More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1069 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_11630  putative two-component sensor  90.8 
 
 
766 aa  1223    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1069  CHASE domain-containing protein/sensory box histidine kinase  100 
 
 
751 aa  1478    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0006  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  59.28 
 
 
513 aa  515  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000267267  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2636  sensor histidine kinase  39.63 
 
 
759 aa  424  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1659  Chase sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 
828 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0485776 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0738  sensor histidine kinase  38.27 
 
 
797 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0924  sensor histidine kinase  38.27 
 
 
797 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1843  sensor histidine kinase  38.27 
 
 
797 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562935  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1457  sensor histidine kinase  38.27 
 
 
797 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0425  sensor histidine kinase  38.27 
 
 
797 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.299792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1666  sensor histidine kinase  38.39 
 
 
797 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.672693  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1688  sensor histidine kinase  38.39 
 
 
797 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 
829 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.583983  hitchhiker  0.00918197 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1318  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 
795 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 
795 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458643  normal  0.624704 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4582  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 
795 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1416  histidine kinase  36.76 
 
 
795 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4164  putative periplasmic CHASE2 sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 
819 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0956  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 
795 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00439356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 
795 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.564395  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 
794 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.0500426 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 
757 aa  393  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.856998  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1006  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 
777 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0941  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.03 
 
 
777 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 
754 aa  375  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4941  sensor histidine kinase  36.81 
 
 
799 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176481  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1075  two-component system sensor histidine kinase transcription regulator protein  37.4 
 
 
784 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.708175 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 
785 aa  269  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.830566  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1427  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 
776 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430091  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0474  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 
759 aa  189  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.453015  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2532  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 
854 aa  164  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2916  diguanylate cyclase with Chase2 sensor  37.46 
 
 
543 aa  157  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.833203  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6238  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
737 aa  157  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.438492  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4653  histidine kinase  28.08 
 
 
799 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.688546 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1324  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 
645 aa  151  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92156  normal  0.730063 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0581  transmembrane sensor-like domain-containing protein  30.39 
 
 
828 aa  148  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0428324  normal  0.0128662 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
827 aa  138  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7663  histidine kinase  37.83 
 
 
639 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113237  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
466 aa  134  7.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5418  histidine kinase  37.12 
 
 
789 aa  133  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0500  sensor histidine kinase/response regulator  39.11 
 
 
364 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.823251  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4947  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.55 
 
 
377 aa  128  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0216  sensor histidine kinase/response regulator  38.61 
 
 
364 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0252  response regulator/sensor histidine kinase  38.61 
 
 
365 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549911  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1396  response regulator/sensor histidine kinase  38.61 
 
 
365 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1593  response regulator/sensor histidine kinase  38.61 
 
 
364 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2689  response regulator/sensor histidine kinase  38.61 
 
 
365 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2544  response regulator/sensor histidine kinase  38.61 
 
 
365 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 
350 aa  127  8.000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0969  sensor histidine kinase/response regulator  38.12 
 
 
364 aa  127  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2309  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 
377 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.556346 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.27 
 
 
1021 aa  126  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5512  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 
377 aa  124  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3738  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 
458 aa  124  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0429  ATP-binding region ATPase domain protein  26.83 
 
 
568 aa  124  9e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.796172  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3678  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 
363 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4977  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3738  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 
363 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524065  normal  0.172918 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4578  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 
377 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3785  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 
377 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.76138  normal  0.119263 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 
619 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 
412 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 
412 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4200  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.21 
 
 
678 aa  120  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.679083  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 
584 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4310  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.21 
 
 
631 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.917762  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 
625 aa  119  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 
444 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  28.14 
 
 
613 aa  118  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 
611 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 
418 aa  117  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  26.41 
 
 
1629 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  32.79 
 
 
392 aa  117  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.15 
 
 
1060 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 
489 aa  115  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  29.15 
 
 
461 aa  114  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 
476 aa  114  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 
815 aa  114  7.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0381  histidine kinase  30.23 
 
 
430 aa  114  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2982  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 
608 aa  114  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1757  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 
614 aa  114  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
1010 aa  114  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  28.42 
 
 
613 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3611  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 
566 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.716129  hitchhiker  0.000346414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30 
 
 
1026 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  28.42 
 
 
613 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 
639 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 
639 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  31.62 
 
 
406 aa  113  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0840  histidine kinase  31.01 
 
 
363 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  31.47 
 
 
501 aa  113  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22580  signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 
576 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.162219  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5588  sensory box histidine kinase YycG  28.42 
 
 
613 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.8382  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 
460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 
933 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 
585 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1394  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.13 
 
 
924 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.640211  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  27.16 
 
 
617 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  27.3 
 
 
587 aa  112  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 
604 aa  112  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0194  ATPase domain-containing protein  26.45 
 
 
549 aa  112  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.357239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>