More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0006 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0006  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 513 aa  1025    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000267267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1069  CHASE domain-containing protein/sensory box histidine kinase  61.95 
 
 		 751 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11630  putative two-component sensor  61.31 
 
 		 766 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1659  Chase sensor signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 		 828 aa  250  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0485776 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 794 aa  246  8e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.0500426 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 795 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458643  normal  0.624704 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4582  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 795 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0924  sensor histidine kinase  35.94 
 
 		 797 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1843  sensor histidine kinase  35.71 
 
 		 797 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562935  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1457  sensor histidine kinase  35.94 
 
 		 797 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0425  sensor histidine kinase  35.94 
 
 		 797 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.299792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1666  sensor histidine kinase  35.71 
 
 		 797 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.672693  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1688  sensor histidine kinase  35.71 
 
 		 797 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0738  sensor histidine kinase  35.94 
 
 		 797 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2636  sensor histidine kinase  34.93 
 
 		 759 aa  239  9e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 829 aa  239  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.583983  hitchhiker  0.00918197 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1318  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 795 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1416  histidine kinase  35.12 
 
 		 795 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0956  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 795 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00439356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 795 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.564395  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 754 aa  216  8e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1075  two-component system sensor histidine kinase transcription regulator protein  36.31 
 
 		 784 aa  212  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.708175 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4164  putative periplasmic CHASE2 sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 819 aa  210  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1006  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 		 777 aa  209  8e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0941  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 		 777 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4941  sensor histidine kinase  33.26 
 
 		 799 aa  201  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176481  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 757 aa  179  9e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.856998  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 785 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.830566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5418  histidine kinase  31.67 
 
 		 789 aa  162  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6238  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 737 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.438492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1324  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 		 645 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92156  normal  0.730063 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2532  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 		 854 aa  138  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 		 816 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0500  sensor histidine kinase/response regulator  40.39 
 
 		 364 aa  128  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.823251  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1396  response regulator/sensor histidine kinase  39.41 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1593  response regulator/sensor histidine kinase  39.41 
 
 		 364 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2689  response regulator/sensor histidine kinase  39.41 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2544  response regulator/sensor histidine kinase  39.41 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0252  response regulator/sensor histidine kinase  39.41 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549911  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0216  sensor histidine kinase/response regulator  39.41 
 
 		 364 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0969  sensor histidine kinase/response regulator  39.41 
 
 		 364 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1427  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 776 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430091  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2309  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 377 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.556346 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0581  transmembrane sensor-like domain-containing protein  27.93 
 
 		 828 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0428324  normal  0.0128662 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4947  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22580  signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 576 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.162219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5512  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 377 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3678  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4977  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3806  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 533 aa  119  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.576691  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4653  histidine kinase  32.68 
 
 		 799 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.688546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 625 aa  118  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 1741 aa  116  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1138 aa  116  8.999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 444 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  26.94 
 
 		 613 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4578  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3785  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.76138  normal  0.119263 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3738  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 363 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524065  normal  0.172918 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 		 619 aa  115  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.11 
 
 		 611 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7663  histidine kinase  36.52 
 
 		 639 aa  113  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5588  sensory box histidine kinase YycG  26.67 
 
 		 613 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.8382  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.83 
 
 		 609 aa  110  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  26.39 
 
 		 613 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  26.39 
 
 		 613 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 589 aa  110  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.306932  normal  0.158909 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 524 aa  109  9.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5571  sensory box histidine kinase YycG  26.39 
 
 		 613 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51773e-30 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5614  sensory box histidine kinase YycG  26.39 
 
 		 613 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5146  sensor histidine kinase  26.39 
 
 		 613 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5649  sensory box histidine kinase YycG  26.39 
 
 		 613 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0306249  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  31.05 
 
 		 461 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 815 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1928  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 920 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 827 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5162  sensor histidine kinase  26.39 
 
 		 613 aa  108  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.41 
 
 		 458 aa  106  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3924  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 436 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4318  ATPase domain-containing protein  34.06 
 
 		 593 aa  106  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819924  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.21 
 
 		 754 aa  106  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0194  ATPase domain-containing protein  28.28 
 
 		 549 aa  106  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.357239  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2879  histidine kinase  31.38 
 
 		 553 aa  106  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 468 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  32.08 
 
 		 469 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0102  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 763 aa  106  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1492  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 		 624 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.411872  decreased coverage  0.00494446 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 466 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.42 
 
 		 1021 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0196  histidine kinase  31.94 
 
 		 510 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.447748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 350 aa  105  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3579  sensor protein KdpD  30.54 
 
 		 908 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1103  sensor protein KdpD  30.54 
 
 		 908 aa  104  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0538967  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 		 608 aa  104  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 460 aa  104  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 1516 aa  104  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1156  sensor protein KdpD  30.54 
 
 		 908 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.486498  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 489 aa  103  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.07 
 
 		 589 aa  103  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000411549  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 452 aa  103  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 		 585 aa  103  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>