More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2000 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
515 aa  1053    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1511  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.75 
 
 
575 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0790  histidine kinase  44.27 
 
 
522 aa  445  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  36.43 
 
 
655 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0373  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
500 aa  190  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.63 
 
 
819 aa  188  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 
494 aa  188  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0620  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
518 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.02 
 
 
819 aa  188  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
655 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  37.78 
 
 
517 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 
480 aa  184  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  31.35 
 
 
673 aa  182  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 
510 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
655 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 
491 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  36.88 
 
 
674 aa  179  8e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.26 
 
 
598 aa  179  8e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0828  sensory histidine kinase AtoS  39.02 
 
 
613 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.167481 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4191  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 
476 aa  178  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000558631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3902  histidine kinase  34.83 
 
 
468 aa  176  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 
656 aa  176  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  36.76 
 
 
656 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  40.42 
 
 
621 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3157  histidine kinase  33.88 
 
 
484 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 
662 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  37.39 
 
 
661 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
654 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
630 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0675  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 
855 aa  173  6.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 
586 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  38.7 
 
 
458 aa  172  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.02 
 
 
541 aa  172  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
661 aa  172  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  36.62 
 
 
516 aa  171  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  38.26 
 
 
458 aa  170  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.64 
 
 
804 aa  170  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2216  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 
475 aa  169  8e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263831  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2057  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.25 
 
 
747 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376311  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  34.78 
 
 
499 aa  169  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  38.26 
 
 
458 aa  169  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0672  histidine kinase  37.89 
 
 
373 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1952  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.89 
 
 
752 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664907  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1972  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.25 
 
 
747 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466348  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  38.52 
 
 
608 aa  169  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1907  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.25 
 
 
747 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  37.83 
 
 
458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 
671 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  37.83 
 
 
458 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  37.83 
 
 
458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2841  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.14 
 
 
351 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 
522 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  37.83 
 
 
465 aa  167  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1311  sensory histidine kinase AtoS  39.27 
 
 
614 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 
544 aa  167  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0638  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 
373 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.11 
 
 
608 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2201  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
480 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2491  histidine kinase  34.46 
 
 
626 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653758 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0672  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 
373 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  38.11 
 
 
608 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  38.11 
 
 
608 aa  166  8e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  38.11 
 
 
608 aa  166  8e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  38.11 
 
 
608 aa  166  8e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  36.08 
 
 
487 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
473 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3818  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 
468 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.634058  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  37.55 
 
 
912 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0592  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.9 
 
 
516 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.597722 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3826  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
492 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873199  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2551  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 
396 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14529e-19 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 
540 aa  164  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2148  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 
729 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  37.39 
 
 
458 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2908  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.71 
 
 
604 aa  163  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.293686  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 
1519 aa  163  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2821  sensory box histidine kinase  36.71 
 
 
604 aa  163  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0016  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.66 
 
 
679 aa  163  9e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1745  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.96 
 
 
424 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 
367 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1662  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 
396 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4160  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.1 
 
 
516 aa  162  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
502 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0302487  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1970  histidine kinase  33.33 
 
 
502 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1016  sensor protein ZraS  34.74 
 
 
450 aa  162  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0625472  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2824  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
645 aa  161  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0078  histidine kinase  35.15 
 
 
475 aa  161  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0577  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
516 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
372 aa  160  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 
691 aa  160  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 
542 aa  160  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 
378 aa  159  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 
581 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671901  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2497  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.63 
 
 
1168 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.436801 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  34.31 
 
 
611 aa  159  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1970  sensory box histidine kinase  37.77 
 
 
415 aa  158  3e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.645732  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.84 
 
 
801 aa  158  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0612  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
516 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1897  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 
488 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1138  histidine kinase  36.2 
 
 
234 aa  157  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>