More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2923 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  82.2 
 
 		 516 aa  857    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  100 
 
 		 541 aa  1116    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.11 
 
 		 522 aa  648    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.49 
 
 		 542 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  55.51 
 
 		 542 aa  587  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.32 
 
 		 540 aa  472  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2742  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 		 544 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.617202  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.61 
 
 		 586 aa  346  7e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1796  histidine kinase  38.73 
 
 		 584 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1952  histidine kinase  40.38 
 
 		 560 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2011  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 		 584 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2603  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 570 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  38.18 
 
 		 548 aa  316  7e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 548 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 		 548 aa  312  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.69 
 
 		 662 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  28.74 
 
 		 517 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  39.63 
 
 		 673 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 494 aa  225  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 491 aa  223  9e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.44 
 
 		 819 aa  219  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 656 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 691 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  36.97 
 
 		 656 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  37.9 
 
 		 655 aa  213  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.09 
 
 		 819 aa  210  6e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 671 aa  209  9e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  38.11 
 
 		 674 aa  209  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0960  histidine kinase  33.76 
 
 		 531 aa  209  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  35.35 
 
 		 661 aa  208  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2240  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 		 672 aa  208  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 661 aa  207  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1985  histidine kinase  36.31 
 
 		 672 aa  207  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0888  histidine kinase  35.94 
 
 		 647 aa  206  8e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2683  histidine kinase  33.97 
 
 		 490 aa  205  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000711589 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  29.27 
 
 		 487 aa  203  8e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 655 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 		 498 aa  201  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 488 aa  201  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 655 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 510 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 630 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  28.3 
 
 		 499 aa  195  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1119  sensor histidine kinase/response regulator  42 
 
 		 420 aa  194  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 654 aa  193  7e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4226  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 		 613 aa  193  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.156155  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 		 646 aa  193  7e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1801  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 528 aa  193  9e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.828791  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 		 592 aa  192  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4382  histidine kinase  38.76 
 
 		 646 aa  191  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00540034  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.74 
 
 		 804 aa  190  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2824  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 645 aa  189  9e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  37.5 
 
 		 592 aa  189  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  43.78 
 
 		 1255 aa  189  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2812  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 		 495 aa  188  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 		 514 aa  188  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1855  histidine kinase  37.58 
 
 		 600 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.355606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2677  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 		 395 aa  187  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971959  normal  0.344308 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4376  histidine kinase  37.1 
 
 		 667 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314442  normal  0.0171304 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2127  histidine kinase  35.43 
 
 		 483 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2161  two component sensor histidine kinase  32.79 
 
 		 481 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.37303e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  43.03 
 
 		 1062 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.86 
 
 		 1465 aa  183  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.59 
 
 		 801 aa  182  9.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 680 aa  182  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2042  sensor histidine kinase  33.25 
 
 		 524 aa  182  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  41.77 
 
 		 1092 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  41.13 
 
 		 1061 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 		 588 aa  181  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2392  histidine kinase  36.72 
 
 		 502 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2189  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 726 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.73 
 
 		 557 aa  180  7e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3573  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 402 aa  178  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0733  sensory box sensor histidine kinase  38.43 
 
 		 358 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.724389  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1403  signal transduction protein, histidine kinase  35.43 
 
 		 675 aa  177  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2807  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 		 505 aa  177  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  40.47 
 
 		 1258 aa  177  6e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 676 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 		 467 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 862 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 		 392 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03495  Signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 557 aa  176  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 658 aa  176  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2428  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.81 
 
 		 656 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00399652  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0126  sensor histidine kinase  34.83 
 
 		 708 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000118135  normal  0.929624 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1500  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.21 
 
 		 560 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 394 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000651793  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2388  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.25 
 
 		 552 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.245714  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 		 1021 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2667  histidine kinase  43.04 
 
 		 486 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 		 507 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 		 701 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.282736 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0614  sensor histidine kinase  39.86 
 
 		 626 aa  174  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.294788  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1054  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 		 552 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000699137 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.43 
 
 		 1262 aa  173  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3965  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 711 aa  173  9e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00131359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 		 515 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3194  histidine kinase  35.46 
 
 		 663 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1502  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.94 
 
 		 952 aa  172  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4075  ATPase domain-containing protein  34.45 
 
 		 711 aa  172  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00205283  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>