More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6146 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  100 
 
 		 465 aa  901    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.854948 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0470  histidine kinase  75 
 
 		 425 aa  508  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.53157 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  55.16 
 
 		 412 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4603  histidine kinase  53.58 
 
 		 414 aa  336  5.999999999999999e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0498  histidine kinase  53.18 
 
 		 391 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0960  Signal transduction histidine kinase-like protein  53.62 
 
 		 397 aa  322  9.000000000000001e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.874918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0656  histidine kinase  53.1 
 
 		 423 aa  312  1e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  hitchhiker  0.000112201 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0895  histidine kinase  51.82 
 
 		 435 aa  311  1e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0538379  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4321  histidine kinase  51.14 
 
 		 391 aa  307  3e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2909  sensor histidine kinase  53.78 
 
 		 377 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2970  histidine kinase  51.12 
 
 		 387 aa  303  5.000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  50.89 
 
 		 392 aa  298  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  50 
 
 		 406 aa  295  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0089  histidine kinase  49.85 
 
 		 382 aa  290  4e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0849  histidine kinase  51.79 
 
 		 422 aa  288  1e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31890  signal transduction histidine kinase  49.42 
 
 		 394 aa  288  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2084  histidine kinase  48.06 
 
 		 393 aa  288  2e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02680  histidine kinase  48.98 
 
 		 416 aa  287  4e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0830  histidine kinase  47.79 
 
 		 401 aa  286  5e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0770  histidine kinase  49.85 
 
 		 397 aa  285  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03740  PhoR-like protein  49.84 
 
 		 409 aa  285  2.0000000000000002e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172965  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09300  histidine kinase  50 
 
 		 415 aa  281  1e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0083  histidine kinase  55.26 
 
 		 402 aa  278  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0653  histidine kinase  49.03 
 
 		 397 aa  276  5e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0336  histidine kinase  49.34 
 
 		 410 aa  276  6e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0579  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.86 
 
 		 401 aa  271  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0403  histidine kinase  51.58 
 
 		 425 aa  270  4e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335965 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10498  two component system sensor histidine kinase senX3  46.31 
 
 		 410 aa  269  8e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.19354e-61  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0653  histidine kinase  47.79 
 
 		 392 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.550113 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0660  histidine kinase  47.79 
 
 		 392 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0673  histidine kinase  47.79 
 
 		 392 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.692637 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03690  histidine kinase  49.01 
 
 		 398 aa  265  1e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.156811 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6750  histidine kinase  52.51 
 
 		 394 aa  259  6e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479634  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4930  histidine kinase  44.29 
 
 		 397 aa  255  9e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4045  ATPase domain-containing protein  50.61 
 
 		 384 aa  249  9e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1074  signal transduction histidine kinase  38.48 
 
 		 443 aa  238  1e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0996  ATP-binding region ATPase domain protein  41.11 
 
 		 483 aa  211  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  50 
 
 		 347 aa  207  5e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.93 
 
 		 582 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  37.35 
 
 		 581 aa  197  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  46.12 
 
 		 257 aa  196  9e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 581 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 		 584 aa  192  9e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 584 aa  190  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 489 aa  187  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 571 aa  187  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.78 
 
 		 581 aa  186  6e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  41.49 
 
 		 584 aa  186  7e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  35.96 
 
 		 581 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 		 458 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  36.66 
 
 		 537 aa  184  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 587 aa  182  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4008  histidine kinase  41.41 
 
 		 376 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0416  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 		 377 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611617 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 		 585 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 		 596 aa  177  3e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 600 aa  177  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 590 aa  177  5e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.08 
 
 		 376 aa  177  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 592 aa  176  8e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1306  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 439 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.935955  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1277  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 439 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 611 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 608 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  33.43 
 
 		 346 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4124  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 		 376 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.21839  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 589 aa  173  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1183  histidine kinase  35.69 
 
 		 439 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.965515  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1195  histidine kinase  35.69 
 
 		 439 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.843993  normal  0.58507 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4449  histidine kinase  36.01 
 
 		 439 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.912128 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  38.53 
 
 		 565 aa  173  6.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2569  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.07 
 
 		 429 aa  172  7.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0825  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 		 439 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 590 aa  172  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 446 aa  172  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1535  phosphate regulon two-component sensor kinase transcription regulator protein  37.13 
 
 		 443 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.777366 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  35.48 
 
 		 613 aa  172  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 		 439 aa  171  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 456 aa  171  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0958  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 440 aa  170  4e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770114  normal  0.0682778 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 609 aa  170  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 619 aa  169  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 585 aa  169  9e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  42.04 
 
 		 591 aa  168  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 587 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.39 
 
 		 346 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.306668  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 437 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 612 aa  169  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  38.58 
 
 		 599 aa  169  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 460 aa  168  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  31.43 
 
 		 587 aa  168  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  31.43 
 
 		 587 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  31.43 
 
 		 587 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  31.43 
 
 		 587 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  31.43 
 
 		 587 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2915  two-component sensor histidine kinase  35.59 
 
 		 346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1559  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  31.43 
 
 		 587 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 437 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0308892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1272  phosphate sensor signal transduction histidine kinase, PhoR  34.53 
 
 		 437 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54553  normal  0.265376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>