More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4122 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1943  GAF sensor hybrid histidine kinase  60.75 
 
 
1468 aa  1362    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0325  GAF sensor hybrid histidine kinase  57.25 
 
 
2037 aa  1851    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  62.47 
 
 
1816 aa  1813    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03340  protein-histidine kinase, putative  60.32 
 
 
1390 aa  692    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.205996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  54.77 
 
 
1392 aa  1392    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0666  GAF sensor hybrid histidine kinase  59.34 
 
 
1400 aa  1165    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.982341 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3548  GAF sensor hybrid histidine kinase  59.68 
 
 
1942 aa  1843    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5629  GAF sensor hybrid histidine kinase  56.97 
 
 
2010 aa  1815    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117507 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  60.6 
 
 
1782 aa  1800    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5202  GAF sensor hybrid histidine kinase  52.78 
 
 
1478 aa  1154    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0874625 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0286  GAF sensor hybrid histidine kinase  52.11 
 
 
1406 aa  1353    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2644  GAF sensor hybrid histidine kinase  52.91 
 
 
1303 aa  1243    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229306  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2473  GAF sensor hybrid histidine kinase  55.18 
 
 
1792 aa  1515    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  60.43 
 
 
1917 aa  1868    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4117  GAF sensor hybrid histidine kinase  62.1 
 
 
1588 aa  1367    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0887298  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  57.33 
 
 
1896 aa  1749    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5091  GAF sensor hybrid histidine kinase  58.79 
 
 
1479 aa  1678    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.493325  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3328  GAF sensor hybrid histidine kinase  54.79 
 
 
1482 aa  1214    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  60.16 
 
 
1937 aa  1828    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0185  GAF sensor hybrid histidine kinase  49.83 
 
 
1214 aa  1098    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467777  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  56.54 
 
 
1839 aa  1598    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1853 aa  3705    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4049  GAF sensor hybrid histidine kinase  58.39 
 
 
1406 aa  1169    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4253  GAF sensor hybrid histidine kinase  97.84 
 
 
1843 aa  3576    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  57.49 
 
 
2107 aa  1957    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  59.59 
 
 
2099 aa  2078    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3894  putative sensor histidine kinase  67.11 
 
 
590 aa  704    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.35 
 
 
1150 aa  1119    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  59.3 
 
 
1937 aa  1819    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  55.61 
 
 
1857 aa  1576    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  60.17 
 
 
1936 aa  1828    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  57.45 
 
 
1954 aa  1822    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  59.56 
 
 
2099 aa  2080    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4276  GAF sensor hybrid histidine kinase  97.46 
 
 
1847 aa  3552    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1053  GAF sensor hybrid histidine kinase  53.28 
 
 
1458 aa  1412    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4523  GAF sensor hybrid histidine kinase  52.22 
 
 
1179 aa  1089    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522992  decreased coverage  0.00180703 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  60.16 
 
 
1937 aa  1831    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  57.63 
 
 
1964 aa  1791    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.370442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0144  GAF sensor hybrid histidine kinase  53.44 
 
 
1119 aa  1080    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4103  ATPase domain-containing protein  51.65 
 
 
1179 aa  1057    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.972573  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6993  GAF sensor hybrid histidine kinase  56.17 
 
 
1159 aa  945    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.922616  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  57.85 
 
 
1695 aa  1369    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.946527 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04479  Histidine kinase J7 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ24]  61 
 
 
1297 aa  610  1e-173  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930158  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2180  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.56 
 
 
922 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.238731  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3009  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.62 
 
 
920 aa  556  1e-156  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.59521  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1267  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.65 
 
 
916 aa  544  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.98 
 
 
1195 aa  520  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4266  sensor histidine kinase/response regulator  39.15 
 
 
896 aa  498  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000252034 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0907  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.23 
 
 
896 aa  497  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1090  sensor histidine kinase/response regulator  38.68 
 
 
896 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.358618  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0932  sensor histidine kinase/response regulator  38.95 
 
 
896 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0917  sensor histidine kinase  38.68 
 
 
896 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0900  sensor histidine kinase  38.68 
 
 
896 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1163  sensor histidine kinase/response regulator  38.82 
 
 
896 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0996  sensor histidine kinase/response regulator  38.95 
 
 
896 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1072  sensor histidine kinase/response regulator  38.54 
 
 
896 aa  493  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.88167e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1037  sensor histidine kinase/response regulator  39.45 
 
 
896 aa  492  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73542  histidine kinase osmosensor  53.47 
 
 
1118 aa  461  9.999999999999999e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 
1155 aa  439  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  36.7 
 
 
1161 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1960  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 
1680 aa  395  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.0344276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 
1203 aa  393  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.76 
 
 
1713 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.31 
 
 
1155 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.08 
 
 
1155 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1215  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  50.72 
 
 
944 aa  385  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.960151  normal  0.101285 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  37 
 
 
1143 aa  382  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.08 
 
 
1163 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 
1158 aa  381  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.57 
 
 
1038 aa  382  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.6 
 
 
1155 aa  380  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 
1141 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2642  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.39 
 
 
1216 aa  371  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.974276  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.31 
 
 
1165 aa  372  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.985282 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  33.85 
 
 
1196 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 
1201 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.53 
 
 
1149 aa  370  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1073  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.8 
 
 
1158 aa  369  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00830683  normal  0.406928 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  35.68 
 
 
1200 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  35.36 
 
 
1170 aa  367  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  35.52 
 
 
1172 aa  366  3e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.12 
 
 
1356 aa  365  4e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  37.5 
 
 
1137 aa  365  5.0000000000000005e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.53 
 
 
1168 aa  365  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
1145 aa  365  5.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.35 
 
 
1137 aa  358  7.999999999999999e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.18 
 
 
1177 aa  357  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2080  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  33.04 
 
 
1158 aa  353  1e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.264996 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5390  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.99 
 
 
1195 aa  350  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596605  hitchhiker  0.00757911 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3719  sensor histidine kinase  32.93 
 
 
1278 aa  350  2e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 
1131 aa  349  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 
1159 aa  348  4e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1216  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.2 
 
 
1194 aa  348  8e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.469894 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1648  histidine kinase  30.96 
 
 
1374 aa  339  2.9999999999999997e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102759  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3354  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 
1189 aa  338  5e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.426502  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.98 
 
 
1142 aa  334  9e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1000  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.99 
 
 
1161 aa  317  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2257  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 
1162 aa  308  9.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4386  histidine kinase  44.02 
 
 
411 aa  299  3e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2112  Cache sensor hybrid histidine kinase  30.28 
 
 
1361 aa  298  8e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>