More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0775 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  100 
 
 		 674 aa  1352    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60.78 
 
 		 691 aa  814    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2240  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.61 
 
 		 672 aa  739    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  55.59 
 
 		 661 aa  711    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  76.84 
 
 		 673 aa  1044    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.79 
 
 		 671 aa  723    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1985  histidine kinase  55.16 
 
 		 672 aa  731    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.78 
 
 		 661 aa  723    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  63.44 
 
 		 662 aa  855    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0142  histidine kinase  40.85 
 
 		 614 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3720  histidine kinase  37.15 
 
 		 693 aa  345  2e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1291  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 690 aa  338  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3736  histidine kinase  35.79 
 
 		 675 aa  313  5.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 676 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1828  sensor histidine kinase  38.6 
 
 		 674 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.719935  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0126  sensor histidine kinase  34.49 
 
 		 708 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000118135  normal  0.929624 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5498  histidine kinase  35.45 
 
 		 676 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1168  sensor histidine kinase  34.27 
 
 		 685 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.527437 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 		 714 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00135351  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3194  histidine kinase  35.5 
 
 		 663 aa  301  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0089  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 705 aa  300  4e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0206322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 		 709 aa  300  6e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000275597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3965  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 711 aa  299  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00131359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4075  ATPase domain-containing protein  36.99 
 
 		 711 aa  298  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00205283  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4717  sensor histidine kinase  36.5 
 
 		 709 aa  297  4e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4455  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 		 717 aa  296  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.243225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4260  histidine kinase  37.36 
 
 		 717 aa  296  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000203667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 		 717 aa  296  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273141  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 		 717 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00270553  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02266  hypothetical protein  36.97 
 
 		 680 aa  294  5e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003502  signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 659 aa  293  7e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4092  histidine kinase  36.46 
 
 		 706 aa  293  7e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1128  sensor histidine kinase  33.87 
 
 		 677 aa  293  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.16 
 
 		 658 aa  292  2e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1403  signal transduction protein, histidine kinase  36.59 
 
 		 675 aa  290  5.0000000000000004e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 707 aa  289  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000535893  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 713 aa  287  4e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0360535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0126  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 		 705 aa  287  5e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0888  histidine kinase  30.52 
 
 		 647 aa  281  2e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1695  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 		 691 aa  280  9e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2086  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 699 aa  266  7e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 639 aa  262  2e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 639 aa  258  3e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 640 aa  254  3e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 639 aa  251  3e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 656 aa  244  5e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755968  normal  0.278919 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 641 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 522 aa  228  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  37.89 
 
 		 516 aa  209  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.11 
 
 		 541 aa  209  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 655 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2011  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 		 584 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 		 542 aa  206  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2742  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 544 aa  205  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.617202  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2603  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 570 aa  205  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1952  histidine kinase  38.36 
 
 		 560 aa  204  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4376  histidine kinase  40.12 
 
 		 667 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314442  normal  0.0171304 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 656 aa  201  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 548 aa  201  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  37.14 
 
 		 656 aa  200  9e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  35.64 
 
 		 548 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 548 aa  197  7e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  36.62 
 
 		 655 aa  196  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2216  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.62 
 
 		 475 aa  196  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 		 586 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  38.24 
 
 		 542 aa  196  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4226  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 		 613 aa  193  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.156155  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  33.88 
 
 		 592 aa  190  8e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1897  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.31 
 
 		 488 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 510 aa  189  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 		 646 aa  189  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3826  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.23 
 
 		 492 aa  187  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 592 aa  187  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1796  histidine kinase  35.98 
 
 		 584 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.69 
 
 		 804 aa  186  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1855  histidine kinase  37.81 
 
 		 600 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.355606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 		 970 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2677  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 		 395 aa  184  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971959  normal  0.344308 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  45.87 
 
 		 912 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4382  histidine kinase  40.38 
 
 		 646 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00540034  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4191  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 476 aa  184  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000558631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3902  histidine kinase  32.41 
 
 		 468 aa  184  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116044 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 		 540 aa  182  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1745  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  43.3 
 
 		 424 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0373  sensor histidine kinase  33.13 
 
 		 500 aa  182  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 		 498 aa  182  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 491 aa  181  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3157  histidine kinase  32.41 
 
 		 484 aa  180  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 620 aa  179  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 		 515 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 480 aa  179  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  41.74 
 
 		 621 aa  178  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0960  histidine kinase  34.28 
 
 		 531 aa  178  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 473 aa  177  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2683  histidine kinase  31.18 
 
 		 490 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000711589 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 		 394 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000651793  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3573  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 		 402 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2551  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 		 396 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14529e-19 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0592  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.45 
 
 		 516 aa  174  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.597722 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 494 aa  174  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>