More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4701 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4701  short chain dehydrogenase  100 
 
 
237 aa  460  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0911  short chain dehydrogenase  91.98 
 
 
237 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4179  short chain dehydrogenase  97.46 
 
 
237 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0383999  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5484  short chain dehydrogenase  94.94 
 
 
237 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.485941 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3568  short chain dehydrogenase  94.94 
 
 
237 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0488562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4799  short chain dehydrogenase  94.94 
 
 
237 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3805  short chain dehydrogenase  83.12 
 
 
237 aa  359  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132901  hitchhiker  0.00346902 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7169  short chain dehydrogenase  62.5 
 
 
233 aa  280  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.934383 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2100  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  60.78 
 
 
226 aa  232  3e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1577  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  56.03 
 
 
226 aa  229  4e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.062462  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.84 
 
 
227 aa  218  7.999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70124  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0583  putative short-chain dehydrogenase/reductase  52.14 
 
 
231 aa  208  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00177948  normal  0.463308 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.28 
 
 
231 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.87 
 
 
225 aa  193  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.379017  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7587  short chain dehydrogenase  49.35 
 
 
241 aa  184  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.9 
 
 
233 aa  180  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0457321 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 
234 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.24 
 
 
234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2142  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.83 
 
 
228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.540844  normal  0.912393 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3589  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.74 
 
 
246 aa  159  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377487  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1898  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.57 
 
 
222 aa  159  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.214682  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 
237 aa  155  7e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.874533  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  45.45 
 
 
1695 aa  154  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.95 
 
 
237 aa  151  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.419442  unclonable  0.00000816972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.35 
 
 
235 aa  148  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.35 
 
 
234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.114405  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.3 
 
 
233 aa  143  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000124511  unclonable  0.0000000105469 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3805  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.16 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472868  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.39 
 
 
236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0110746 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.51 
 
 
236 aa  135  7.000000000000001e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.239235  normal  0.254296 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134822  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2978  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.24 
 
 
237 aa  129  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.233429  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1895  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.18 
 
 
231 aa  125  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.71 
 
 
235 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0025  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.23 
 
 
232 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.85 
 
 
236 aa  118  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.94 
 
 
235 aa  118  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  36.18 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.91 
 
 
236 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3439  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.84 
 
 
229 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000413272 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 
250 aa  114  8.999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3195  amino acid adenylation domain-containing protein  32.87 
 
 
2031 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1607  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000319104  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.6 
 
 
236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.199135  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0110624  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11468  acetoin(diacetyl)reductase  31.3 
 
 
254 aa  112  7.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0328388  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.95 
 
 
268 aa  111  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1487  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.18 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
248 aa  109  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.057049  hitchhiker  0.000702749 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.95 
 
 
247 aa  109  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2122  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.89 
 
 
245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000118784  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 
256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
247 aa  108  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0708885  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0934  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.02 
 
 
247 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00491532  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 
252 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.22334  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1421  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.92 
 
 
251 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002996  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  33.33 
 
 
245 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000487281  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  32.1 
 
 
252 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.8 
 
 
255 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.22 
 
 
245 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.93 
 
 
247 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2462  short chain dehydrogenase  33.61 
 
 
254 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.131471  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
254 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
254 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0922  Short-chain alcohol dehydrogenase  30.74 
 
 
256 aa  106  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000799282  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.95 
 
 
247 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1189  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
258 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.169392  normal  0.557089 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
249 aa  105  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000373028  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0994  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.38 
 
 
248 aa  105  5e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.931337 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6018  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.4 
 
 
247 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
249 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1572  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.41 
 
 
259 aa  105  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0426  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
253 aa  104  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0324644 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.25 
 
 
246 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1609  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.51 
 
 
246 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.481338 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0877  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 
251 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.795083  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2157  acetoacetyl-CoA reductase  30.74 
 
 
264 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722529  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.73 
 
 
292 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3166  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.13 
 
 
266 aa  104  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2771  acetoacetyl-CoA reductase  30.74 
 
 
264 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000395  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  30.67 
 
 
252 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.36672  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2860  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.48 
 
 
258 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0187623  normal  0.981149 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4500  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.08 
 
 
258 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0782266 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0621  hypothetical protein  29.34 
 
 
248 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.25 
 
 
249 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 
262 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32 
 
 
246 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.98 
 
 
246 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02908  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
245 aa  104  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 
260 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4854  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
236 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0657212  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0657  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.34 
 
 
292 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.65557 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1608  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.06 
 
 
244 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000263068  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.87 
 
 
266 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0957  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
248 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6555  acetoacetyl-CoA reductase  30.58 
 
 
247 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.49 
 
 
275 aa  102  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115875  normal  0.134088 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 
246 aa  102  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00117266  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.8 
 
 
246 aa  102  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>