More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6126 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6126  histidine kinase  100 
 
 		 628 aa  1296    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4076  histidine kinase  34.96 
 
 		 667 aa  140  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.249378  normal  0.142572 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3961  histidine kinase  33.2 
 
 		 475 aa  140  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321682  normal  0.0949422 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0345  histidine kinase  33.91 
 
 		 454 aa  136  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0306383  normal  0.0156916 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1193  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 387 aa  131  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.257298  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3285  ATP-binding region ATPase domain protein  32.23 
 
 		 588 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.255364 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1899  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 407 aa  130  9.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.512504  normal  0.0507183 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1411  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 673 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352206  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5059  histidine kinase  29.33 
 
 		 614 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00156812  normal  0.0126668 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3541  sensor kinase of copper sensing two-component system  35.48 
 
 		 448 aa  127  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0485338  normal  0.197924 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  33.19 
 
 		 1414 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1523  ATP-binding region ATPase domain protein  31.43 
 
 		 433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925921  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6179  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 389 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6422  histidine kinase  29.79 
 
 		 432 aa  121  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3540  sensor for ctr capsule biosynthesis, histidine kinase acting on RcsB  33.33 
 
 		 446 aa  120  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.168985  normal  0.341625 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 576 aa  120  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5226  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 388 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 582 aa  115  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  32.48 
 
 		 587 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  32.48 
 
 		 587 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  32.48 
 
 		 587 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  32.48 
 
 		 587 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  32.48 
 
 		 587 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  32.48 
 
 		 587 aa  112  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  32.76 
 
 		 587 aa  112  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 587 aa  110  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  31.62 
 
 		 587 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  32.05 
 
 		 587 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.32 
 
 		 1261 aa  109  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 585 aa  107  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1344  histidine kinase  26.16 
 
 		 696 aa  107  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1596  Diverse 7TM receptor transmembrane region  29.79 
 
 		 660 aa  107  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.351374 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  31.15 
 
 		 1797 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_002950  PG1432  sensor histidine kinase  26.87 
 
 		 621 aa  105  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.197546 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 585 aa  104  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3394  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.43 
 
 		 560 aa  104  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1613  histidine kinase  30.47 
 
 		 594 aa  104  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000260533  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6950  histidine kinase  27.24 
 
 		 721 aa  103  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.34 
 
 		 628 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 1711 aa  102  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0762  ATP-binding region ATPase domain protein  28.19 
 
 		 630 aa  101  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  27.94 
 
 		 1535 aa  99.8  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 597 aa  99  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.07 
 
 		 816 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 		 1029 aa  99  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1870  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 657 aa  97.8  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240453  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0820  multisensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 		 519 aa  97.1  9e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2060  sensor histidine kinase  28.9 
 
 		 453 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000124716  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3284  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 856 aa  97.1  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0250894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.24 
 
 		 1478 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 925 aa  96.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2992  histidine kinase  29.71 
 
 		 908 aa  96.3  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11300  signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 556 aa  96.7  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0955  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 765 aa  97.1  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 1046 aa  96.3  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  26.61 
 
 		 464 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 504 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1383  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.27 
 
 		 642 aa  95.9  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9098  bacteriophytochrome protein  30.16 
 
 		 378 aa  96.3  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.384054  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2317  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.75 
 
 		 657 aa  96.3  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.553373  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.74 
 
 		 950 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 593 aa  95.1  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.78 
 
 		 1965 aa  95.5  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2011  sensor histidine kinase  28.44 
 
 		 459 aa  95.5  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.62576e-42 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1833  sensor histidine kinase  28.44 
 
 		 453 aa  95.1  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1807  sensor histidine kinase  28.44 
 
 		 453 aa  95.1  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000147416  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1790  sensor histidine kinase  28.44 
 
 		 453 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000385463  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  28.51 
 
 		 587 aa  94.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  25.39 
 
 		 790 aa  95.1  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 812 aa  94.7  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1976  sensor histidine kinase  28.44 
 
 		 453 aa  95.1  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00238966  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00620  two-component system sensor protein  31.5 
 
 		 1131 aa  94.4  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282271  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 		 473 aa  94.7  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 509 aa  94.4  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.85 
 
 		 1352 aa  94  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 		 557 aa  94  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.125124  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1523  sensory box histidine kinase  27.04 
 
 		 787 aa  94  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00153524  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0829  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.21 
 
 		 812 aa  94  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177536 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 		 640 aa  94  8e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1316  sensory box histidine kinase  27.04 
 
 		 787 aa  94  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00351204  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 		 592 aa  93.6  9e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1010  histidine kinase  30.71 
 
 		 572 aa  93.6  9e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0817847 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 406 aa  93.6  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 		 608 aa  93.6  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  28.94 
 
 		 461 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  30.21 
 
 		 544 aa  93.2  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 827 aa  93.6  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 		 763 aa  93.2  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0510  Cache sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 633 aa  93.2  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 		 680 aa  92.8  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  28.21 
 
 		 537 aa  92.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  28.94 
 
 		 461 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  28.94 
 
 		 461 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0411  signal transduction histidine kinase, LytS  28.15 
 
 		 1018 aa  92.8  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000411039  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 		 510 aa  92.8  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  28.93 
 
 		 1207 aa  92.8  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0977  histidine kinase  30.32 
 
 		 551 aa  92.8  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0254133 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 1548 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3854  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 386 aa  92  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00572  putative signal transduction histidine kinase two-component system with Protein-glutamate methylesterase domain  29.44 
 
 		 919 aa  91.7  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>