More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3138 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3138  sensor histidine kinase/response regulator  100 
 
 		 484 aa  1000    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.312332  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  81.13 
 
 		 482 aa  724    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000480808 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1547  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.95 
 
 		 520 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  56.91 
 
 		 637 aa  281  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2025  two component sensor histidine kinase  50 
 
 		 613 aa  238  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.199641  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.77 
 
 		 654 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 		 561 aa  211  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.237401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 		 695 aa  205  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 		 718 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 		 701 aa  202  9e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 		 1021 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 815 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0011  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.36 
 
 		 726 aa  197  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0181  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.64 
 
 		 837 aa  194  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.415169  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  42.61 
 
 		 470 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 546 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.24 
 
 		 670 aa  189  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.381885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 		 725 aa  187  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 		 571 aa  182  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 599 aa  180  5.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 		 489 aa  179  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.2 
 
 		 458 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 556 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0666549 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 880 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 		 556 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.236595  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4005  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.28 
 
 		 438 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000169909  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 885 aa  175  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 448 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.067404 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 		 592 aa  173  5e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.51 
 
 		 1120 aa  173  5.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  33.43 
 
 		 591 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 473 aa  172  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 456 aa  172  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 827 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 		 581 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 		 444 aa  172  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.6 
 
 		 608 aa  171  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 		 453 aa  171  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 579 aa  170  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 511 aa  170  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  31.27 
 
 		 882 aa  170  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1601  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.85 
 
 		 685 aa  169  9e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0518398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  48.17 
 
 		 649 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 1121 aa  168  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 412 aa  166  9e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  51.27 
 
 		 642 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 		 509 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.8 
 
 		 650 aa  164  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  51.61 
 
 		 642 aa  164  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  37.97 
 
 		 406 aa  164  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1656  sensory box/response regulator  39.84 
 
 		 420 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 		 2161 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0011  multi-sensor signal transduction histidine kinase  57.96 
 
 		 715 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 412 aa  163  6e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 609 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 		 621 aa  161  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 592 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 503 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2551  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  43.68 
 
 		 765 aa  161  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.274696 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 587 aa  160  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0025  histidine kinase  60 
 
 		 147 aa  160  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000104347  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 421 aa  160  4e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00283134  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 631 aa  160  4e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.963931  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 896 aa  160  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 		 715 aa  160  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.99155  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  38.2 
 
 		 352 aa  160  6e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03740  PhoR-like protein  37.61 
 
 		 409 aa  160  6e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172965  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 596 aa  160  6e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 1043 aa  160  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 608 aa  160  6e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1933  ATPase domain-containing protein  38.3 
 
 		 535 aa  160  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1758  PAS sensor diguanylate cyclase/phophodiesterase  46.24 
 
 		 700 aa  159  7e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.250633  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  38.7 
 
 		 906 aa  160  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 1319 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 483 aa  159  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 1002 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0510  Cache sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 633 aa  159  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  51.59 
 
 		 637 aa  158  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 589 aa  158  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 614 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 1010 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0830  histidine kinase  37.5 
 
 		 401 aa  158  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 600 aa  158  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1114  putative diguanylate phosphodiesterase  56.3 
 
 		 568 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 1039 aa  158  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 		 769 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 		 2153 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.8 
 
 		 1271 aa  158  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 884 aa  157  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 460 aa  157  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 3470 aa  157  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 607 aa  157  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  36.96 
 
 		 461 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  36.48 
 
 		 537 aa  156  7e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  29.79 
 
 		 617 aa  156  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  39.13 
 
 		 560 aa  156  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  36.52 
 
 		 464 aa  156  8e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0857  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 698 aa  156  8e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0897898 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2414  multisensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 		 505 aa  155  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.40518  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 		 2783 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.296104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>