More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1012 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1029 aa  2068    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2759  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.97 
 
 		 785 aa  465  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 662 aa  297  6e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0393x  response regulator, histidine kinase  38.54 
 
 		 943 aa  260  1e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621999  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.77 
 
 		 1053 aa  255  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0185  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.01 
 
 		 691 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.483444  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.73 
 
 		 827 aa  249  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2415  PAS sensor protein  39.16 
 
 		 810 aa  247  9.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000382  putative sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.01 
 
 		 873 aa  241  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.71 
 
 		 791 aa  241  5.999999999999999e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.84 
 
 		 1068 aa  240  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  33.51 
 
 		 1023 aa  236  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.74 
 
 		 1223 aa  234  5e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 		 781 aa  234  5e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02206  hypothetical protein  36.27 
 
 		 827 aa  229  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.43 
 
 		 1331 aa  229  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.91 
 
 		 939 aa  229  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 		 1287 aa  229  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 		 926 aa  228  5.0000000000000005e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 		 1059 aa  224  4.9999999999999996e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.37 
 
 		 1090 aa  224  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3431  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.8 
 
 		 756 aa  224  7e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.37 
 
 		 1090 aa  224  9e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.83 
 
 		 568 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 		 1333 aa  220  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 		 1313 aa  219  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 573 aa  215  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.58 
 
 		 860 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.73 
 
 		 1033 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3858  PAS sensor protein  34.56 
 
 		 797 aa  214  5.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.03 
 
 		 902 aa  214  5.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2015  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 874 aa  214  7.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847604 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.81 
 
 		 841 aa  213  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2393  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.32 
 
 		 676 aa  214  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822967 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 		 1029 aa  214  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.58 
 
 		 765 aa  213  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.81 
 
 		 1203 aa  212  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 		 1271 aa  212  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.59 
 
 		 1352 aa  212  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 1313 aa  212  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0895  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.13 
 
 		 894 aa  212  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530834 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.52 
 
 		 846 aa  211  4e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.94 
 
 		 874 aa  211  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.95 
 
 		 959 aa  211  7e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.11 
 
 		 1369 aa  210  9e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4938  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.34 
 
 		 686 aa  210  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.269297 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000544  hypothetical protein  50 
 
 		 828 aa  210  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2129  sensory box histidine kinase/response regulator  36.44 
 
 		 746 aa  209  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.706377  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.79 
 
 		 1222 aa  209  3e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0909  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.41 
 
 		 876 aa  208  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.138917  normal  0.894742 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.86 
 
 		 1452 aa  208  4e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.32 
 
 		 927 aa  208  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3308  sensor histidine kinase  44.53 
 
 		 845 aa  208  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4428  PAS sensor protein  38.61 
 
 		 693 aa  208  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.426756 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  37 
 
 		 767 aa  207  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 		 832 aa  206  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5383  Signal transduction histidine kinase  38.73 
 
 		 784 aa  207  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.626951  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.67 
 
 		 700 aa  206  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.22 
 
 		 882 aa  206  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.49 
 
 		 869 aa  205  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.6 
 
 		 919 aa  204  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.36 
 
 		 1131 aa  204  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  35.53 
 
 		 1560 aa  203  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  47.45 
 
 		 1346 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.1 
 
 		 1165 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3124  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.96 
 
 		 1374 aa  203  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957955  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.74 
 
 		 1158 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.47 
 
 		 1788 aa  202  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2774  histidine kinase  41.34 
 
 		 761 aa  202  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1426  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.34 
 
 		 1079 aa  202  3.9999999999999996e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.688315  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6270  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.2 
 
 		 952 aa  201  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 1064 aa  201  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.27 
 
 		 1126 aa  201  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1939  PAS  35.47 
 
 		 779 aa  201  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1746  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.22 
 
 		 903 aa  201  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  43.98 
 
 		 742 aa  201  7.999999999999999e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 		 1075 aa  201  7.999999999999999e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03428  PAS signal transduction protein  31.39 
 
 		 962 aa  200  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 		 1121 aa  199  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.56 
 
 		 863 aa  199  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.5 
 
 		 1058 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0996  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.76 
 
 		 832 aa  199  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  33.58 
 
 		 1120 aa  199  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0210  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 		 708 aa  199  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3332  sensor histidine kinase/response regulator  35.84 
 
 		 819 aa  199  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.03 
 
 		 881 aa  198  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 		 1116 aa  198  4.0000000000000005e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.66 
 
 		 833 aa  198  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.61 
 
 		 1350 aa  198  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.94 
 
 		 1260 aa  197  7e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1934  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 		 1015 aa  197  8.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.452261  normal  0.114848 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.74 
 
 		 1765 aa  197  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.26 
 
 		 957 aa  197  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.67 
 
 		 1362 aa  197  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  43.7 
 
 		 576 aa  197  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.1 
 
 		 1234 aa  196  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 		 870 aa  197  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2282  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.9 
 
 		 685 aa  196  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.12 
 
 		 1044 aa  196  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.36 
 
 		 1069 aa  196  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>