More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_11630 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1069  CHASE domain-containing protein/sensory box histidine kinase  90.8 
 
 
751 aa  1262    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11630  putative two-component sensor  100 
 
 
766 aa  1505    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0006  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  59.57 
 
 
513 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000267267  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1659  Chase sensor signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 
828 aa  429  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0485776 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2636  sensor histidine kinase  39.79 
 
 
759 aa  420  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0941  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.42 
 
 
777 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0924  sensor histidine kinase  37.96 
 
 
797 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4582  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 
795 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1416  histidine kinase  37.14 
 
 
795 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4164  putative periplasmic CHASE2 sensor signal transduction histidine kinase  38.42 
 
 
819 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0956  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 
795 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00439356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 
795 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.564395  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1457  sensor histidine kinase  37.96 
 
 
797 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0425  sensor histidine kinase  37.96 
 
 
797 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.299792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1666  sensor histidine kinase  37.99 
 
 
797 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.672693  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1688  sensor histidine kinase  37.99 
 
 
797 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0738  sensor histidine kinase  37.96 
 
 
797 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1843  sensor histidine kinase  37.96 
 
 
797 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562935  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1318  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 
795 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1006  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 
777 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 
795 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458643  normal  0.624704 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 
829 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.583983  hitchhiker  0.00918197 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 
794 aa  395  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.0500426 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 
757 aa  392  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.856998  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4941  sensor histidine kinase  36.88 
 
 
799 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176481  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1075  two-component system sensor histidine kinase transcription regulator protein  38.06 
 
 
784 aa  373  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.708175 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 
754 aa  366  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 
785 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.830566  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1427  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 
776 aa  203  9e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430091  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0474  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.2 
 
 
759 aa  187  9e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.453015  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2532  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 
854 aa  168  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2916  diguanylate cyclase with Chase2 sensor  38.53 
 
 
543 aa  159  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.833203  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4653  histidine kinase  27.97 
 
 
799 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.688546 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1324  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
645 aa  154  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92156  normal  0.730063 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6238  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 
737 aa  153  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.438492  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0581  transmembrane sensor-like domain-containing protein  29.61 
 
 
828 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0428324  normal  0.0128662 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7663  histidine kinase  37.95 
 
 
639 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113237  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
827 aa  131  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0429  ATP-binding region ATPase domain protein  27.12 
 
 
568 aa  128  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.796172  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5418  histidine kinase  36.12 
 
 
789 aa  128  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 
619 aa  125  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0216  sensor histidine kinase/response regulator  37.62 
 
 
364 aa  124  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 
350 aa  124  7e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1593  response regulator/sensor histidine kinase  37.62 
 
 
364 aa  124  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0500  sensor histidine kinase/response regulator  37.62 
 
 
364 aa  124  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.823251  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1396  response regulator/sensor histidine kinase  37.62 
 
 
365 aa  124  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2689  response regulator/sensor histidine kinase  37.62 
 
 
365 aa  124  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2544  response regulator/sensor histidine kinase  37.62 
 
 
365 aa  124  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0252  response regulator/sensor histidine kinase  37.62 
 
 
365 aa  124  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549911  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4947  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 
377 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0969  sensor histidine kinase/response regulator  37.13 
 
 
364 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 
611 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  27.64 
 
 
613 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2309  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 
377 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.556346 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2982  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 
608 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3738  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
363 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524065  normal  0.172918 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4578  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
377 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5512  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 
377 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3738  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3785  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
377 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.76138  normal  0.119263 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 
466 aa  118  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 
412 aa  118  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 
460 aa  117  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  27.91 
 
 
613 aa  117  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3678  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 
363 aa  117  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4977  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  27.91 
 
 
613 aa  117  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5588  sensory box histidine kinase YycG  27.91 
 
 
613 aa  117  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.8382  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.33 
 
 
412 aa  117  6e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 
444 aa  117  6.9999999999999995e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.96 
 
 
458 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 
418 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5614  sensory box histidine kinase YycG  27.64 
 
 
613 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5162  sensor histidine kinase  27.64 
 
 
613 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5649  sensory box histidine kinase YycG  27.64 
 
 
613 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0306249  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1701  PAS sensor protein  27.24 
 
 
975 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454558  hitchhiker  0.00934608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
893 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5146  sensor histidine kinase  27.64 
 
 
613 aa  115  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5571  sensory box histidine kinase YycG  27.64 
 
 
613 aa  115  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51773e-30 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.69 
 
 
758 aa  115  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 
639 aa  115  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 
584 aa  115  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 
581 aa  114  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2689  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 
402 aa  114  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10288  normal  0.570693 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
625 aa  114  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1394  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.32 
 
 
924 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.640211  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0840  histidine kinase  30.94 
 
 
363 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22580  signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
576 aa  114  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.162219  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.56 
 
 
1021 aa  114  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  30.11 
 
 
666 aa  114  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 
639 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3611  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 
566 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.716129  hitchhiker  0.000346414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  29.8 
 
 
1629 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  28.87 
 
 
614 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 
1026 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3196  histidine kinase  30.06 
 
 
356 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0721667  normal  0.0151706 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0008  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
755 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865749 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  31.36 
 
 
539 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
754 aa  112  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
422 aa  112  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
1010 aa  112  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  31.56 
 
 
392 aa  111  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>