More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0941 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1006  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  97.17 
 
 		 777 aa  1483    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1075  two-component system sensor histidine kinase transcription regulator protein  77.16 
 
 		 784 aa  1116    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.708175 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0941  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 777 aa  1523    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4941  sensor histidine kinase  47.06 
 
 		 799 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176481  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4164  putative periplasmic CHASE2 sensor signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 		 819 aa  560  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1416  histidine kinase  36.95 
 
 		 795 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4582  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 795 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0956  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 795 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00439356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 795 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.564395  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 754 aa  398  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2636  sensor histidine kinase  35.63 
 
 		 759 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1318  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 795 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0924  sensor histidine kinase  34.8 
 
 		 797 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1688  sensor histidine kinase  34.8 
 
 		 797 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1843  sensor histidine kinase  34.68 
 
 		 797 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562935  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0738  sensor histidine kinase  34.8 
 
 		 797 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 795 aa  382  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458643  normal  0.624704 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0425  sensor histidine kinase  34.8 
 
 		 797 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.299792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1666  sensor histidine kinase  34.8 
 
 		 797 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.672693  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1457  sensor histidine kinase  34.8 
 
 		 797 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 794 aa  378  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.0500426 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11630  putative two-component sensor  38.65 
 
 		 766 aa  379  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.79 
 
 		 757 aa  375  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.856998  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1069  CHASE domain-containing protein/sensory box histidine kinase  36.51 
 
 		 751 aa  369  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1659  Chase sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 828 aa  366  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0485776 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 829 aa  351  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.583983  hitchhiker  0.00918197 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 785 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.830566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5418  histidine kinase  34.65 
 
 		 789 aa  298  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6238  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 737 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.438492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1427  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 776 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0006  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 		 513 aa  208  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000267267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2532  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 		 854 aa  177  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4653  histidine kinase  28.26 
 
 		 799 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.688546 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1324  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 645 aa  155  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92156  normal  0.730063 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0474  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.23 
 
 		 759 aa  141  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.453015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7663  histidine kinase  39.06 
 
 		 639 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2916  diguanylate cyclase with Chase2 sensor  36.49 
 
 		 543 aa  139  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.833203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0581  transmembrane sensor-like domain-containing protein  31.45 
 
 		 828 aa  137  9e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0428324  normal  0.0128662 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0775  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 449 aa  135  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82168  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4947  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.21 
 
 		 377 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 591 aa  132  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.81 
 
 		 944 aa  131  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  33.47 
 
 		 587 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  33.47 
 
 		 587 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 444 aa  130  8.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  33.47 
 
 		 587 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31890  signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 		 394 aa  130  9.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  33.06 
 
 		 587 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  33.47 
 
 		 587 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3678  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 		 363 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0634  histidine kinase  36.14 
 
 		 450 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  33.06 
 
 		 587 aa  129  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  33.06 
 
 		 587 aa  129  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  33.06 
 
 		 587 aa  129  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2544  response regulator/sensor histidine kinase  38.86 
 
 		 365 aa  128  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  33.06 
 
 		 587 aa  129  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0757  two component sensor histidine kinase  33.73 
 
 		 435 aa  128  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0252  response regulator/sensor histidine kinase  38.86 
 
 		 365 aa  128  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 584 aa  129  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1593  response regulator/sensor histidine kinase  38.86 
 
 		 364 aa  128  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2689  response regulator/sensor histidine kinase  38.86 
 
 		 365 aa  128  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1396  response regulator/sensor histidine kinase  38.86 
 
 		 365 aa  128  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0500  sensor histidine kinase/response regulator  38.86 
 
 		 364 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.823251  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 		 754 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0216  sensor histidine kinase/response regulator  38.86 
 
 		 364 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0969  sensor histidine kinase/response regulator  38.86 
 
 		 364 aa  128  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5512  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 		 377 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 1029 aa  127  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  32.37 
 
 		 406 aa  127  9e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0089  histidine kinase  35.39 
 
 		 382 aa  127  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 587 aa  126  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0887  ATP-binding region, ATPase-like  34.26 
 
 		 451 aa  125  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 1014 aa  124  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  32.58 
 
 		 591 aa  124  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0099  signal transduction histidine kinase-like protein  34.33 
 
 		 938 aa  124  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.878773 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0008  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 755 aa  124  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865749 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2084  histidine kinase  34.58 
 
 		 393 aa  124  8e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0849  histidine kinase  33.33 
 
 		 422 aa  123  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2309  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 377 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.556346 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 793 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.55 
 
 		 827 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0505  Signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 417 aa  122  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 585 aa  122  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0840  histidine kinase  32.49 
 
 		 363 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 932 aa  121  3.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 		 412 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3738  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 363 aa  121  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524065  normal  0.172918 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4578  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 377 aa  120  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3785  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 377 aa  120  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.76138  normal  0.119263 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  31.42 
 
 		 762 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3138  sensor histidine kinase/response regulator  33.47 
 
 		 484 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.312332  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  31.84 
 
 		 257 aa  120  7.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 		 412 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0770  histidine kinase  36.25 
 
 		 397 aa  120  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 637 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  35.15 
 
 		 465 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.854948 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03740  PhoR-like protein  33.89 
 
 		 409 aa  119  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172965  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0656  histidine kinase  36.14 
 
 		 423 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  hitchhiker  0.000112201 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 663 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.296509  normal  0.022202 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 592 aa  119  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>