More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1416 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1416  histidine kinase  100 
 
 		 795 aa  1593    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1688  sensor histidine kinase  75.13 
 
 		 797 aa  1155    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0924  sensor histidine kinase  75.26 
 
 		 797 aa  1156    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1843  sensor histidine kinase  75 
 
 		 797 aa  1152    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562935  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4582  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  95.85 
 
 		 795 aa  1501    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2636  sensor histidine kinase  75.49 
 
 		 759 aa  1137    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1659  Chase sensor signal transduction histidine kinase  64.4 
 
 		 828 aa  977    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0485776 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1666  sensor histidine kinase  75.13 
 
 		 797 aa  1155    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.672693  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  93.71 
 
 		 795 aa  1464    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458643  normal  0.624704 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0956  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  99.62 
 
 		 795 aa  1588    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00439356  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1318  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  93.71 
 
 		 795 aa  1467    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  99.62 
 
 		 795 aa  1588    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.564395  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0738  sensor histidine kinase  75.26 
 
 		 797 aa  1156    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  92.45 
 
 		 794 aa  1433    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.0500426 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.7 
 
 		 829 aa  935    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.583983  hitchhiker  0.00918197 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1457  sensor histidine kinase  75.26 
 
 		 797 aa  1156    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0425  sensor histidine kinase  75.26 
 
 		 797 aa  1156    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.299792  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.44 
 
 		 754 aa  461  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1006  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 777 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0941  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 777 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 757 aa  410  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.856998  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1069  CHASE domain-containing protein/sensory box histidine kinase  37.43 
 
 		 751 aa  392  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11630  putative two-component sensor  37.81 
 
 		 766 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1075  two-component system sensor histidine kinase transcription regulator protein  36.42 
 
 		 784 aa  385  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.708175 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4164  putative periplasmic CHASE2 sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 819 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4941  sensor histidine kinase  34.64 
 
 		 799 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176481  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5418  histidine kinase  32.9 
 
 		 789 aa  299  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 785 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.830566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0006  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 513 aa  244  7e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000267267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2532  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 		 854 aa  196  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1324  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.18 
 
 		 645 aa  195  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92156  normal  0.730063 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6238  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 737 aa  194  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.438492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7663  histidine kinase  44.2 
 
 		 639 aa  185  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4947  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.81 
 
 		 377 aa  157  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0581  transmembrane sensor-like domain-containing protein  30.42 
 
 		 828 aa  156  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0428324  normal  0.0128662 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2309  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 		 377 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.556346 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5512  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 		 377 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3738  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 		 363 aa  154  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524065  normal  0.172918 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3678  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 		 363 aa  154  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4578  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 		 377 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3785  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 		 377 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.76138  normal  0.119263 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0252  response regulator/sensor histidine kinase  41.95 
 
 		 365 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549911  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2544  response regulator/sensor histidine kinase  41.95 
 
 		 365 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0216  sensor histidine kinase/response regulator  41.95 
 
 		 364 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0969  sensor histidine kinase/response regulator  41.95 
 
 		 364 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0500  sensor histidine kinase/response regulator  41.95 
 
 		 364 aa  152  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.823251  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2689  response regulator/sensor histidine kinase  41.95 
 
 		 365 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1396  response regulator/sensor histidine kinase  41.95 
 
 		 365 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1593  response regulator/sensor histidine kinase  41.95 
 
 		 364 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4653  histidine kinase  27.72 
 
 		 799 aa  135  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.688546 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  30.32 
 
 		 666 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 584 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1427  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 		 776 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430091  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2916  diguanylate cyclase with Chase2 sensor  34.01 
 
 		 543 aa  128  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.833203  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3138  sensor histidine kinase/response regulator  31.78 
 
 		 484 aa  128  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.312332  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 625 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0803  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 399 aa  124  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 725 aa  124  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  33.62 
 
 		 906 aa  124  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 663 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.296509  normal  0.022202 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 1029 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22580  signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 576 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.162219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 600 aa  122  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  30.83 
 
 		 406 aa  122  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2084  histidine kinase  33.19 
 
 		 393 aa  121  6e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  32.93 
 
 		 346 aa  120  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 489 aa  119  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16710  signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 		 554 aa  119  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0521739 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 1017 aa  118  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2970  histidine kinase  34.58 
 
 		 387 aa  118  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 		 607 aa  118  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 1014 aa  118  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  32.81 
 
 		 470 aa  118  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 718 aa  117  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0429  ATP-binding region ATPase domain protein  30.39 
 
 		 568 aa  116  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.796172  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 		 590 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.6 
 
 		 1021 aa  115  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0194  ATPase domain-containing protein  31.82 
 
 		 549 aa  115  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.357239  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2042  sensor histidine kinase  29.13 
 
 		 351 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711965  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1963  sensor histidine kinase  29.13 
 
 		 357 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553892  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3854  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 		 386 aa  114  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 637 aa  114  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.22 
 
 		 423 aa  114  7.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 		 571 aa  114  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 		 621 aa  114  7.000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  26.05 
 
 		 762 aa  114  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 		 612 aa  114  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 614 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1791  sensor histidine kinase  29.53 
 
 		 351 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 		 641 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2460  histidine kinase  31.56 
 
 		 415 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 		 817 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.37 
 
 		 581 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1340  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 682 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.725746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1993  sensor histidine kinase  29.25 
 
 		 253 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.237870000000001e-44 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2093  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 		 530 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874358  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 695 aa  113  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  30 
 
 		 556 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2063  sensor histidine kinase  29.8 
 
 		 357 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000411382  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0849  histidine kinase  31.4 
 
 		 422 aa  113  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>