More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1316 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1523  sensory box histidine kinase  97.71 
 
 		 787 aa  1469    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00153524  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1316  sensory box histidine kinase  100 
 
 		 787 aa  1532    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00351204  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0195  sensory box histidine kinase  39.43 
 
 		 791 aa  432  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00184929  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0198  sensory box histidine kinase  39.07 
 
 		 791 aa  429  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00155091  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.48 
 
 		 652 aa  261  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2076  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.24 
 
 		 387 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52949  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3383  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 617 aa  229  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0286  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  50.57 
 
 		 424 aa  226  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.136894  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1055  sensory box histidine kinase/response regulator  42.96 
 
 		 558 aa  199  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.952288  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1243  sensory box histidine kinase  41.82 
 
 		 623 aa  198  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  43.7 
 
 		 1086 aa  191  7e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  43.28 
 
 		 1093 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0511  histidine kinase  39.78 
 
 		 440 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000775208  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.31 
 
 		 979 aa  172  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.55 
 
 		 696 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03428  PAS signal transduction protein  27.15 
 
 		 962 aa  164  7e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.15 
 
 		 738 aa  162  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.29 
 
 		 1363 aa  161  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 1291 aa  161  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.09 
 
 		 944 aa  161  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1953  sensor histidine kinase  35.53 
 
 		 678 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.105844  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.91 
 
 		 1084 aa  159  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2241  sensor histidine kinase  37 
 
 		 678 aa  159  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00553102  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.57 
 
 		 708 aa  157  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.02 
 
 		 1301 aa  156  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4104  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.89 
 
 		 557 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 1043 aa  154  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  36.43 
 
 		 560 aa  154  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 		 1287 aa  154  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 371 aa  153  8.999999999999999e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1954  sensor histidine kinase  36.86 
 
 		 624 aa  154  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000131402  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4463  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.07 
 
 		 839 aa  153  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 585 aa  152  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.82 
 
 		 640 aa  152  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 456 aa  152  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1005  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.4 
 
 		 747 aa  152  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.93 
 
 		 1029 aa  151  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1100  PAS  28.14 
 
 		 576 aa  151  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 597 aa  151  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4184  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.2 
 
 		 783 aa  151  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.92 
 
 		 1202 aa  151  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3275  PAS sensor protein  30.08 
 
 		 1015 aa  150  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.991698  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2129  sensory box histidine kinase/response regulator  27.89 
 
 		 746 aa  150  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.706377  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1939  PAS  28.04 
 
 		 779 aa  150  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2242  sensor histidine kinase  33.13 
 
 		 620 aa  150  8e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000101794  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1191  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 697 aa  150  9e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.604254  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 		 881 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  28.37 
 
 		 823 aa  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  38.21 
 
 		 1306 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 597 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 1153 aa  149  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  34.85 
 
 		 1196 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.92 
 
 		 973 aa  149  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  27.05 
 
 		 1046 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 		 955 aa  148  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.47 
 
 		 628 aa  147  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 1255 aa  147  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  26.84 
 
 		 1344 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  34.3 
 
 		 461 aa  147  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  34.02 
 
 		 1202 aa  147  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  34.3 
 
 		 461 aa  147  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.86 
 
 		 916 aa  147  9e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1834  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.8 
 
 		 569 aa  146  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.92 
 
 		 940 aa  146  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.23 
 
 		 969 aa  146  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0559  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.62 
 
 		 704 aa  146  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.42 
 
 		 776 aa  147  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  31.69 
 
 		 1172 aa  146  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.75 
 
 		 889 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7014  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.52 
 
 		 781 aa  146  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1340  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.51 
 
 		 682 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.725746  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1492  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.65 
 
 		 606 aa  145  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216645  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0212  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.04 
 
 		 953 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.05 
 
 		 1002 aa  146  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  26.81 
 
 		 1120 aa  145  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.47 
 
 		 823 aa  145  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.29 
 
 		 1053 aa  145  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2074  sensor histidine kinase  32.4 
 
 		 816 aa  145  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6270  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.88 
 
 		 952 aa  145  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5316  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.11 
 
 		 1069 aa  144  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72275  normal  0.481403 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6593  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.14 
 
 		 906 aa  144  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.14 
 
 		 1051 aa  144  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6390  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.92 
 
 		 770 aa  144  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.186908 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.85 
 
 		 776 aa  144  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.43 
 
 		 882 aa  144  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 1048 aa  144  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 503 aa  144  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0857  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.39 
 
 		 698 aa  144  9e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0897898 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  33.47 
 
 		 461 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  29.05 
 
 		 1303 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.16 
 
 		 768 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479069  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5450  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.73 
 
 		 799 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754974 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5642  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.5 
 
 		 768 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  32.97 
 
 		 876 aa  143  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.41 
 
 		 713 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  32.92 
 
 		 1152 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 1140 aa  142  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.15 
 
 		 745 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 639 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  28.77 
 
 		 587 aa  142  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>