More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3894 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0325  GAF sensor hybrid histidine kinase  73.26 
 
 		 2037 aa  756    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  76.42 
 
 		 1954 aa  788    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  73.96 
 
 		 1937 aa  771    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  87.36 
 
 		 2099 aa  920    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  87.36 
 
 		 1857 aa  915    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0286  GAF sensor hybrid histidine kinase  64.15 
 
 		 1406 aa  664    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4117  GAF sensor hybrid histidine kinase  66.6 
 
 		 1588 aa  668    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0887298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5629  GAF sensor hybrid histidine kinase  75.05 
 
 		 2010 aa  767    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.117507 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  75.66 
 
 		 1917 aa  783    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  86.42 
 
 		 1839 aa  908    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3894  putative sensor histidine kinase  100 
 
 		 590 aa  1164    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3328  GAF sensor hybrid histidine kinase  64.66 
 
 		 1482 aa  638    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  63.52 
 
 		 1392 aa  644    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  67.11 
 
 		 1853 aa  702    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4049  GAF sensor hybrid histidine kinase  67.74 
 
 		 1406 aa  692    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1943  GAF sensor hybrid histidine kinase  65.85 
 
 		 1468 aa  660    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  87.17 
 
 		 2099 aa  921    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1053  GAF sensor hybrid histidine kinase  62.71 
 
 		 1458 aa  645    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  74.53 
 
 		 1936 aa  778    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3548  GAF sensor hybrid histidine kinase  75.28 
 
 		 1942 aa  790    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5091  GAF sensor hybrid histidine kinase  68.12 
 
 		 1479 aa  676    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.493325  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  73.58 
 
 		 1782 aa  757    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.65 
 
 		 1150 aa  663    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0666  GAF sensor hybrid histidine kinase  67.42 
 
 		 1400 aa  689    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.982341 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5202  GAF sensor hybrid histidine kinase  62.97 
 
 		 1478 aa  646    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0874625 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  78.23 
 
 		 1695 aa  703    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2473  GAF sensor hybrid histidine kinase  81.32 
 
 		 1792 aa  830    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  73.96 
 
 		 1964 aa  776    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.370442 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  73.77 
 
 		 1816 aa  765    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  73.77 
 
 		 1937 aa  770    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4253  GAF sensor hybrid histidine kinase  66.73 
 
 		 1843 aa  699    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4276  GAF sensor hybrid histidine kinase  66.73 
 
 		 1847 aa  699    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  75.47 
 
 		 1896 aa  786    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  74.15 
 
 		 1937 aa  778    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2644  GAF sensor hybrid histidine kinase  66.2 
 
 		 1303 aa  632  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229306  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4523  GAF sensor hybrid histidine kinase  63.77 
 
 		 1179 aa  624  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522992  decreased coverage  0.00180703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4103  ATPase domain-containing protein  64.37 
 
 		 1179 aa  618  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.972573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  63.58 
 
 		 2107 aa  621  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6993  GAF sensor hybrid histidine kinase  71.82 
 
 		 1159 aa  556  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.922616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0185  GAF sensor hybrid histidine kinase  59.07 
 
 		 1214 aa  555  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467777  normal  0.706209 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04479  Histidine kinase J7 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ24]  63.31 
 
 		 1297 aa  545  1e-154  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930158  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03340  protein-histidine kinase, putative  57.61 
 
 		 1390 aa  542  1e-153  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.205996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0144  GAF sensor hybrid histidine kinase  68.47 
 
 		 1119 aa  529  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73542  histidine kinase osmosensor  58.88 
 
 		 1118 aa  445  1.0000000000000001e-124  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0016  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  23.18 
 
 		 1009 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0724205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0951  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.22 
 
 		 1332 aa  136  9e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.514754  normal  0.661078 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1248  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.65 
 
 		 981 aa  130  7.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0010  putative PAS/PAC sensor protein  22.34 
 
 		 750 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0248614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2942  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.03 
 
 		 1049 aa  107  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.04 
 
 		 1048 aa  107  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0818053 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1577  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  81.67 
 
 		 226 aa  102  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.062462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1002  methyl-accepting chemotaxis protein-like protein  22.2 
 
 		 1100 aa  99  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2100  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  78.33 
 
 		 226 aa  97.4  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.58 
 
 		 231 aa  94.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1710  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  21.13 
 
 		 1355 aa  92.8  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0356  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.86 
 
 		 725 aa  87.4  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7587  short chain dehydrogenase  68.97 
 
 		 241 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2945  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.91 
 
 		 780 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1733  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.75 
 
 		 823 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7169  short chain dehydrogenase  66.1 
 
 		 233 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.934383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2944  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 		 780 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65 
 
 		 227 aa  85.1  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1707  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.09 
 
 		 1016 aa  85.1  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.52 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.874533  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.85 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.379017  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0369  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.1 
 
 		 725 aa  84.7  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2142  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.07 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.540844  normal  0.912393 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.93 
 
 		 236 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.34 
 
 		 234 aa  83.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.114405  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.32 
 
 		 905 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.52 
 
 		 233 aa  82.4  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0457321 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.16 
 
 		 693 aa  82.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.776731  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2483  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.6 
 
 		 905 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.611307  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.57 
 
 		 236 aa  81.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3805  short chain dehydrogenase  63.33 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132901  hitchhiker  0.00346902 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3278  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.17 
 
 		 880 aa  80.9  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0350486  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.07 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0911  short chain dehydrogenase  60 
 
 		 237 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0583  putative short-chain dehydrogenase/reductase  63.33 
 
 		 231 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00177948  normal  0.463308 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.71 
 
 		 236 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.199135  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4701  short chain dehydrogenase  61.67 
 
 		 237 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.71 
 
 		 235 aa  78.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0777  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.99 
 
 		 712 aa  78.6  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4179  short chain dehydrogenase  61.67 
 
 		 237 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0383999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.71 
 
 		 233 aa  78.6  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000124511  unclonable  0.0000000105469 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0574  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.18 
 
 		 815 aa  77.8  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.32 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.419442  unclonable  0.00000816972 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3568  short chain dehydrogenase  60 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0488562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4799  short chain dehydrogenase  60 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5484  short chain dehydrogenase  60 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.485941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.07 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.32 
 
 		 236 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0110746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.32 
 
 		 232 aa  76.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0110624  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1735  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.6 
 
 		 868 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.38 
 
 		 235 aa  76.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3805  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.32 
 
 		 235 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.63 
 
 		 569 aa  74.3  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3589  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.07 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.24 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1895  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.75 
 
 		 231 aa  72  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.194823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>