More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0464 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  78.3 
 
 
613 aa  983    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
614 aa  1226    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  78.34 
 
 
614 aa  996    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0444  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.03 
 
 
613 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0364501  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.95 
 
 
639 aa  504  1e-141  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.16 
 
 
639 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.9 
 
 
639 aa  480  1e-134  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.3 
 
 
640 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.67 
 
 
641 aa  449  1e-125  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 
620 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1296  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.53 
 
 
729 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54969  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.06 
 
 
729 aa  325  1e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000025801 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1764  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.72 
 
 
729 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0298102 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0389  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.52 
 
 
729 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.16 
 
 
732 aa  258  2e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.05 
 
 
731 aa  258  3e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.395516  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.39 
 
 
730 aa  244  5e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.292082  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1402  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.13 
 
 
731 aa  223  8e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.723997  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1096  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.63 
 
 
730 aa  221  3e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1544  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.05 
 
 
731 aa  220  5e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0842  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.03 
 
 
732 aa  212  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0820  multisensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
519 aa  212  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.57 
 
 
421 aa  211  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00283134  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0137  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.07 
 
 
731 aa  206  8e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00776306  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0137  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.1 
 
 
732 aa  205  2e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0510  Cache sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
633 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  33.79 
 
 
1133 aa  192  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 
646 aa  192  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 
493 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 
503 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 
631 aa  188  3e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.963931  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  33.99 
 
 
560 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.41 
 
 
1043 aa  185  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  26.15 
 
 
673 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.56 
 
 
579 aa  183  7e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
835 aa  183  7e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
504 aa  182  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.57 
 
 
691 aa  182  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  30.5 
 
 
853 aa  182  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
470 aa  181  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  38.87 
 
 
461 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  38.87 
 
 
461 aa  181  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0065  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 
377 aa  180  7e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 
473 aa  179  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.33 
 
 
671 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  38.87 
 
 
461 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2092  histidine kinase  30.46 
 
 
534 aa  179  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.865135  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  33.89 
 
 
473 aa  178  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  28.74 
 
 
508 aa  178  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  33.89 
 
 
470 aa  178  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  31.56 
 
 
455 aa  178  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
457 aa  178  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  31.56 
 
 
455 aa  178  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
546 aa  177  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
412 aa  177  8e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 
1010 aa  176  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 
412 aa  176  9e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  30.44 
 
 
582 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  31.05 
 
 
1119 aa  176  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
467 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
469 aa  175  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1985  histidine kinase  25.88 
 
 
672 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1247  multisensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 
607 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000186928  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  30.98 
 
 
1130 aa  175  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.82 
 
 
933 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 
488 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
468 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
463 aa  174  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.61 
 
 
1207 aa  173  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  32.04 
 
 
810 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  27.89 
 
 
1207 aa  173  6.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 
452 aa  172  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 
459 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0857  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 
698 aa  172  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0897898 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 
827 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 
489 aa  173  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0950  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.59 
 
 
396 aa  172  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 
487 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2240  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 
672 aa  172  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  36.84 
 
 
464 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 
600 aa  172  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.06 
 
 
799 aa  172  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976806  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 
763 aa  172  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 
524 aa  172  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1646  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 
391 aa  172  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0178265 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 
662 aa  172  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
473 aa  172  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0705  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 
432 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000747291  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  32.58 
 
 
927 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 
592 aa  171  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  29.38 
 
 
645 aa  171  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 
471 aa  171  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0312  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 
556 aa  170  7e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  22.89 
 
 
674 aa  170  8e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 
607 aa  169  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 
585 aa  168  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1496  histidine kinase  39.41 
 
 
465 aa  169  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 
612 aa  169  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  30.58 
 
 
620 aa  169  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0212  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.53 
 
 
953 aa  168  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>