More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4382 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_4376  histidine kinase  68.36 
 
 
667 aa  787    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314442  normal  0.0171304 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4382  histidine kinase  100 
 
 
646 aa  1260    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00540034  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4226  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  98.21 
 
 
613 aa  1174    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.156155  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  99.38 
 
 
646 aa  1253    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1855  histidine kinase  35.75 
 
 
600 aa  207  6e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.355606  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 
662 aa  205  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 
522 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  38.24 
 
 
516 aa  199  9e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.05 
 
 
541 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2603  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
570 aa  199  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  39.51 
 
 
674 aa  193  7e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 
661 aa  187  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
691 aa  187  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  34.44 
 
 
661 aa  186  9e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  36.84 
 
 
542 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.37 
 
 
542 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  35.54 
 
 
673 aa  182  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 
494 aa  180  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  33.23 
 
 
517 aa  180  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2742  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 
544 aa  180  9e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.617202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1985  histidine kinase  35.28 
 
 
672 aa  177  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3194  histidine kinase  37.97 
 
 
663 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
671 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2240  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 
672 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 
498 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2683  histidine kinase  33.93 
 
 
490 aa  174  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000711589 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
488 aa  171  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 
592 aa  170  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  34.52 
 
 
592 aa  169  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1952  histidine kinase  35.67 
 
 
560 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
491 aa  167  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 
658 aa  167  6.9999999999999995e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135462  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
676 aa  167  8e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122155  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0960  histidine kinase  34.51 
 
 
531 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5498  histidine kinase  36.1 
 
 
676 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.78 
 
 
586 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
548 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2011  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
584 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  34.34 
 
 
548 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3720  histidine kinase  38.32 
 
 
693 aa  161  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0750  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
390 aa  161  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1796  histidine kinase  35.69 
 
 
584 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
548 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 
510 aa  159  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
656 aa  159  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755968  normal  0.278919 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3269  sensor protein  27.36 
 
 
619 aa  158  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  30.89 
 
 
656 aa  157  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2161  two component sensor histidine kinase  34.36 
 
 
481 aa  157  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.37303e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  32.84 
 
 
499 aa  157  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 
654 aa  156  9e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2042  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
524 aa  156  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 
656 aa  156  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 
614 aa  154  4e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.56 
 
 
819 aa  154  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0888  histidine kinase  28.16 
 
 
647 aa  152  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 
630 aa  153  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0142  histidine kinase  37 
 
 
614 aa  152  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2677  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 
395 aa  152  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971959  normal  0.344308 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1801  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 
528 aa  151  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.828791  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0701  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 
545 aa  150  9e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.310619 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1199  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
604 aa  149  1.0000000000000001e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529725 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.2 
 
 
819 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2502  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 
423 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1828  sensor histidine kinase  34.01 
 
 
674 aa  148  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.719935  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  24.25 
 
 
581 aa  147  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.34 
 
 
801 aa  147  8.000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 
639 aa  146  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 
500 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.814589  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  31.16 
 
 
487 aa  144  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 
804 aa  144  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 
639 aa  144  5e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 
540 aa  144  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1403  signal transduction protein, histidine kinase  28.85 
 
 
675 aa  144  6e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 
639 aa  144  7e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  35.43 
 
 
391 aa  143  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1119  sensor histidine kinase/response regulator  35.46 
 
 
420 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0886  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.85 
 
 
842 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435524 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
919 aa  143  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121364  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 
394 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000651793  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2497  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.93 
 
 
1168 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.436801 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0128  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
780 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000607213  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3826  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 
492 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873199  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2521  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 
571 aa  141  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0595753 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4191  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 
476 aa  141  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000558631  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2127  histidine kinase  33.63 
 
 
483 aa  141  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1650  histidine kinase  25.88 
 
 
612 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 
614 aa  140  6e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3902  histidine kinase  29.91 
 
 
468 aa  140  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116044 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2551  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 
396 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14529e-19 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1243  histidine kinase  31.2 
 
 
654 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0706231 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0231  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 
844 aa  140  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.794534  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
970 aa  140  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0603  sensory box sensor histidine kinase  31.5 
 
 
439 aa  140  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  30.39 
 
 
655 aa  139  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3736  histidine kinase  32.83 
 
 
675 aa  139  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_566  sensor histidine kinase  35.22 
 
 
852 aa  139  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3601  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
399 aa  139  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
514 aa  139  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1502  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.45 
 
 
952 aa  139  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.72 
 
 
1418 aa  138  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>