More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6909 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 231 aa  454  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7169  short chain dehydrogenase  55.95 
 
 		 233 aa  239  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.934383 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3805  short chain dehydrogenase  55.9 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132901  hitchhiker  0.00346902 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.87 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.379017  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.87 
 
 		 227 aa  205  4e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0911  short chain dehydrogenase  53.71 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1577  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  53.25 
 
 		 226 aa  202  5e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.062462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2100  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.75 
 
 		 226 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7587  short chain dehydrogenase  53.91 
 
 		 241 aa  198  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0583  putative short-chain dehydrogenase/reductase  51.09 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00177948  normal  0.463308 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3568  short chain dehydrogenase  53.71 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0488562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4799  short chain dehydrogenase  53.71 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5484  short chain dehydrogenase  53.71 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.485941 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4179  short chain dehydrogenase  54.59 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0383999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4701  short chain dehydrogenase  53.28 
 
 		 237 aa  185  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0457321 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 		 237 aa  169  4e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.874533  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.3 
 
 		 234 aa  168  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1898  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.25 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.214682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3589  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.13 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2142  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.540844  normal  0.912393 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.95 
 
 		 234 aa  159  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 		 234 aa  158  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.114405  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.88 
 
 		 237 aa  142  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.419442  unclonable  0.00000816972 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.74 
 
 		 240 aa  142  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.81 
 
 		 235 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3805  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.77 
 
 		 235 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2978  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.233429  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.5 
 
 		 236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0110746 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.5 
 
 		 236 aa  132  5e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.239235  normal  0.254296 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 		 244 aa  128  8.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134822  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  43.23 
 
 		 1695 aa  124  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.37 
 
 		 233 aa  123  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000124511  unclonable  0.0000000105469 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4854  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 236 aa  119  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0657212  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1895  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.14 
 
 		 231 aa  118  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0025  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.18 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 		 235 aa  115  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3439  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.66 
 
 		 229 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000413272 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 		 236 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  32.49 
 
 		 252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.49 
 
 		 249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.59 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0110624  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.24 
 
 		 261 aa  108  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.06 
 
 		 246 aa  108  9.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7112  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 		 248 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.912642 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4929  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212781  normal  0.926969 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1487  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.62 
 
 		 231 aa  106  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5342  acetoacetyl-CoA reductase  33.88 
 
 		 251 aa  106  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2495  short chain dehydrogenase  38.11 
 
 		 256 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1308  short chain dehydrogenase  38.11 
 
 		 256 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.480054  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0458  short chain dehydrogenase  32.65 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6322  putative short-chain dehydrogenase  31.67 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0809  short chain dehydrogenase  32.65 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1811  short chain dehydrogenase  32.65 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.780661  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1609  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.33 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.481338 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1794  short chain dehydrogenase  32.65 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.503189  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7123  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1817  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 337 aa  104  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0363  short chain dehydrogenase  32.65 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2073  short chain dehydrogenase  32.65 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.844507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72840  putative short-chain dehydrogenase  31.67 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1100  short chain dehydrogenase  32.65 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1101  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.6 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.845922 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0594  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.512344  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1335  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0973  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1235  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0318  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.594764  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2058  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.64 
 
 		 246 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4528  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2157  acetoacetyl-CoA reductase  32.24 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722529  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.71 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2771  acetoacetyl-CoA reductase  32.24 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4137  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.2 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.85 
 
 		 256 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.12 
 
 		 236 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.199135  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 		 246 aa  102  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3123  acetoacetyl-CoA reductase  30.61 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.14 
 
 		 229 aa  102  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.71 
 
 		 246 aa  102  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22780  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  30.83 
 
 		 251 aa  102  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.503497 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.71 
 
 		 251 aa  102  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 		 249 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4084  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.4 
 
 		 262 aa  101  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3941  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.4 
 
 		 258 aa  101  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4249  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.4 
 
 		 258 aa  101  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2823  acetoacetyl-CoA reductase  31.02 
 
 		 247 aa  101  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3768  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.33 
 
 		 278 aa  101  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4051  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.4 
 
 		 258 aa  101  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0435  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.33 
 
 		 250 aa  101  9e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.137022  normal  0.193907 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2690  acetoacetyl-CoA reductase  31.43 
 
 		 247 aa  101  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685514  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.45 
 
 		 266 aa  101  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7060  short chain dehydrogenase  35.39 
 
 		 255 aa  101  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0664  cylG protein  29.54 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 		 233 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.929403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4157  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.4 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>