More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2682 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
236 aa  472  1e-132  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.239235  normal  0.254296 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.97 
 
 
240 aa  322  3e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.76 
 
 
244 aa  310  9e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134822  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2978  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.44 
 
 
237 aa  303  1.0000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.233429  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 
237 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.874533  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2142  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.5 
 
 
228 aa  161  9e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.540844  normal  0.912393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 
237 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.419442  unclonable  0.00000816972 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.93 
 
 
234 aa  153  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.114405  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.41 
 
 
233 aa  149  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0457321 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.72 
 
 
234 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
236 aa  142  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0110746 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7169  short chain dehydrogenase  39.74 
 
 
233 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.934383 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.92 
 
 
234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2100  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40 
 
 
226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.64 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1577  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.83 
 
 
226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.062462  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3589  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.33 
 
 
246 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377487  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.17 
 
 
231 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.18 
 
 
233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000124511  unclonable  0.0000000105469 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0911  short chain dehydrogenase  41.32 
 
 
237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.48 
 
 
227 aa  120  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70124  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1898  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 
222 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.214682  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5484  short chain dehydrogenase  40.5 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.485941 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3568  short chain dehydrogenase  40.5 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0488562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4799  short chain dehydrogenase  40.5 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.65 
 
 
246 aa  120  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3805  short chain dehydrogenase  40.91 
 
 
237 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132901  hitchhiker  0.00346902 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.65 
 
 
246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4179  short chain dehydrogenase  41.32 
 
 
237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0383999  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
225 aa  116  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.379017  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0025  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.23 
 
 
232 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6322  putative short-chain dehydrogenase  30.99 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72840  putative short-chain dehydrogenase  30.99 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118155  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0110624  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4701  short chain dehydrogenase  40.59 
 
 
237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.62 
 
 
236 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1946  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.71 
 
 
262 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1895  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7587  short chain dehydrogenase  35.65 
 
 
241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0583  putative short-chain dehydrogenase/reductase  35.53 
 
 
231 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00177948  normal  0.463308 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 
236 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
282 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  30.08 
 
 
236 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
269 aa  107  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
246 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
255 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
240 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76943  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 
254 aa  106  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 
235 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.75 
 
 
254 aa  105  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.54 
 
 
244 aa  106  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
262 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11468  acetoin(diacetyl)reductase  30.36 
 
 
254 aa  105  7e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0328388  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3149  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
240 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 
258 aa  105  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143319  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.51 
 
 
248 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
273 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19021  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
254 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1861  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
268 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651686  normal  0.848972 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0105  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.92 
 
 
248 aa  103  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 
240 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0723888  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  34.54 
 
 
257 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
254 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3432  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 
269 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115705  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
256 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.2 
 
 
251 aa  103  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3076  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  33.06 
 
 
253 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  32.38 
 
 
249 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.51 
 
 
239 aa  102  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 
240 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5134  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.53 
 
 
240 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.819971  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 
255 aa  102  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.53 
 
 
240 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3439  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.8 
 
 
229 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000413272 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.58 
 
 
257 aa  102  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.23 
 
 
250 aa  102  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.991261  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.7 
 
 
280 aa  101  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4929  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
270 aa  101  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212781  normal  0.926969 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 
252 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1487  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
231 aa  101  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
255 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00276657  normal  0.102342 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3805  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 
235 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472868  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 
251 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3366  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 
249 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00125321  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.55 
 
 
255 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.36 
 
 
236 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.199135  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.02 
 
 
261 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.372057  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
245 aa  100  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 
261 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3710  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 
262 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.583089  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
251 aa  99.4  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.37 
 
 
252 aa  99.4  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.27 
 
 
261 aa  99  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
281 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223454  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0030  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  28.51 
 
 
245 aa  98.6  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.39 
 
 
261 aa  98.6  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2226  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.58 
 
 
261 aa  98.6  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121072  hitchhiker  0.00000459382 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
253 aa  98.6  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 
244 aa  98.6  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5100  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR family protein  30.61 
 
 
261 aa  98.2  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.917841  normal  0.678944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>