More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3736 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3736  histidine kinase  100 
 
 		 675 aa  1340    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1168  sensor histidine kinase  68.32 
 
 		 685 aa  810    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.527437 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1828  sensor histidine kinase  49.93 
 
 		 674 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.719935  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1291  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.25 
 
 		 690 aa  557  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3720  histidine kinase  49.78 
 
 		 693 aa  544  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3194  histidine kinase  46.24 
 
 		 663 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.8 
 
 		 676 aa  503  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5498  histidine kinase  46.49 
 
 		 676 aa  501  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.04 
 
 		 656 aa  444  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755968  normal  0.278919 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.56 
 
 		 658 aa  434  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1695  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.09 
 
 		 691 aa  400  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0126  sensor histidine kinase  35.63 
 
 		 708 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000118135  normal  0.929624 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4717  sensor histidine kinase  34.54 
 
 		 709 aa  366  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 		 714 aa  368  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00135351  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3965  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 711 aa  365  2e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00131359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4075  ATPase domain-containing protein  34.39 
 
 		 711 aa  364  3e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00205283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4092  histidine kinase  33.84 
 
 		 706 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 709 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000275597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2086  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 		 699 aa  362  9e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0089  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 705 aa  351  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0206322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0126  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 705 aa  343  8e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 707 aa  342  1e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000535893  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 713 aa  340  5e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0360535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4260  histidine kinase  33.73 
 
 		 717 aa  339  8e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000203667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4455  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 		 717 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.243225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 		 717 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273141  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 717 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00270553  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02266  hypothetical protein  32.31 
 
 		 680 aa  326  7e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 662 aa  325  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.38 
 
 		 691 aa  324  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1403  signal transduction protein, histidine kinase  33.63 
 
 		 675 aa  322  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  33.33 
 
 		 673 aa  320  7.999999999999999e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  33.23 
 
 		 674 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003502  signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 659 aa  315  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  33.24 
 
 		 661 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2240  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 672 aa  303  9e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1128  sensor histidine kinase  31.61 
 
 		 677 aa  300  4e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 		 661 aa  297  5e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1985  histidine kinase  32.25 
 
 		 672 aa  295  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 671 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0142  histidine kinase  33.78 
 
 		 614 aa  242  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 		 639 aa  206  1e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 639 aa  206  1e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 639 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 		 641 aa  180  8e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0888  histidine kinase  27.06 
 
 		 647 aa  170  7e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 		 640 aa  164  7e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 919 aa  160  9e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121364  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 548 aa  151  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 592 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2216  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 		 475 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  33.13 
 
 		 592 aa  148  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  31.97 
 
 		 516 aa  147  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  32.54 
 
 		 548 aa  147  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 548 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2287  histidine kinase  28.91 
 
 		 770 aa  145  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.709847  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3826  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 		 492 aa  144  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 		 491 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 		 656 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  29.49 
 
 		 656 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 522 aa  141  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 		 515 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  32.09 
 
 		 655 aa  139  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4376  histidine kinase  32.58 
 
 		 667 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314442  normal  0.0171304 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 494 aa  139  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  30.33 
 
 		 517 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1796  histidine kinase  32.79 
 
 		 584 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.6 
 
 		 541 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4226  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 613 aa  137  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.156155  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0592  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.67 
 
 		 516 aa  137  8e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.597722 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4160  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.37 
 
 		 516 aa  137  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4382  histidine kinase  33.12 
 
 		 646 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00540034  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 542 aa  135  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  34.78 
 
 		 611 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 586 aa  134  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3269  sensor protein  31.49 
 
 		 619 aa  133  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 646 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 611 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 611 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1897  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 488 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3279  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 608 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00154728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1952  histidine kinase  33.22 
 
 		 560 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2011  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 584 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 		 498 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0622  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 753 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  29.33 
 
 		 487 aa  132  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.88 
 
 		 614 aa  132  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0638  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 		 373 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 510 aa  130  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 540 aa  130  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1776  histidine kinase  32.65 
 
 		 519 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2844  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 550 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4097  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 766 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.63 
 
 		 620 aa  128  3e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  30.98 
 
 		 542 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  28.89 
 
 		 581 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2682  histidine kinase  36.3 
 
 		 635 aa  128  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249281 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0672  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 		 373 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 970 aa  127  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>