More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5783 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
232 aa  452  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0110624  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.98 
 
 
237 aa  169  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.419442  unclonable  0.00000816972 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.03 
 
 
244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134822  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
240 aa  151  8e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2142  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 
228 aa  149  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.540844  normal  0.912393 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.04 
 
 
236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0110746 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.17 
 
 
235 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.26 
 
 
233 aa  138  8.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000124511  unclonable  0.0000000105469 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.87 
 
 
233 aa  137  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0457321 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2978  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.233429  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.34 
 
 
236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0025  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.86 
 
 
232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.24 
 
 
237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.874533  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 
234 aa  125  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1895  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.31 
 
 
231 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7169  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 
233 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.934383 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.65 
 
 
234 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.89 
 
 
231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.33 
 
 
236 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.1 
 
 
236 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.239235  normal  0.254296 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0583  putative short-chain dehydrogenase/reductase  37.66 
 
 
231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00177948  normal  0.463308 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
236 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.199135  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.91 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.114405  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3439  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.78 
 
 
229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000413272 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1898  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.12 
 
 
222 aa  113  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.214682  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2100  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.91 
 
 
226 aa  112  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3589  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 
246 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377487  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1577  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.86 
 
 
226 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.062462  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 
250 aa  105  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal  0.103076 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1487  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.94 
 
 
231 aa  104  9e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.61 
 
 
250 aa  104  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553116  normal  0.644711 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.08 
 
 
235 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3805  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.08 
 
 
235 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472868  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 
268 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0911  short chain dehydrogenase  36.71 
 
 
237 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.29 
 
 
225 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.379017  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7587  short chain dehydrogenase  39.22 
 
 
241 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.11 
 
 
229 aa  102  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3805  short chain dehydrogenase  39.74 
 
 
237 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132901  hitchhiker  0.00346902 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 
250 aa  99.4  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.42 
 
 
227 aa  98.6  7e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70124  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.3 
 
 
246 aa  96.7  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5484  short chain dehydrogenase  35.65 
 
 
237 aa  95.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.485941 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3568  short chain dehydrogenase  35.65 
 
 
237 aa  95.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0488562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4799  short chain dehydrogenase  35.65 
 
 
237 aa  95.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4701  short chain dehydrogenase  35.65 
 
 
237 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4854  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.97 
 
 
236 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0657212  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4179  short chain dehydrogenase  35.78 
 
 
237 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0383999  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
253 aa  94  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1958  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
251 aa  91.7  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.10898 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0047  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.11 
 
 
277 aa  91.7  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3393  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.8 
 
 
252 aa  91.7  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 
277 aa  90.1  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
243 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0160173  normal  0.32816 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 
256 aa  90.5  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
248 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.23 
 
 
251 aa  90.1  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 
254 aa  89  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 
254 aa  89  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2807  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 
253 aa  89  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.42 
 
 
269 aa  89.4  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11970  short-chain type dehydrogenase/reductase  28.15 
 
 
256 aa  89  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.675496  normal  0.543432 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.51 
 
 
253 aa  89  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237012  normal  0.451819 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3160  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 
248 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.328176  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.53 
 
 
255 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.556744  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.51 
 
 
293 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7112  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.91 
 
 
248 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.912642 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 
240 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0400117  normal  0.51074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1972  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.34 
 
 
255 aa  87  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336427  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 
240 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4826  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 
244 aa  87  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.806753 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 
240 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  32.66 
 
 
253 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.27 
 
 
246 aa  85.9  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.78 
 
 
279 aa  85.5  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 
262 aa  85.1  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
251 aa  85.1  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.379199  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.98 
 
 
257 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6281  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 
242 aa  85.1  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 
246 aa  85.1  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
253 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 
235 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5123  acetoacetyl-CoA reductase  27.71 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 
282 aa  84.7  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.451543 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0538  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.65 
 
 
265 aa  84  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.24 
 
 
246 aa  84  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2058  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 
246 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 
250 aa  84  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.31 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.432409 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.55 
 
 
245 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.75 
 
 
253 aa  84  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0050  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.55 
 
 
245 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.795595  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
233 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981974  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.42 
 
 
248 aa  83.2  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.4 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0601767 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164277  normal  0.032162 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 
288 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.207761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>