.63 
 
 		 1141 aa  356  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.32 
 
 		 1143 aa  354  7e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 		 1159 aa  353  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3719  sensor histidine kinase  32.02 
 
 		 1278 aa  350  1e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1216  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 		 1194 aa  336  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.469894 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.8 
 
 		 1038 aa  333  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 		 1165 aa  332  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.985282 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5390  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.95 
 
 		 1195 aa  331  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596605  hitchhiker  0.00757911 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3354  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.3 
 
 		 1189 aa  331  6e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.426502  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.39 
 
 		 1131 aa  329  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4386  histidine kinase  45.87 
 
 		 411 aa  314  5.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1000  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.84 
 
 		 1161 aa  305  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1737  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 		 1037 aa  305  5.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476029  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.48 
 
 		 1142 aa  302  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2257  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 		 1162 aa  296  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>