More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6950 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6950  histidine kinase  100 
 
 		 721 aa  1486    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6949  hypothetical protein  33.18 
 
 		 624 aa  341  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4076  histidine kinase  24.46 
 
 		 667 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.249378  normal  0.142572 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1411  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 673 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352206  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1899  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 407 aa  127  7e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.512504  normal  0.0507183 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3961  histidine kinase  28.57 
 
 		 475 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321682  normal  0.0949422 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1523  ATP-binding region ATPase domain protein  30.36 
 
 		 433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925921  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3541  sensor kinase of copper sensing two-component system  28.52 
 
 		 448 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0485338  normal  0.197924 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3285  ATP-binding region ATPase domain protein  31.05 
 
 		 588 aa  120  7.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.255364 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  28.19 
 
 		 1414 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0210  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.64 
 
 		 708 aa  115  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 		 816 aa  114  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1193  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 		 387 aa  114  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.257298  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.28 
 
 		 1330 aa  114  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0185  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 691 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.483444  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.26 
 
 		 1808 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 		 1352 aa  112  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 		 628 aa  112  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.96 
 
 		 1002 aa  112  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 503 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0345  histidine kinase  26.88 
 
 		 454 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0306383  normal  0.0156916 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.69 
 
 		 713 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6126  histidine kinase  23.88 
 
 		 628 aa  111  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1596  Diverse 7TM receptor transmembrane region  29.41 
 
 		 660 aa  110  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.351374 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.42 
 
 		 933 aa  110  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 		 1965 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 1026 aa  110  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0762  ATP-binding region ATPase domain protein  29.39 
 
 		 630 aa  109  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.19 
 
 		 955 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.38 
 
 		 708 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5226  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 388 aa  107  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 631 aa  107  7e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.963931  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.92 
 
 		 934 aa  107  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.38 
 
 		 701 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.92 
 
 		 1478 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  25.86 
 
 		 592 aa  107  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.55 
 
 		 911 aa  106  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.63 
 
 		 1431 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.13 
 
 		 977 aa  105  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.97 
 
 		 1548 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.14 
 
 		 1331 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  31.3 
 
 		 360 aa  104  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  31.91 
 
 		 539 aa  104  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 695 aa  104  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1497  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.59 
 
 		 880 aa  103  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05068  composite two-component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  32.48 
 
 		 676 aa  103  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2393  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.87 
 
 		 676 aa  103  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822967 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 		 1060 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 718 aa  103  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  28.78 
 
 		 1399 aa  103  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.01 
 
 		 865 aa  103  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0319  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 		 636 aa  102  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.64 
 
 		 1557 aa  101  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.25 
 
 		 1419 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 		 1297 aa  101  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0095  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 582 aa  100  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0711  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 581 aa  100  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.48 
 
 		 765 aa  100  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0353  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 332 aa  100  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 		 637 aa  100  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3600  histidine kinase  26.12 
 
 		 548 aa  100  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.94225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1852  histidine kinase  27.36 
 
 		 1074 aa  99.4  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.496494  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5434  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.2 
 
 		 539 aa  99  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489177  normal  0.0484799 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 587 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3540  sensor for ctr capsule biosynthesis, histidine kinase acting on RcsB  26.33 
 
 		 446 aa  99  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.168985  normal  0.341625 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  38.76 
 
 		 469 aa  99  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  27 
 
 		 508 aa  99  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 367 aa  99  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.13 
 
 		 1433 aa  99  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4428  PAS sensor protein  29.27 
 
 		 693 aa  98.6  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.426756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.79 
 
 		 1391 aa  98.6  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0413  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.55 
 
 		 649 aa  98.6  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  31.64 
 
 		 449 aa  98.2  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1613  histidine kinase  29.77 
 
 		 594 aa  98.6  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000260533  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6179  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 		 389 aa  98.2  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 638 aa  98.2  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.230801  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 		 467 aa  97.8  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1902  bacteriophytochrome histidine kinase  26.64 
 
 		 745 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333534  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 		 639 aa  97.8  6e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.19 
 
 		 1501 aa  97.8  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2452  histidine kinase  31.42 
 
 		 459 aa  97.4  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.14 
 
 		 1797 aa  97.8  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2759  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 785 aa  97.8  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.24 
 
 		 1068 aa  97.4  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0006  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 513 aa  97.4  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000267267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 444 aa  97.4  8e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5276  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 579 aa  97.4  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.606728  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 641 aa  97.1  9e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2015  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 874 aa  97.1  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847604 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 		 889 aa  97.4  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2084  sensor histidine kinase  26.67 
 
 		 816 aa  97.1  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.13 
 
 		 947 aa  97.1  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  28.97 
 
 		 464 aa  96.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 		 640 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 		 639 aa  97.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 1255 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4184  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.78 
 
 		 783 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 		 354 aa  96.3  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  30.52 
 
 		 461 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.65 
 
 		 864 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>