More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0286 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  100 
 
 		 582 aa  1196    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4693  histidine kinase  51.21 
 
 		 561 aa  558  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  46.13 
 
 		 560 aa  476  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1010  histidine kinase  39.5 
 
 		 572 aa  433  1e-120  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0817847 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3055  histidine kinase  40.27 
 
 		 562 aa  419  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11300  signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 		 556 aa  407  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 546 aa  318  2e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  32.33 
 
 		 835 aa  229  7e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 		 827 aa  219  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3217  ATP-binding region ATPase domain protein  30.87 
 
 		 576 aa  215  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.644054  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.36 
 
 		 858 aa  199  7.999999999999999e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 		 977 aa  199  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.95 
 
 		 956 aa  196  9e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 		 818 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 818 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  33.52 
 
 		 925 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  33.24 
 
 		 925 aa  190  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2092  histidine kinase  26.94 
 
 		 534 aa  186  8e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.865135  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 		 640 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 		 456 aa  184  6e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  34.63 
 
 		 932 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.73 
 
 		 929 aa  182  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1887  transmission sensor LetS  28.47 
 
 		 910 aa  181  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.52 
 
 		 932 aa  181  4.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.82 
 
 		 937 aa  179  8e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.1 
 
 		 937 aa  179  8e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.63 
 
 		 927 aa  179  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1876  transmission sensor LetS  28.32 
 
 		 910 aa  178  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  40.32 
 
 		 461 aa  179  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  38.85 
 
 		 556 aa  178  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 		 371 aa  178  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.46 
 
 		 1159 aa  178  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3457  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.14 
 
 		 935 aa  177  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.62 
 
 		 929 aa  177  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2257  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.92 
 
 		 1162 aa  177  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  39.92 
 
 		 461 aa  177  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  39.92 
 
 		 461 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  38.49 
 
 		 1346 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.44 
 
 		 614 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.69 
 
 		 933 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  39.53 
 
 		 464 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1191  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.91 
 
 		 950 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000146059  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1834  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.88 
 
 		 569 aa  175  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.04 
 
 		 906 aa  175  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2767  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.6 
 
 		 933 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294821  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3146  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.41 
 
 		 933 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.155765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3291  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.41 
 
 		 933 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.59315  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.6 
 
 		 935 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1223  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.41 
 
 		 933 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.915072  hitchhiker  0.00275603 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 		 763 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 557 aa  174  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.125124  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  43.22 
 
 		 1046 aa  174  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 646 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  33.24 
 
 		 910 aa  173  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3148  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.41 
 
 		 932 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0238696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  32.64 
 
 		 998 aa  173  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0528  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.74 
 
 		 926 aa  173  9e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.178759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 639 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1635  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 		 930 aa  172  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.386153  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 		 1137 aa  172  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.63 
 
 		 918 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.63 
 
 		 918 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 		 817 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  36 
 
 		 1137 aa  172  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.6 
 
 		 935 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715392 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1175  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.6 
 
 		 935 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 917 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.63 
 
 		 918 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1047  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.5 
 
 		 952 aa  171  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.017027  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.63 
 
 		 918 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.63 
 
 		 918 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.28 
 
 		 916 aa  171  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  31.93 
 
 		 918 aa  171  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 		 918 aa  171  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  31.93 
 
 		 918 aa  171  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.75 
 
 		 791 aa  171  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  32.68 
 
 		 917 aa  171  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.93 
 
 		 918 aa  171  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.93 
 
 		 918 aa  171  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.93 
 
 		 918 aa  171  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  34.05 
 
 		 833 aa  171  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.93 
 
 		 918 aa  171  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.93 
 
 		 918 aa  171  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2240  sensor/response regulator hybrid  32.02 
 
 		 942 aa  171  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499034 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4200  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.78 
 
 		 678 aa  171  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.679083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4310  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.78 
 
 		 631 aa  171  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.917762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.93 
 
 		 918 aa  171  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.65 
 
 		 1203 aa  170  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.02 
 
 		 918 aa  171  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.25 
 
 		 941 aa  171  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.21 
 
 		 827 aa  170  6e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 639 aa  170  7e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 631 aa  169  9e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.85 
 
 		 846 aa  169  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2430  histidine kinase  28.85 
 
 		 629 aa  169  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.73405  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3391  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.09 
 
 		 931 aa  169  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  33.93 
 
 		 1200 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  27.29 
 
 		 800 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 639 aa  169  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.81 
 
 		 919 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>