More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1371 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
639 aa  1291    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.02 
 
 
640 aa  672    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  66.72 
 
 
641 aa  853    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  92.78 
 
 
639 aa  1203    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  89.64 
 
 
639 aa  1161    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.35 
 
 
620 aa  495  9.999999999999999e-139  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.9 
 
 
614 aa  480  1e-134  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.92 
 
 
614 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.06 
 
 
613 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0444  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
613 aa  372  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0364501  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.01 
 
 
421 aa  266  8e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00283134  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  31.65 
 
 
673 aa  264  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.55 
 
 
662 aa  259  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.31 
 
 
732 aa  253  8.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  28.92 
 
 
674 aa  251  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.95 
 
 
731 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.395516  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 
691 aa  243  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 
671 aa  241  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2240  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 
672 aa  239  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 
661 aa  234  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1985  histidine kinase  28.06 
 
 
672 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.29 
 
 
730 aa  232  2e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.292082  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  28.96 
 
 
661 aa  231  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1544  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.04 
 
 
731 aa  226  1e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0820  multisensor signal transduction histidine kinase  45.88 
 
 
519 aa  223  8e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0510  Cache sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 
633 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.3 
 
 
503 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0137  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.07 
 
 
731 aa  211  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00776306  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1291  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 
690 aa  211  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 
504 aa  211  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.78 
 
 
631 aa  210  6e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.963931  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
470 aa  208  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3736  histidine kinase  28.54 
 
 
675 aa  206  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  36.99 
 
 
463 aa  205  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.54 
 
 
729 aa  205  2e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000025801 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  35.77 
 
 
1133 aa  205  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  42.59 
 
 
461 aa  204  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  42.59 
 
 
461 aa  204  5e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 
468 aa  203  6e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  42.21 
 
 
461 aa  203  7e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1828  sensor histidine kinase  27.84 
 
 
674 aa  203  9e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.719935  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  33.94 
 
 
496 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 
646 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  34.01 
 
 
508 aa  201  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1296  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.13 
 
 
729 aa  201  5e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54969  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  41.74 
 
 
1629 aa  200  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
493 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  42.21 
 
 
464 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.66 
 
 
933 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1402  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.2 
 
 
731 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.723997  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
382 aa  197  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.23 
 
 
1010 aa  197  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
467 aa  197  5.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3194  histidine kinase  27.32 
 
 
663 aa  197  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  35.63 
 
 
560 aa  196  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1764  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.17 
 
 
729 aa  196  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0298102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.33 
 
 
1162 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 
487 aa  195  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 
1026 aa  195  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  34.18 
 
 
310 aa  195  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 
383 aa  194  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0389  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.9 
 
 
729 aa  193  7e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  31.69 
 
 
473 aa  193  8e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5498  histidine kinase  26.9 
 
 
676 aa  192  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  33.15 
 
 
455 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  33.15 
 
 
455 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 
676 aa  193  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122155  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  33.24 
 
 
466 aa  192  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  35.69 
 
 
810 aa  192  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  36.42 
 
 
473 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 
473 aa  191  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
452 aa  191  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.85 
 
 
1043 aa  190  5.999999999999999e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  33.12 
 
 
356 aa  190  9e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  33.05 
 
 
468 aa  189  9e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  32.57 
 
 
466 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0169  histidine kinase  32.7 
 
 
465 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 
459 aa  189  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 
359 aa  189  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 
579 aa  188  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0842  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.79 
 
 
732 aa  188  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  32.29 
 
 
466 aa  187  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  32.29 
 
 
466 aa  187  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3720  histidine kinase  26.23 
 
 
693 aa  187  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  32.29 
 
 
466 aa  187  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  32.29 
 
 
466 aa  187  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  32.29 
 
 
466 aa  187  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0137  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.45 
 
 
732 aa  187  5e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0833  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
722 aa  187  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.357142  unclonable  0.00000000104285 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2811  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 
829 aa  187  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0142  histidine kinase  28.01 
 
 
614 aa  187  8e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  35 
 
 
470 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0312  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.42 
 
 
556 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
1119 aa  186  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1221  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
525 aa  185  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0121657 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
358 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 
471 aa  186  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 
546 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1674  histidine kinase  33.54 
 
 
352 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  31.61 
 
 
391 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>