More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_31890 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_31890  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 394 aa  763    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2084  histidine kinase  68.31 
 
 		 393 aa  499  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2970  histidine kinase  68.88 
 
 		 387 aa  498  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0656  histidine kinase  68.41 
 
 		 423 aa  490  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  hitchhiker  0.000112201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0770  histidine kinase  59.68 
 
 		 397 aa  404  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  56.99 
 
 		 406 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0849  histidine kinase  56.76 
 
 		 422 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03740  PhoR-like protein  53.12 
 
 		 409 aa  357  1.9999999999999998e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172965  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0498  histidine kinase  54.09 
 
 		 391 aa  352  8e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  52.05 
 
 		 392 aa  339  4e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0960  Signal transduction histidine kinase-like protein  51.69 
 
 		 397 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.874918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0895  histidine kinase  51.03 
 
 		 435 aa  337  2.9999999999999997e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0538379  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  56.76 
 
 		 412 aa  334  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09300  histidine kinase  47.64 
 
 		 415 aa  331  1e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2909  sensor histidine kinase  51.2 
 
 		 377 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4321  histidine kinase  48.94 
 
 		 391 aa  301  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03690  histidine kinase  46.34 
 
 		 398 aa  298  1e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.156811 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4603  histidine kinase  50.99 
 
 		 414 aa  296  5e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  51.95 
 
 		 465 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.854948 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02680  histidine kinase  59.58 
 
 		 416 aa  271  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0470  histidine kinase  49.85 
 
 		 425 aa  271  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.53157 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0830  histidine kinase  46.41 
 
 		 401 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4045  ATPase domain-containing protein  48.53 
 
 		 384 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0089  histidine kinase  48.08 
 
 		 382 aa  269  8e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1074  signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 443 aa  263  4e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4930  histidine kinase  53.75 
 
 		 397 aa  256  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0653  histidine kinase  56.91 
 
 		 397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0083  histidine kinase  51.69 
 
 		 402 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0336  histidine kinase  44.96 
 
 		 410 aa  243  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0653  histidine kinase  51.09 
 
 		 392 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.550113 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0660  histidine kinase  51.09 
 
 		 392 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0673  histidine kinase  51.09 
 
 		 392 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.692637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6750  histidine kinase  46.92 
 
 		 394 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479634  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0403  histidine kinase  46.63 
 
 		 425 aa  239  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335965 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0579  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.77 
 
 		 401 aa  233  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10498  two component system sensor histidine kinase senX3  40.36 
 
 		 410 aa  223  4e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.19354e-61  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0996  ATP-binding region ATPase domain protein  45.37 
 
 		 483 aa  216  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  44.57 
 
 		 347 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.67 
 
 		 582 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  45.15 
 
 		 257 aa  189  8e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  36.99 
 
 		 587 aa  182  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  36.64 
 
 		 587 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  36.99 
 
 		 587 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 		 587 aa  180  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 		 585 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 		 589 aa  179  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  35.21 
 
 		 584 aa  179  9e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  38.49 
 
 		 587 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  38.49 
 
 		 587 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.07 
 
 		 584 aa  178  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  38.49 
 
 		 587 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  38.49 
 
 		 587 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  38.49 
 
 		 587 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.07 
 
 		 584 aa  177  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  38.49 
 
 		 587 aa  177  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  40.66 
 
 		 599 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1278  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 		 460 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00211916  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 		 571 aa  172  7.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 		 599 aa  172  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1297  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000005048  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.62 
 
 		 596 aa  171  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0308892 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1599  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.24 
 
 		 556 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.928385  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 585 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1054  histidine kinase  37.74 
 
 		 436 aa  170  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814283  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  39.06 
 
 		 554 aa  170  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 		 554 aa  170  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1559  phosphate regulon sensor protein PhoR  32.59 
 
 		 432 aa  170  5e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1272  phosphate sensor signal transduction histidine kinase, PhoR  38.04 
 
 		 437 aa  170  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54553  normal  0.265376 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  38.72 
 
 		 565 aa  169  7e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 600 aa  169  8e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.88 
 
 		 581 aa  169  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2776  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 432 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000654032  decreased coverage  0.000247019 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2878  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 432 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000200806  hitchhiker  0.00000878354 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 437 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1404  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 432 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000894019  normal  0.0243022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1365  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 432 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000304613  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2980  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 432 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000022152  hitchhiker  0.00348527 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2968  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 		 439 aa  167  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000115911  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1379  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 432 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000050186  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3302  putative PAS/PAC sensor protein  32.34 
 
 		 439 aa  166  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000529502  decreased coverage  0.00000000230896 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 489 aa  166  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1659  histidine kinase  37.18 
 
 		 433 aa  166  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.455173  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  41.25 
 
 		 537 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2569  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.16 
 
 		 429 aa  166  5.9999999999999996e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 595 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.437679  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2708  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 432 aa  166  9e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000004963  decreased coverage  0.000000358257 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2551  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 		 401 aa  165  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  42.74 
 
 		 591 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39 
 
 		 346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.306668  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1486  histidine kinase  39.76 
 
 		 575 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0228  histidine kinase  38.58 
 
 		 438 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 458 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  39.75 
 
 		 352 aa  164  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1042  histidine kinase  38.64 
 
 		 438 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0389643  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48530  phosphate regulon histidine protein kinase; PhoR  33.93 
 
 		 440 aa  163  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.771609  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 		 592 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 590 aa  162  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1535  phosphate regulon two-component sensor kinase transcription regulator protein  37.71 
 
 		 443 aa  161  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.777366 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 		 591 aa  161  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>