More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4260 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0089  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  82.89 
 
 
705 aa  1141    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0206322  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4455  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  99.86 
 
 
717 aa  1454    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.243225  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4717  sensor histidine kinase  91.3 
 
 
709 aa  1303    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0126  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  82.39 
 
 
705 aa  1133    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4092  histidine kinase  81.86 
 
 
706 aa  1145    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  99.72 
 
 
717 aa  1453    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00270553  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  90.69 
 
 
707 aa  1257    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000535893  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  99.72 
 
 
717 aa  1451    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273141  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  92.1 
 
 
709 aa  1314    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000275597  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3965  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  91.48 
 
 
711 aa  1321    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00131359  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  70.68 
 
 
714 aa  1018    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00135351  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4260  histidine kinase  100 
 
 
717 aa  1456    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000203667  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4075  ATPase domain-containing protein  91.62 
 
 
711 aa  1322    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00205283  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  79.66 
 
 
713 aa  1090    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0360535  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0126  sensor histidine kinase  79.69 
 
 
708 aa  1127    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000118135  normal  0.929624 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02266  hypothetical protein  45.69 
 
 
680 aa  589  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003502  signal transduction histidine kinase  45.86 
 
 
659 aa  579  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1128  sensor histidine kinase  46.3 
 
 
677 aa  574  1.0000000000000001e-162  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1403  signal transduction protein, histidine kinase  44.57 
 
 
675 aa  575  1.0000000000000001e-162  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2086  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.17 
 
 
699 aa  489  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1291  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 
690 aa  434  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1695  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.01 
 
 
691 aa  432  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113476  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3720  histidine kinase  38.62 
 
 
693 aa  426  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1828  sensor histidine kinase  37.25 
 
 
674 aa  401  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.719935  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3194  histidine kinase  36.8 
 
 
663 aa  391  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
676 aa  385  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122155  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5498  histidine kinase  37.21 
 
 
676 aa  379  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1168  sensor histidine kinase  34.68 
 
 
685 aa  375  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.527437 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 
658 aa  360  7e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135462  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3736  histidine kinase  33.62 
 
 
675 aa  357  2.9999999999999997e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 
656 aa  329  1.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755968  normal  0.278919 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  34.31 
 
 
673 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 
662 aa  319  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
691 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  34.16 
 
 
674 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
661 aa  301  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  38.11 
 
 
661 aa  297  4e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
671 aa  293  8e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1985  histidine kinase  34.96 
 
 
672 aa  290  6e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2240  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
672 aa  290  6e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0142  histidine kinase  31.5 
 
 
614 aa  225  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0888  histidine kinase  30.05 
 
 
647 aa  203  8e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  36.29 
 
 
516 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  37.46 
 
 
542 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.45 
 
 
541 aa  174  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2742  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
544 aa  172  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.617202  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 
639 aa  171  3e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.13 
 
 
548 aa  171  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 
639 aa  170  7e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 
542 aa  169  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  38.13 
 
 
548 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 
548 aa  167  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.29 
 
 
640 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 
639 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 
522 aa  159  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.91 
 
 
588 aa  157  6e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1796  histidine kinase  35.2 
 
 
584 aa  157  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1952  histidine kinase  36.42 
 
 
560 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 
586 aa  153  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2011  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 
584 aa  151  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0638  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
373 aa  150  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  40.09 
 
 
912 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 
641 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
919 aa  148  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121364  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0658  sensor histide kinase  32.88 
 
 
315 aa  147  7.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2388  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 
552 aa  147  8.000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.245714  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  36.96 
 
 
608 aa  147  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  36.52 
 
 
608 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.52 
 
 
608 aa  145  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
467 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
515 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  36.52 
 
 
608 aa  145  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03495  Signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 
557 aa  145  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  36.52 
 
 
608 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
862 aa  145  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
498 aa  145  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  36.52 
 
 
608 aa  145  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  33.84 
 
 
505 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2667  histidine kinase  36.86 
 
 
486 aa  144  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2491  histidine kinase  32.19 
 
 
626 aa  144  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653758 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
630 aa  144  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  35.86 
 
 
524 aa  144  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 
467 aa  144  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1054  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 
552 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000699137 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 
594 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0672  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 
373 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0672  histidine kinase  34.53 
 
 
373 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 
602 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3901  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
661 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0390399  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.15 
 
 
598 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3803  histone-like DNA-binding protein  34.21 
 
 
308 aa  142  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2172  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 
658 aa  141  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0260  sensor histidine kinase  32.04 
 
 
627 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0755  sensor histidine kinase  32.04 
 
 
627 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0922  EAL/GGDEF domain-containing protein  32.04 
 
 
627 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0614  sensor histidine kinase  32.73 
 
 
626 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.294788  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2386  sensor histidine kinase  32.04 
 
 
627 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2467  sensor histidine kinase  32.04 
 
 
627 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0622  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 
753 aa  141  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2691  sensor histidine kinase  32.04 
 
 
627 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>