More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7663 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7663  histidine kinase  100 
 
 
639 aa  1264    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113237  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1324  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  55.19 
 
 
645 aa  627  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92156  normal  0.730063 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1416  histidine kinase  44.2 
 
 
795 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0956  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.2 
 
 
795 aa  184  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00439356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.2 
 
 
795 aa  184  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.564395  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 
794 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.0500426 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4582  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.2 
 
 
795 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2636  sensor histidine kinase  44.39 
 
 
759 aa  181  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1688  sensor histidine kinase  43.95 
 
 
797 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1843  sensor histidine kinase  43.95 
 
 
797 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562935  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1318  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 
795 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1666  sensor histidine kinase  43.95 
 
 
797 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.672693  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0738  sensor histidine kinase  43.5 
 
 
797 aa  178  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0924  sensor histidine kinase  43.5 
 
 
797 aa  178  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0425  sensor histidine kinase  43.5 
 
 
797 aa  178  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.299792  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1457  sensor histidine kinase  43.5 
 
 
797 aa  178  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 
795 aa  176  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458643  normal  0.624704 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1659  Chase sensor signal transduction histidine kinase  43.59 
 
 
828 aa  171  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0485776 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
829 aa  170  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.583983  hitchhiker  0.00918197 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
757 aa  145  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.856998  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 
754 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0941  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 
777 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1069  CHASE domain-containing protein/sensory box histidine kinase  37.83 
 
 
751 aa  138  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1006  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 
777 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11630  putative two-component sensor  37.95 
 
 
766 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1075  two-component system sensor histidine kinase transcription regulator protein  38.7 
 
 
784 aa  134  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.708175 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2532  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 
854 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4947  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 
377 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 
681 aa  122  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000333563  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4941  sensor histidine kinase  35.56 
 
 
799 aa  120  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176481  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1427  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 
776 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430091  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0500  sensor histidine kinase/response regulator  35.22 
 
 
364 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.823251  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0969  sensor histidine kinase/response regulator  34.78 
 
 
364 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3678  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
363 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4977  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1593  response regulator/sensor histidine kinase  34.78 
 
 
364 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0252  response regulator/sensor histidine kinase  34.78 
 
 
365 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549911  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2544  response regulator/sensor histidine kinase  34.78 
 
 
365 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2689  response regulator/sensor histidine kinase  34.78 
 
 
365 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1396  response regulator/sensor histidine kinase  34.78 
 
 
365 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0216  sensor histidine kinase/response regulator  34.78 
 
 
364 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5418  histidine kinase  33.04 
 
 
789 aa  116  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5512  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
377 aa  115  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3738  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4164  putative periplasmic CHASE2 sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 
819 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0006  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
513 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000267267  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2309  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 
377 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.556346 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3738  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 
363 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524065  normal  0.172918 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0581  transmembrane sensor-like domain-containing protein  32.31 
 
 
828 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0428324  normal  0.0128662 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4578  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 
377 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3785  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 
377 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.76138  normal  0.119263 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 
785 aa  110  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.830566  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  29.88 
 
 
617 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  29.37 
 
 
501 aa  108  4e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  29.3 
 
 
560 aa  108  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  32.14 
 
 
593 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  31.88 
 
 
406 aa  106  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
817 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0849  histidine kinase  31.97 
 
 
422 aa  106  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4653  histidine kinase  33.93 
 
 
799 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.688546 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2626  diguanylate cyclase  29.49 
 
 
591 aa  105  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.138484  normal  0.0100044 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  28.71 
 
 
463 aa  104  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31890  signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 
394 aa  104  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00340  signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 
500 aa  104  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00418447  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 
515 aa  103  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3370  PAS sensor protein  27.24 
 
 
713 aa  103  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.277761  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0045  histidine kinase  32.19 
 
 
370 aa  103  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1010  histidine kinase  29.79 
 
 
572 aa  103  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0817847 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4114  histidine kinase  34.18 
 
 
268 aa  102  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0596823  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2970  histidine kinase  33.62 
 
 
387 aa  102  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
1195 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  29.13 
 
 
599 aa  102  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6238  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
737 aa  101  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.438492  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3055  histidine kinase  27.19 
 
 
562 aa  100  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
444 aa  100  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2797  histidine kinase  29.37 
 
 
583 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05068  composite two-component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  32.33 
 
 
676 aa  100  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.52 
 
 
1352 aa  99.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  26.39 
 
 
461 aa  99.8  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1190  histidine kinase  32.61 
 
 
646 aa  100  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  23.76 
 
 
491 aa  100  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
620 aa  100  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03740  PhoR-like protein  31.92 
 
 
409 aa  99.4  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172965  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 
1042 aa  99  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 
587 aa  99.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4530  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 
492 aa  99.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0351302  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0775  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 
449 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82168  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0803  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 
399 aa  99.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  26.29 
 
 
582 aa  99.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1928  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 
920 aa  99  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 
885 aa  98.6  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1986  sensor protein VanS  26.97 
 
 
291 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.871173  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  31.72 
 
 
469 aa  98.2  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 
423 aa  98.6  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
458 aa  98.2  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0089  histidine kinase  33.76 
 
 
382 aa  98.2  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 
634 aa  98.2  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 
639 aa  97.8  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1099  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 
430 aa  97.8  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.000000024984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2801  diguanylate cyclase  27.16 
 
 
628 aa  97.8  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.615763  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  27.04 
 
 
906 aa  97.4  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  27.71 
 
 
458 aa  97.4  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>