More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4164 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4941  sensor histidine kinase  55.96 
 
 		 799 aa  770    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176481  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4164  putative periplasmic CHASE2 sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 819 aa  1635    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1075  two-component system sensor histidine kinase transcription regulator protein  45.2 
 
 		 784 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.708175 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0941  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 		 777 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1006  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.67 
 
 		 777 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 757 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.856998  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1069  CHASE domain-containing protein/sensory box histidine kinase  37.87 
 
 		 751 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11630  putative two-component sensor  37.66 
 
 		 766 aa  396  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1659  Chase sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 828 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0485776 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 794 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.0500426 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1318  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 		 795 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4582  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 795 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 795 aa  382  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458643  normal  0.624704 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1416  histidine kinase  35.22 
 
 		 795 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0924  sensor histidine kinase  33.79 
 
 		 797 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2636  sensor histidine kinase  34.19 
 
 		 759 aa  379  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0956  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 795 aa  379  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00439356  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0738  sensor histidine kinase  33.79 
 
 		 797 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 795 aa  379  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.564395  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1457  sensor histidine kinase  33.79 
 
 		 797 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0425  sensor histidine kinase  33.79 
 
 		 797 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.299792  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1843  sensor histidine kinase  33.54 
 
 		 797 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562935  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1688  sensor histidine kinase  33.66 
 
 		 797 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1666  sensor histidine kinase  33.66 
 
 		 797 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.672693  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 829 aa  363  9e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.583983  hitchhiker  0.00918197 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 785 aa  343  7e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.830566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 754 aa  342  1e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5418  histidine kinase  35.78 
 
 		 789 aa  332  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6238  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 		 737 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.438492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0006  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 513 aa  221  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000267267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1427  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 		 776 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430091  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2532  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 		 854 aa  154  8e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0581  transmembrane sensor-like domain-containing protein  31.25 
 
 		 828 aa  147  7.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0428324  normal  0.0128662 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4947  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 377 aa  146  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0216  sensor histidine kinase/response regulator  41.46 
 
 		 364 aa  146  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0252  response regulator/sensor histidine kinase  41.46 
 
 		 365 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549911  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2544  response regulator/sensor histidine kinase  41.46 
 
 		 365 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2689  response regulator/sensor histidine kinase  41.46 
 
 		 365 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1396  response regulator/sensor histidine kinase  41.46 
 
 		 365 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1593  response regulator/sensor histidine kinase  41.46 
 
 		 364 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0969  sensor histidine kinase/response regulator  40.98 
 
 		 364 aa  144  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0500  sensor histidine kinase/response regulator  40.49 
 
 		 364 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.823251  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4653  histidine kinase  26.66 
 
 		 799 aa  141  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.688546 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 489 aa  140  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2309  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 377 aa  137  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.556346 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1324  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 		 645 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92156  normal  0.730063 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5512  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 		 377 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4578  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 		 377 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3785  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 		 377 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.76138  normal  0.119263 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3738  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 		 363 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524065  normal  0.172918 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  36.47 
 
 		 591 aa  134  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3678  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 363 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 458 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 594 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  28.09 
 
 		 1046 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2916  diguanylate cyclase with Chase2 sensor  30.93 
 
 		 543 aa  130  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.833203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0194  ATPase domain-containing protein  35.74 
 
 		 549 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.357239  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  25.83 
 
 		 762 aa  126  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  27.27 
 
 		 582 aa  125  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 371 aa  124  7e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  27.99 
 
 		 584 aa  124  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  32.3 
 
 		 470 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 625 aa  123  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 2783 aa  124  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 444 aa  123  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 1017 aa  122  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 1014 aa  121  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 1010 aa  121  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2879  histidine kinase  34.15 
 
 		 553 aa  120  7.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  32.63 
 
 		 539 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 589 aa  120  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.306932  normal  0.158909 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 		 754 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0247  ATPase domain-containing protein  35.59 
 
 		 628 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 827 aa  118  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 581 aa  118  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2811  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 		 498 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.782124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 587 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 546 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2621  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 610 aa  117  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 412 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 634 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 412 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  31.15 
 
 		 587 aa  115  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  32.5 
 
 		 392 aa  115  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  31.15 
 
 		 587 aa  115  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  31.15 
 
 		 587 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  31.15 
 
 		 587 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  31.15 
 
 		 587 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72390  putative two-component sensor  29.53 
 
 		 595 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  27 
 
 		 617 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 418 aa  115  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7663  histidine kinase  34.5 
 
 		 639 aa  114  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0008  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 755 aa  114  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865749 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0286  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 424 aa  114  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.136894  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  30.77 
 
 		 587 aa  114  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0264  PAS  30.83 
 
 		 595 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2460  histidine kinase  33.48 
 
 		 415 aa  114  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2530  histidine kinase  31.94 
 
 		 439 aa  114  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  31.15 
 
 		 587 aa  114  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 		 758 aa  114  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>