More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0656 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0656  histidine kinase  100 
 
 
423 aa  811    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  hitchhiker  0.000112201 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2970  histidine kinase  71.78 
 
 
387 aa  503  1e-141  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31890  signal transduction histidine kinase  69.27 
 
 
394 aa  493  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2084  histidine kinase  60.37 
 
 
393 aa  451  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115091  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0770  histidine kinase  60.57 
 
 
397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  55.59 
 
 
406 aa  398  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0849  histidine kinase  56.95 
 
 
422 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0895  histidine kinase  54.7 
 
 
435 aa  363  4e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0538379  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  57.14 
 
 
412 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03740  PhoR-like protein  53.17 
 
 
409 aa  358  9.999999999999999e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172965  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0498  histidine kinase  55.77 
 
 
391 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  54.37 
 
 
392 aa  354  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0960  Signal transduction histidine kinase-like protein  55.56 
 
 
397 aa  353  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.874918  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09300  histidine kinase  51.47 
 
 
415 aa  351  2e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4321  histidine kinase  51.06 
 
 
391 aa  332  7.000000000000001e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2909  sensor histidine kinase  54.72 
 
 
377 aa  327  3e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4603  histidine kinase  54.34 
 
 
414 aa  322  9.999999999999999e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03690  histidine kinase  48.14 
 
 
398 aa  320  3e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.156811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  52.94 
 
 
465 aa  313  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.854948 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0470  histidine kinase  54.17 
 
 
425 aa  305  9.000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.53157 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4045  ATPase domain-containing protein  53.99 
 
 
384 aa  289  6e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0089  histidine kinase  48.08 
 
 
382 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0830  histidine kinase  47.92 
 
 
401 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02680  histidine kinase  58.43 
 
 
416 aa  271  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0653  histidine kinase  50.45 
 
 
392 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.550113 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0660  histidine kinase  50.45 
 
 
392 aa  266  8e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0673  histidine kinase  50.45 
 
 
392 aa  266  8e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.692637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0403  histidine kinase  48.84 
 
 
425 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00335965 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0083  histidine kinase  57.08 
 
 
402 aa  265  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0579  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.68 
 
 
401 aa  264  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0336  histidine kinase  47.43 
 
 
410 aa  263  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4930  histidine kinase  49.54 
 
 
397 aa  260  4e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1074  signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 
443 aa  257  2e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0653  histidine kinase  57.85 
 
 
397 aa  251  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6750  histidine kinase  47.47 
 
 
394 aa  250  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479634  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10498  two component system sensor histidine kinase senX3  45.09 
 
 
410 aa  249  8e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.19354e-61  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0996  ATP-binding region ATPase domain protein  43.67 
 
 
483 aa  216  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.03 
 
 
584 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.61 
 
 
584 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  39.06 
 
 
565 aa  194  2e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  46.18 
 
 
347 aa  194  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 
582 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  43.88 
 
 
584 aa  186  5e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.02 
 
 
581 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  39.92 
 
 
554 aa  183  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
554 aa  183  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.81 
 
 
596 aa  183  6e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
599 aa  182  7e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.07 
 
 
589 aa  182  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  40.68 
 
 
599 aa  181  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  45.87 
 
 
257 aa  179  5.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1599  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 
556 aa  179  7e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.928385  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 
489 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
585 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.13 
 
 
581 aa  178  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1486  histidine kinase  41.32 
 
 
575 aa  177  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 
458 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41 
 
 
592 aa  176  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  39.59 
 
 
581 aa  176  8e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 
600 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1042  histidine kinase  41.26 
 
 
438 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0389643  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2915  two-component sensor histidine kinase  43.32 
 
 
346 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 
608 aa  173  5e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1559  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.32 
 
 
346 aa  173  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306197  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.23 
 
 
571 aa  173  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151303  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  32.72 
 
 
346 aa  172  7.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  36.17 
 
 
598 aa  172  9e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0958  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
440 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770114  normal  0.0682778 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1278  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.2 
 
 
460 aa  172  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00211916  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1535  phosphate regulon two-component sensor kinase transcription regulator protein  41.5 
 
 
443 aa  172  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.777366 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 
591 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1659  histidine kinase  43.6 
 
 
433 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.455173  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2767  histidine protein kinase PhoR  41.82 
 
 
436 aa  170  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0684991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 
587 aa  170  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 
437 aa  170  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0308892 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1491  phosphate regulon sensor protein PhoR  41.82 
 
 
436 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.690525  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0786  histidine protein kinase PhoR  41.82 
 
 
436 aa  169  9e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 
590 aa  169  9e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0580  histidine protein kinase PhoR  41.82 
 
 
436 aa  169  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211794  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2569  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.96 
 
 
429 aa  169  9e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0571  histidine protein kinase PhoR  41.82 
 
 
448 aa  169  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0483305  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1297  histidine protein kinase PhoR  41.82 
 
 
436 aa  169  9e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 
446 aa  169  9e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1522  phosphate regulon sensor protein PhoR  41.82 
 
 
436 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1625  phosphate regulon sensor protein phoR  41.82 
 
 
436 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0803  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 
399 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  40.41 
 
 
490 aa  169  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1183  histidine kinase  41.54 
 
 
439 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.965515  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1195  histidine kinase  41.54 
 
 
439 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.843993  normal  0.58507 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 
440 aa  168  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  38.62 
 
 
581 aa  168  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  35.74 
 
 
587 aa  168  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 
442 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000310244  normal  0.666466 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1272  phosphate sensor signal transduction histidine kinase, PhoR  38.21 
 
 
437 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54553  normal  0.265376 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2179  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 
450 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0821268 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  35.74 
 
 
587 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.67 
 
 
422 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 
437 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4449  histidine kinase  41.42 
 
 
439 aa  167  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.912128 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  35.74 
 
 
587 aa  167  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>