More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0010 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0010  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
750 aa  1528    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0248614  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1248  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.85 
 
 
981 aa  573  1.0000000000000001e-162  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206477  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0016  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  48.13 
 
 
1009 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0724205  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1710  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  37.66 
 
 
1355 aa  451  1e-125  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1735  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.07 
 
 
868 aa  449  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1733  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.04 
 
 
823 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0951  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.11 
 
 
1332 aa  398  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.514754  normal  0.661078 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2633  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  47.31 
 
 
806 aa  398  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0337434  hitchhiker  0.00302183 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1707  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.36 
 
 
1016 aa  389  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569761  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2942  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.81 
 
 
1049 aa  350  5e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.34 
 
 
1048 aa  348  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0818053 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1775  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  35.41 
 
 
937 aa  337  7e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.303689  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3278  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.95 
 
 
880 aa  332  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0350486  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  51.76 
 
 
1091 aa  296  1e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.199653 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2710  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.74 
 
 
969 aa  294  4e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2483  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.02 
 
 
905 aa  283  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.611307  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.02 
 
 
905 aa  282  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.52 
 
 
569 aa  269  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  72.04 
 
 
519 aa  267  7e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1374  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.45 
 
 
908 aa  262  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.31 
 
 
824 aa  253  7e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.256608 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1482  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.11 
 
 
735 aa  248  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.62 
 
 
735 aa  248  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  33.94 
 
 
1104 aa  240  6.999999999999999e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.292314  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 
1500 aa  239  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1294  methyl-accepting chemotaxis protein  35.92 
 
 
962 aa  232  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2944  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.56 
 
 
780 aa  231  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2945  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.69 
 
 
780 aa  229  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0369  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.55 
 
 
725 aa  223  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0356  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.26 
 
 
725 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.14 
 
 
693 aa  216  9e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.776731  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.7 
 
 
772 aa  207  5e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1068  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  27.15 
 
 
885 aa  205  3e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.122951 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1294  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.65 
 
 
686 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.66893e-19 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2975  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 
758 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1526  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.48 
 
 
858 aa  140  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.787952  normal  0.35844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.68 
 
 
1093 aa  139  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.653084  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7320  methyl-accepting chemotaxis protein  24.19 
 
 
774 aa  137  7.000000000000001e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.364364  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  32.99 
 
 
1046 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.925436  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1108  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.62 
 
 
685 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  20.77 
 
 
1853 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.77 
 
 
1088 aa  125  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000517956 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  22.59 
 
 
1782 aa  124  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4253  GAF sensor hybrid histidine kinase  20.77 
 
 
1843 aa  124  8e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  22.87 
 
 
2099 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4276  GAF sensor hybrid histidine kinase  20.58 
 
 
1847 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3947  methyl-accepting chemotaxis protein  30.67 
 
 
619 aa  123  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.412994  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  22.87 
 
 
2099 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  21.21 
 
 
1964 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.370442 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  21.69 
 
 
1917 aa  122  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2423  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  29.09 
 
 
533 aa  120  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.494868  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1943  GAF sensor hybrid histidine kinase  21.01 
 
 
1468 aa  120  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0286  GAF sensor hybrid histidine kinase  19.26 
 
 
1406 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5202  GAF sensor hybrid histidine kinase  18.93 
 
 
1478 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0874625 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5629  GAF sensor hybrid histidine kinase  21.44 
 
 
2010 aa  119  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117507 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  21.49 
 
 
1896 aa  118  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  30.61 
 
 
1089 aa  118  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000851175  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.25 
 
 
534 aa  117  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.55 
 
 
509 aa  117  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3968  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.09 
 
 
509 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000439597 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1557  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.93 
 
 
526 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  21.92 
 
 
1392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  19.75 
 
 
1857 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  19.75 
 
 
1839 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  20.94 
 
 
1954 aa  114  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0325  GAF sensor hybrid histidine kinase  20.83 
 
 
2037 aa  114  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  18.43 
 
 
1816 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4117  GAF sensor hybrid histidine kinase  22.04 
 
 
1588 aa  112  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0887298  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3548  GAF sensor hybrid histidine kinase  21.49 
 
 
1942 aa  112  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  22.25 
 
 
2107 aa  111  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  22.07 
 
 
1695 aa  110  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2992  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.09 
 
 
733 aa  110  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3894  putative sensor histidine kinase  22.34 
 
 
590 aa  108  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2473  GAF sensor hybrid histidine kinase  21.63 
 
 
1792 aa  108  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0666  GAF sensor hybrid histidine kinase  20.79 
 
 
1400 aa  108  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.982341 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  21.2 
 
 
1936 aa  108  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4103  ATPase domain-containing protein  22.16 
 
 
1179 aa  108  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.972573  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  19.55 
 
 
1937 aa  108  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  19.55 
 
 
1937 aa  108  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0185  GAF sensor hybrid histidine kinase  21.1 
 
 
1214 aa  107  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467777  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  21.76 
 
 
1937 aa  107  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4523  GAF sensor hybrid histidine kinase  22.16 
 
 
1179 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522992  decreased coverage  0.00180703 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5091  GAF sensor hybrid histidine kinase  18.83 
 
 
1479 aa  106  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.493325  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.92 
 
 
1150 aa  105  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1053  GAF sensor hybrid histidine kinase  19.03 
 
 
1458 aa  104  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4049  GAF sensor hybrid histidine kinase  20.17 
 
 
1406 aa  104  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0144  GAF sensor hybrid histidine kinase  20.98 
 
 
1119 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2644  GAF sensor hybrid histidine kinase  21.15 
 
 
1303 aa  101  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229306  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.76 
 
 
904 aa  100  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0613  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.3 
 
 
759 aa  100  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.194714 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2065  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  26.98 
 
 
557 aa  98.6  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461266  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6993  GAF sensor hybrid histidine kinase  20.33 
 
 
1159 aa  98.2  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.922616  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2423  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.64 
 
 
740 aa  97.4  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1140  methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 
727 aa  97.1  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.664897  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04479  Histidine kinase J7 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ24]  19.83 
 
 
1297 aa  94.7  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930158  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0298  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.75 
 
 
600 aa  90.1  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000337227  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1632  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.33 
 
 
654 aa  87.4  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3328  GAF sensor hybrid histidine kinase  18.76 
 
 
1482 aa  85.9  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3046  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 
660 aa  85.1  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0447  putative sigma54 specific transcriptional regulator  36.36 
 
 
438 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>