More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1659 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_0738  sensor histidine kinase  64.11 
 
 
797 aa  971    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.44 
 
 
794 aa  964    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.0500426 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0924  sensor histidine kinase  64.11 
 
 
797 aa  971    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1843  sensor histidine kinase  64.23 
 
 
797 aa  971    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562935  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4582  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  64.69 
 
 
795 aa  978    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1688  sensor histidine kinase  64.11 
 
 
797 aa  970    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  90.6 
 
 
829 aa  1377    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.583983  hitchhiker  0.00918197 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2636  sensor histidine kinase  64.51 
 
 
759 aa  963    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1659  Chase sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
828 aa  1657    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0485776 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0956  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  64.2 
 
 
795 aa  979    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00439356  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0425  sensor histidine kinase  64.11 
 
 
797 aa  971    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.299792  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1318  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  64.94 
 
 
795 aa  989    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  64.2 
 
 
795 aa  979    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.564395  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  65.19 
 
 
795 aa  993    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458643  normal  0.624704 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1416  histidine kinase  64.07 
 
 
795 aa  976    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1457  sensor histidine kinase  64.11 
 
 
797 aa  971    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1666  sensor histidine kinase  64.11 
 
 
797 aa  970    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.672693  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.58 
 
 
754 aa  457  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 
757 aa  425  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.856998  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1069  CHASE domain-containing protein/sensory box histidine kinase  38.66 
 
 
751 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11630  putative two-component sensor  39.59 
 
 
766 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4164  putative periplasmic CHASE2 sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 
819 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1006  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
777 aa  385  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1075  two-component system sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.45 
 
 
784 aa  382  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.708175 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0941  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
777 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4941  sensor histidine kinase  34.79 
 
 
799 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176481  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5418  histidine kinase  33.75 
 
 
789 aa  295  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 
785 aa  268  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.830566  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0006  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 
513 aa  259  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000267267  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1427  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 
776 aa  197  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430091  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6238  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
737 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.438492  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2532  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 
854 aa  183  9.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1324  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.26 
 
 
645 aa  181  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92156  normal  0.730063 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7663  histidine kinase  43.59 
 
 
639 aa  171  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113237  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0581  transmembrane sensor-like domain-containing protein  32.18 
 
 
828 aa  148  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0428324  normal  0.0128662 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4947  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 
377 aa  146  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3678  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 
363 aa  145  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4977  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0216  sensor histidine kinase/response regulator  37.18 
 
 
364 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2309  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 
377 aa  142  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.556346 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2544  response regulator/sensor histidine kinase  37.18 
 
 
365 aa  142  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0252  response regulator/sensor histidine kinase  37.18 
 
 
365 aa  142  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549911  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1593  response regulator/sensor histidine kinase  37.18 
 
 
364 aa  142  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2689  response regulator/sensor histidine kinase  37.18 
 
 
365 aa  142  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1396  response regulator/sensor histidine kinase  37.18 
 
 
365 aa  142  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0969  sensor histidine kinase/response regulator  37.18 
 
 
364 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5512  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 
377 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3738  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0500  sensor histidine kinase/response regulator  36.75 
 
 
364 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.823251  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3738  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 
363 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524065  normal  0.172918 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4578  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 
377 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3785  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 
377 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.76138  normal  0.119263 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
458 aa  134  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 
581 aa  132  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 
600 aa  130  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 
584 aa  129  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  30.82 
 
 
666 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4653  histidine kinase  36.19 
 
 
799 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.688546 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0849  histidine kinase  30.04 
 
 
422 aa  127  9e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0803  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 
399 aa  126  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 
584 aa  126  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2970  histidine kinase  34.6 
 
 
387 aa  125  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 
489 aa  125  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.02 
 
 
1021 aa  125  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 
625 aa  124  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  30.04 
 
 
406 aa  123  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 
591 aa  123  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 
423 aa  122  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  32.79 
 
 
412 aa  122  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  33.05 
 
 
392 aa  122  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0656  histidine kinase  33.33 
 
 
423 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  hitchhiker  0.000112201 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  31.84 
 
 
906 aa  121  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0498  histidine kinase  34.33 
 
 
391 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0553  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 
321 aa  120  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 
634 aa  120  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2916  diguanylate cyclase with Chase2 sensor  30.16 
 
 
543 aa  120  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.833203  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  30.6 
 
 
470 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 
408 aa  120  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.08 
 
 
597 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  32.71 
 
 
584 aa  119  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
584 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31890  signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 
394 aa  119  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1267  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 
542 aa  119  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 
1060 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03690  histidine kinase  32.82 
 
 
398 aa  117  6e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.156811 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  23.7 
 
 
565 aa  117  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 
599 aa  117  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0613  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 
472 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773099  normal  0.773415 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 
594 aa  116  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  26.32 
 
 
346 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 
453 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4440  histidine kinase  33.2 
 
 
480 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  27.07 
 
 
599 aa  116  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  27.7 
 
 
598 aa  115  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 
582 aa  115  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 
608 aa  115  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0960  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.89 
 
 
397 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.874918  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4603  histidine kinase  32.3 
 
 
414 aa  115  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03740  PhoR-like protein  33.06 
 
 
409 aa  115  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172965  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 
621 aa  115  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.25 
 
 
621 aa  114  7.000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0770  histidine kinase  31.45 
 
 
397 aa  114  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.523628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>