More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3589 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3589  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
246 aa  498  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377487  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.44 
 
 
234 aa  260  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.64 
 
 
234 aa  249  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.36 
 
 
233 aa  242  3.9999999999999997e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0457321 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.12 
 
 
237 aa  211  7.999999999999999e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.874533  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.41 
 
 
234 aa  199  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.114405  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2142  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.17 
 
 
228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.540844  normal  0.912393 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4854  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.59 
 
 
236 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0657212  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4813  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.58 
 
 
239 aa  162  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.246184  normal  0.864959 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.13 
 
 
231 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1577  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.35 
 
 
226 aa  159  3e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.062462  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.54 
 
 
235 aa  156  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7169  short chain dehydrogenase  41.23 
 
 
233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.934383 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2100  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.61 
 
 
226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5484  short chain dehydrogenase  41.74 
 
 
237 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.485941 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3568  short chain dehydrogenase  41.74 
 
 
237 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0488562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4799  short chain dehydrogenase  41.74 
 
 
237 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.33 
 
 
225 aa  149  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.379017  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.97 
 
 
227 aa  148  9e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70124  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3805  short chain dehydrogenase  41.23 
 
 
237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132901  hitchhiker  0.00346902 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4701  short chain dehydrogenase  41.74 
 
 
237 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0583  putative short-chain dehydrogenase/reductase  40.97 
 
 
231 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00177948  normal  0.463308 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0911  short chain dehydrogenase  40.43 
 
 
237 aa  144  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.53 
 
 
235 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4179  short chain dehydrogenase  42.11 
 
 
237 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0383999  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 
237 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.419442  unclonable  0.00000816972 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3805  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
235 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472868  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1898  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
222 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.214682  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.62 
 
 
236 aa  132  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0110746 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
235 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134822  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7587  short chain dehydrogenase  39.65 
 
 
241 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 
236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.239235  normal  0.254296 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.81 
 
 
233 aa  120  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000124511  unclonable  0.0000000105469 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
236 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0641  short chain dehydrogenase  37.39 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.71 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
268 aa  118  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.7 
 
 
240 aa  116  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 
236 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 
248 aa  115  5e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3319  d-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.68 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0697406  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000516058  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0934  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.56 
 
 
247 aa  112  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00491532  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 
255 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000170009  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03190  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  31.69 
 
 
255 aa  112  8.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2978  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.77 
 
 
237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.233429  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.9 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.382394  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 
246 aa  110  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0105  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.42 
 
 
248 aa  110  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 
236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.199135  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.2 
 
 
246 aa  109  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1895  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.73 
 
 
231 aa  109  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  33.61 
 
 
252 aa  109  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0025  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.17 
 
 
232 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
258 aa  108  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0659  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.08 
 
 
245 aa  108  7.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.372694  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.2 
 
 
246 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.77 
 
 
239 aa  108  7.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2462  short chain dehydrogenase  32.08 
 
 
254 aa  108  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.131471  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0922  Short-chain alcohol dehydrogenase  29.17 
 
 
256 aa  108  8.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000799282  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.76 
 
 
248 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0489  sorbitol dehydrogenase  32.18 
 
 
260 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000937678  hitchhiker  0.00159634 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 
249 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00384997  hitchhiker  0.000208801 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08163  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G02870)  30.17 
 
 
251 aa  107  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.132741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4730  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.42 
 
 
261 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1671  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.34 
 
 
246 aa  107  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1074  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.63 
 
 
249 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5197  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.42 
 
 
261 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.426896 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1089  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.67 
 
 
244 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.319271  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3132  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.64 
 
 
258 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0908587  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5269  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.42 
 
 
261 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000395  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  30.71 
 
 
252 aa  106  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.36672  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
295 aa  106  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00920  short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  36.02 
 
 
295 aa  106  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2910  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.63 
 
 
249 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26924  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0999  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.47 
 
 
249 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1671  Short-chain alcohol dehydrogenase  28.75 
 
 
260 aa  106  3e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.321944  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 
269 aa  106  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.368434  normal  0.604753 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 
247 aa  106  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2122  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.12 
 
 
245 aa  106  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000118784  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 
254 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.29 
 
 
260 aa  105  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0232  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  30.67 
 
 
251 aa  105  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1003  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.47 
 
 
249 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.7 
 
 
242 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00246779  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.58 
 
 
251 aa  105  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.612185 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0826  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 
253 aa  105  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0978902  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0458  short chain dehydrogenase  31.4 
 
 
256 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 
252 aa  105  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2073  short chain dehydrogenase  31.4 
 
 
256 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.844507  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1811  short chain dehydrogenase  31.4 
 
 
256 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.780661  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1100  short chain dehydrogenase  31.4 
 
 
256 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1794  short chain dehydrogenase  31.4 
 
 
256 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.503189  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 
257 aa  105  8e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.42 
 
 
247 aa  105  8e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0363  short chain dehydrogenase  31.4 
 
 
256 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0809  short chain dehydrogenase  31.4 
 
 
256 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>