More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1577 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1577  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  100 
 
 
226 aa  438  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.062462  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2100  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  85.4 
 
 
226 aa  343  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.95 
 
 
227 aa  226  3e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70124  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7169  short chain dehydrogenase  53.48 
 
 
233 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.934383 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  65.7 
 
 
1695 aa  218  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0911  short chain dehydrogenase  55.17 
 
 
237 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3805  short chain dehydrogenase  55.17 
 
 
237 aa  209  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132901  hitchhiker  0.00346902 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3568  short chain dehydrogenase  56.47 
 
 
237 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0488562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4799  short chain dehydrogenase  56.47 
 
 
237 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5484  short chain dehydrogenase  56.47 
 
 
237 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.485941 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4701  short chain dehydrogenase  56.03 
 
 
237 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4179  short chain dehydrogenase  55.6 
 
 
237 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0383999  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.25 
 
 
231 aa  194  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7587  short chain dehydrogenase  52.63 
 
 
241 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.09 
 
 
225 aa  188  5.999999999999999e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.379017  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.62 
 
 
234 aa  175  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.72 
 
 
233 aa  174  8e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0457321 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0583  putative short-chain dehydrogenase/reductase  52.23 
 
 
231 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00177948  normal  0.463308 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.19 
 
 
234 aa  168  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.17 
 
 
234 aa  166  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.114405  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3589  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.23 
 
 
246 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377487  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1898  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.76 
 
 
222 aa  160  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.214682  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.48 
 
 
237 aa  160  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.874533  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2142  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.16 
 
 
228 aa  151  8e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.540844  normal  0.912393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.13 
 
 
237 aa  148  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.419442  unclonable  0.00000816972 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 
240 aa  147  9e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.35 
 
 
235 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.66 
 
 
244 aa  134  8e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134822  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.95 
 
 
236 aa  132  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.239235  normal  0.254296 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.02 
 
 
236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0110746 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3805  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.61 
 
 
235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472868  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.43 
 
 
233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000124511  unclonable  0.0000000105469 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2978  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.63 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.233429  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.66 
 
 
235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1895  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.15 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4854  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.87 
 
 
236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0657212  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.67 
 
 
235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 
229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
247 aa  108  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.38 
 
 
264 aa  108  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3439  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.67 
 
 
229 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000413272 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 
246 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.05 
 
 
232 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0110624  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.71 
 
 
236 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24990  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  34.58 
 
 
257 aa  106  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.54 
 
 
254 aa  105  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11020  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.15 
 
 
253 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 
250 aa  105  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
246 aa  105  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 
248 aa  105  6e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3432  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
269 aa  105  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115705  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0435  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.79 
 
 
250 aa  105  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.137022  normal  0.193907 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
262 aa  104  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3549  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  33.9 
 
 
248 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 
254 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.38 
 
 
236 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.199135  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.1 
 
 
262 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351696  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.09 
 
 
246 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.38 
 
 
255 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 
254 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6298  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 
271 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.1246  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 
262 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.75 
 
 
246 aa  103  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
280 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1474  short chain dehydrogenase  35.74 
 
 
262 aa  102  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0346872  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  34.84 
 
 
253 aa  102  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.38 
 
 
252 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3894  putative sensor histidine kinase  81.67 
 
 
590 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0025  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.7 
 
 
232 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1487  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
231 aa  102  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 
246 aa  102  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.75 
 
 
246 aa  102  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.09 
 
 
239 aa  101  8e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0922  Short-chain alcohol dehydrogenase  30.86 
 
 
256 aa  101  8e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000799282  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  32.8 
 
 
261 aa  101  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
261 aa  101  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2748  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.07 
 
 
250 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 
253 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1043  acetoacetyl-CoA reductase  32.65 
 
 
247 aa  100  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.8589  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.85 
 
 
258 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
266 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22780  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  30.86 
 
 
251 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.503497 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
255 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 
267 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3078  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
255 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.485877  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1857  glucose 1-dehydrogenase, putative  34 
 
 
261 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.637675  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19210  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.39 
 
 
243 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0731595  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
255 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.746696  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
258 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
246 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  0.189586 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 
261 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0579067  normal  0.028281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
246 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.772329 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4500  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.18 
 
 
258 aa  99.8  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0782266 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2226  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
261 aa  99.8  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121072  hitchhiker  0.00000459382 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
257 aa  99.8  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3132  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.27 
 
 
258 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0908587  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
252 aa  99.8  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 
249 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1682  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.25 
 
 
260 aa  99.4  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>