More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1864 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 460 aa  927    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  58.67 
 
 		 589 aa  501  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.93 
 
 		 592 aa  487  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  57.36 
 
 		 537 aa  464  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.19 
 
 		 584 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.88 
 
 		 584 aa  408  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.01 
 
 		 587 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.94 
 
 		 581 aa  392  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 		 458 aa  292  7e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 		 489 aa  291  2e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 		 587 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  36.88 
 
 		 587 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  36.88 
 
 		 587 aa  282  9e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  36.64 
 
 		 587 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.42 
 
 		 453 aa  280  4e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  36.88 
 
 		 587 aa  279  6e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  36.88 
 
 		 587 aa  279  6e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  36.64 
 
 		 587 aa  279  9e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  36.64 
 
 		 587 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  36.64 
 
 		 587 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 585 aa  278  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  36.41 
 
 		 587 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 		 444 aa  271  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 		 585 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 594 aa  269  7e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 		 608 aa  269  8.999999999999999e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.48 
 
 		 599 aa  266  7e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 607 aa  265  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 		 590 aa  263  6.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  37.81 
 
 		 581 aa  261  2e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 600 aa  258  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2010  sensory box histidine kinase  34.01 
 
 		 571 aa  258  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 456 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1728  sensory box histidine kinase  33.33 
 
 		 571 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00635742  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 590 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 608 aa  253  5.000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  37.98 
 
 		 581 aa  251  2e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0985  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 597 aa  251  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0752971 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 571 aa  251  3e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 582 aa  249  6e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.7 
 
 		 591 aa  249  6e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 		 581 aa  249  1e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 612 aa  247  4e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  33.82 
 
 		 598 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  40.71 
 
 		 346 aa  244  3e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1201  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 		 591 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.911638  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  40.15 
 
 		 591 aa  242  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 		 597 aa  242  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 621 aa  240  4e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2551  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.36 
 
 		 401 aa  239  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.14 
 
 		 418 aa  239  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1949  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 623 aa  238  2e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 597 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2891  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 		 615 aa  237  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.031526 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 596 aa  236  6e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 608 aa  236  8e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.83 
 
 		 595 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.437679  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 619 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 		 611 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 		 571 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 		 589 aa  233  5e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000411549  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 604 aa  233  6e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  33.64 
 
 		 613 aa  232  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1387  sensor histidine kinase ResE  34.91 
 
 		 591 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1498  sensor histidine kinase ResE  34.91 
 
 		 591 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000125371  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3813  sensor histidine kinase ResE  34.91 
 
 		 591 aa  232  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000821443  hitchhiker  2.81471e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1602  sensor histidine kinase ResE  34.67 
 
 		 591 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1532  sensor histidine kinase ResE  34.91 
 
 		 591 aa  231  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0525759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1638  sensor histidine kinase ResE  34.67 
 
 		 591 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1359  sensor histidine kinase  34.67 
 
 		 591 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.805336  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1360  sensor histidine kinase  34.67 
 
 		 591 aa  231  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000268966  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  35.48 
 
 		 584 aa  230  3e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1570  sensor histidine kinase ResE  34.67 
 
 		 591 aa  231  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4159100000000003e-40 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  34.43 
 
 		 565 aa  230  4e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 621 aa  228  1e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4008  histidine kinase  44.9 
 
 		 376 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 609 aa  224  4e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  33.64 
 
 		 613 aa  224  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  33.64 
 
 		 613 aa  224  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5571  sensory box histidine kinase YycG  33.64 
 
 		 613 aa  223  6e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51773e-30 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5146  sensor histidine kinase  33.64 
 
 		 613 aa  223  6e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5649  sensory box histidine kinase YycG  33.64 
 
 		 613 aa  223  6e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0306249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5162  sensor histidine kinase  33.64 
 
 		 613 aa  223  8e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5614  sensory box histidine kinase YycG  33.41 
 
 		 613 aa  222  9e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5588  sensory box histidine kinase YycG  33.41 
 
 		 613 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.8382  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  34.29 
 
 		 599 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 		 602 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  32.06 
 
 		 554 aa  221  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 554 aa  221  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0019  PAS sensor protein  31.9 
 
 		 608 aa  220  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0019  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 608 aa  220  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4124  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.95 
 
 		 376 aa  219  7e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.21839  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 585 aa  219  7.999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 593 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.95 
 
 		 376 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 		 468 aa  218  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0416  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.17 
 
 		 377 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611617 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0443  Signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 475 aa  215  9.999999999999999e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 590 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1486  histidine kinase  44.94 
 
 		 575 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>