More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3694 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1291  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.58 
 
 
690 aa  741    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
676 aa  1339    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122155  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5498  histidine kinase  98.37 
 
 
676 aa  1310    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3194  histidine kinase  83.31 
 
 
663 aa  1057    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.71 
 
 
658 aa  572  1e-161  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135462  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1828  sensor histidine kinase  47.98 
 
 
674 aa  553  1e-156  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.719935  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3720  histidine kinase  49.7 
 
 
693 aa  552  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.33 
 
 
656 aa  534  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755968  normal  0.278919 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3736  histidine kinase  46.41 
 
 
675 aa  501  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1168  sensor histidine kinase  45.82 
 
 
685 aa  489  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.527437 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1695  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.13 
 
 
691 aa  410  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113476  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 
714 aa  412  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00135351  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0126  sensor histidine kinase  39.24 
 
 
708 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000118135  normal  0.929624 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4717  sensor histidine kinase  39.06 
 
 
709 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4092  histidine kinase  37.73 
 
 
706 aa  396  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0126  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.48 
 
 
705 aa  392  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0089  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 
705 aa  395  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0206322  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 
709 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000275597  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3965  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 
711 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00131359  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4075  ATPase domain-containing protein  38.54 
 
 
711 aa  395  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00205283  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 
707 aa  385  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000535893  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 
717 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00270553  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4260  histidine kinase  37.74 
 
 
717 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000203667  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4455  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 
717 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.243225  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 
717 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273141  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 
713 aa  374  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0360535  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2086  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 
699 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 
662 aa  343  8e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 
691 aa  333  8e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02266  hypothetical protein  32.66 
 
 
680 aa  331  3e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1128  sensor histidine kinase  34.21 
 
 
677 aa  330  4e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003502  signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 
659 aa  327  5e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  35.41 
 
 
673 aa  326  7e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1403  signal transduction protein, histidine kinase  32.6 
 
 
675 aa  322  9.999999999999999e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  35.81 
 
 
674 aa  321  3e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1985  histidine kinase  34.29 
 
 
672 aa  315  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2240  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 
672 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 
671 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 
661 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  33.88 
 
 
661 aa  306  6e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0142  histidine kinase  34.64 
 
 
614 aa  244  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0888  histidine kinase  31.42 
 
 
647 aa  226  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 
639 aa  209  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 
639 aa  207  6e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 
639 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.37 
 
 
641 aa  201  5e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  35.06 
 
 
516 aa  188  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.53 
 
 
640 aa  181  4e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.33 
 
 
541 aa  179  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
522 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 
919 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121364  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4376  histidine kinase  35.42 
 
 
667 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314442  normal  0.0171304 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  35.79 
 
 
542 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
491 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 
542 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2603  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 
570 aa  163  8.000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.04 
 
 
494 aa  161  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 
699 aa  161  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 
594 aa  160  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 
589 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
646 aa  160  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 
602 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  30.71 
 
 
517 aa  158  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4226  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 
613 aa  158  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.156155  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 
588 aa  158  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
592 aa  158  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1199  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 
604 aa  157  4e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529725 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4382  histidine kinase  35.33 
 
 
646 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00540034  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2742  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 
544 aa  156  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.617202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  33.97 
 
 
592 aa  155  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0960  histidine kinase  34.32 
 
 
531 aa  154  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 
540 aa  154  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1952  histidine kinase  36.75 
 
 
560 aa  154  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0733  sensory box sensor histidine kinase  39.49 
 
 
358 aa  154  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.724389  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 
620 aa  154  7e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 
586 aa  153  8e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2042  sensor histidine kinase  34.29 
 
 
524 aa  152  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
488 aa  152  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 
611 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 
611 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2683  histidine kinase  34.73 
 
 
490 aa  152  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000711589 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0614  sensor histidine kinase  36.06 
 
 
626 aa  151  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.294788  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2312  Signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 
389 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1925  sensor histidine kinase  40 
 
 
389 aa  150  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574394  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1718  sensor histidine kinase  40 
 
 
389 aa  150  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2229  sensor histidine kinase  40 
 
 
389 aa  150  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0601  sensor histidine kinase  40 
 
 
389 aa  150  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  32.74 
 
 
548 aa  150  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0709  sensory box sensor histidine kinase  40 
 
 
358 aa  150  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1660  sensory box sensor histidine kinase  40 
 
 
358 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0743  sensor histidine kinase  35.54 
 
 
627 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573337  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0619  histidine kinase  37.88 
 
 
313 aa  150  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2085  ATP-binding region ATPase domain protein  32.95 
 
 
510 aa  148  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.158999  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0260  sensor histidine kinase  35.54 
 
 
627 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0922  EAL/GGDEF domain-containing protein  35.54 
 
 
627 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  35.7 
 
 
611 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0582  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 
587 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2467  sensor histidine kinase  35.54 
 
 
627 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2691  sensor histidine kinase  35.54 
 
 
627 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0755  sensor histidine kinase  35.54 
 
 
627 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>