More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1666 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A1457  sensor histidine kinase  99.75 
 
 
797 aa  1611    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1688  sensor histidine kinase  100 
 
 
797 aa  1613    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  75.53 
 
 
794 aa  1167    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.0500426 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0924  sensor histidine kinase  99.75 
 
 
797 aa  1611    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1843  sensor histidine kinase  99.75 
 
 
797 aa  1610    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562935  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4582  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  75.78 
 
 
795 aa  1180    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1416  histidine kinase  74.78 
 
 
795 aa  1172    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  65.12 
 
 
829 aa  962    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.583983  hitchhiker  0.00918197 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2636  sensor histidine kinase  96.57 
 
 
759 aa  1465    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1659  Chase sensor signal transduction histidine kinase  64.2 
 
 
828 aa  986    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0485776 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0425  sensor histidine kinase  99.75 
 
 
797 aa  1611    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.299792  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0956  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  74.78 
 
 
795 aa  1172    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00439356  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1318  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  75.66 
 
 
795 aa  1178    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  75.66 
 
 
795 aa  1177    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458643  normal  0.624704 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0738  sensor histidine kinase  99.75 
 
 
797 aa  1611    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  74.78 
 
 
795 aa  1172    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.564395  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1666  sensor histidine kinase  100 
 
 
797 aa  1613    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.672693  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 
754 aa  450  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
757 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.856998  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1069  CHASE domain-containing protein/sensory box histidine kinase  38.79 
 
 
751 aa  412  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1006  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 
777 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0941  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 
777 aa  402  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11630  putative two-component sensor  38.82 
 
 
766 aa  399  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1075  two-component system sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.59 
 
 
784 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.708175 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4941  sensor histidine kinase  34.37 
 
 
799 aa  378  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176481  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4164  putative periplasmic CHASE2 sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 
819 aa  379  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5418  histidine kinase  32.27 
 
 
789 aa  300  9e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
785 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.830566  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0006  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 
513 aa  250  7e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000267267  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6238  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
737 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.438492  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1324  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 
645 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92156  normal  0.730063 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2532  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
854 aa  195  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1427  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 
776 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430091  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7663  histidine kinase  43.95 
 
 
639 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113237  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4947  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 
377 aa  152  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3678  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 
363 aa  151  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4977  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2309  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.64 
 
 
377 aa  150  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.556346 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5512  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.64 
 
 
377 aa  148  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3738  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4578  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 
377 aa  146  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3738  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 
363 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524065  normal  0.172918 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3785  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 
377 aa  146  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.76138  normal  0.119263 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0500  sensor histidine kinase/response regulator  39.81 
 
 
364 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.823251  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0581  transmembrane sensor-like domain-containing protein  29.55 
 
 
828 aa  142  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0428324  normal  0.0128662 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0252  response regulator/sensor histidine kinase  39.34 
 
 
365 aa  140  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549911  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0216  sensor histidine kinase/response regulator  39.34 
 
 
364 aa  140  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1396  response regulator/sensor histidine kinase  39.34 
 
 
365 aa  140  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2689  response regulator/sensor histidine kinase  39.34 
 
 
365 aa  140  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1593  response regulator/sensor histidine kinase  39.34 
 
 
364 aa  140  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0969  sensor histidine kinase/response regulator  39.34 
 
 
364 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2544  response regulator/sensor histidine kinase  39.34 
 
 
365 aa  140  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4653  histidine kinase  25.9 
 
 
799 aa  135  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.688546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 
625 aa  135  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2093  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 
530 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874358  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 
600 aa  126  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 
584 aa  126  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.11 
 
 
423 aa  126  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 
663 aa  124  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.296509  normal  0.022202 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
725 aa  124  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 
1021 aa  124  9e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  26.09 
 
 
565 aa  123  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 
584 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  32.33 
 
 
906 aa  122  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0604  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 
1174 aa  121  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.42995  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 
489 aa  120  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.44 
 
 
754 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2916  diguanylate cyclase with Chase2 sensor  29.63 
 
 
543 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.833203  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  27.96 
 
 
666 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0803  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 
399 aa  119  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0443  Signal transduction histidine kinase  25.24 
 
 
475 aa  119  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0008  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.35 
 
 
755 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865749 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16710  signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 
554 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0521739 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 
571 aa  117  7.999999999999999e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0429  ATP-binding region ATPase domain protein  29.89 
 
 
568 aa  117  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.796172  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 
621 aa  116  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 
701 aa  116  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 
619 aa  115  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 
2153 aa  115  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 
969 aa  115  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356606  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 
591 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.09 
 
 
758 aa  114  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 
584 aa  115  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2042  sensor histidine kinase  30.31 
 
 
351 aa  114  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711965  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.3 
 
 
590 aa  114  9e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3138  sensor histidine kinase/response regulator  30.21 
 
 
484 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.312332  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.77 
 
 
590 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 
607 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 
621 aa  114  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1502  Histidine kinase  33.33 
 
 
919 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.28 
 
 
1297 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11300  signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 
556 aa  113  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2970  histidine kinase  33.05 
 
 
387 aa  113  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1791  sensor histidine kinase  30.71 
 
 
351 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1928  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
920 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0194  ATPase domain-containing protein  32.04 
 
 
549 aa  113  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.357239  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  29.96 
 
 
406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.53 
 
 
611 aa  112  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2063  sensor histidine kinase  30.98 
 
 
357 aa  112  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000411382  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 
581 aa  112  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 
1043 aa  112  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.35 
 
 
2161 aa  111  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.354922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>