More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2560 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
540 aa  1125    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 
862 aa  206  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1054  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
552 aa  200  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000699137 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2388  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 
552 aa  197  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.245714  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  34.26 
 
 
621 aa  195  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2960  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 
557 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2233  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 
552 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0296242 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2275  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 
557 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.77 
 
 
819 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1987  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 
552 aa  187  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1311  sensory histidine kinase AtoS  29.25 
 
 
614 aa  186  7e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0505  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 
498 aa  186  8e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0550  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 
540 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0519596 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1500  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 
560 aa  183  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1700  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
591 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.7 
 
 
819 aa  179  9e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  30.89 
 
 
611 aa  179  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.89 
 
 
795 aa  178  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0114838  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0536  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.84 
 
 
531 aa  178  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2094  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 
872 aa  178  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  31.43 
 
 
1092 aa  176  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 
1519 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2787  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.09 
 
 
365 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220649  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1751  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 
671 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0768  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 
673 aa  174  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670648  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0828  sensory histidine kinase AtoS  29.41 
 
 
613 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.167481 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0233  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 
553 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446176  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 
662 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2492  sensory box histidine kinase  35.52 
 
 
830 aa  171  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0258  two component sensor histidine kinase  28.96 
 
 
556 aa  170  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 
586 aa  169  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.22 
 
 
801 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2216  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
475 aa  167  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263831  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0969  histidine kinase  30.16 
 
 
801 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000115814  hitchhiker  0.0000040144 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1511  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 
575 aa  166  9e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1016  sensor protein ZraS  36.84 
 
 
450 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0625472  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1918  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.69 
 
 
535 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.723955  normal  0.316434 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  28.77 
 
 
608 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.77 
 
 
608 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  35.94 
 
 
674 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  28.77 
 
 
608 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  28.77 
 
 
608 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  28.77 
 
 
608 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3826  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873199  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  28.77 
 
 
608 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0685  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.6 
 
 
770 aa  164  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000495863 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 
515 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0625  sensory box sensor histidine kinase  29.89 
 
 
853 aa  162  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0137493  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  35.25 
 
 
673 aa  162  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1736  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 
738 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
661 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1102  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.87 
 
 
823 aa  162  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.813916  normal  0.354207 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0841  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.29 
 
 
744 aa  161  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0672  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.84 
 
 
770 aa  161  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 
852 aa  161  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3560  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.52 
 
 
712 aa  161  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348943  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  33.97 
 
 
363 aa  160  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.68 
 
 
598 aa  160  5e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
839 aa  160  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00645827  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
522 aa  160  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.36 
 
 
1527 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.14 
 
 
1215 aa  159  8e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 
656 aa  159  9e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2908  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.72 
 
 
604 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.293686  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3720  histidine kinase  35.85 
 
 
693 aa  159  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3275  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 
631 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 
970 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  35.81 
 
 
656 aa  159  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
1432 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1992  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 
372 aa  159  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  35.71 
 
 
661 aa  158  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  36.68 
 
 
573 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 
368 aa  159  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.834527  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
595 aa  157  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.3 
 
 
759 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 
689 aa  157  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  35.89 
 
 
499 aa  158  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2821  sensory box histidine kinase  29.75 
 
 
604 aa  158  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0446  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.92 
 
 
1527 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.92 
 
 
1527 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0790  histidine kinase  34.76 
 
 
522 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 
542 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1841  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
832 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193006  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1012  sensory histidine kinase AtoS  34.9 
 
 
611 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0763097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0619  histidine kinase  36.73 
 
 
313 aa  157  6e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2707  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.61 
 
 
776 aa  157  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.21 
 
 
642 aa  157  7e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0016  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.2 
 
 
679 aa  156  7e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
510 aa  156  7e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2665  sensor histidine kinase  28.73 
 
 
590 aa  156  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650271 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  37.23 
 
 
367 aa  156  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1897  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
488 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1745  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.05 
 
 
424 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.05 
 
 
804 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
655 aa  156  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2659  hypothetical protein  28.73 
 
 
595 aa  156  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4160  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.46 
 
 
516 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2057  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.48 
 
 
747 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376311  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1494  sensory box histidine kinase  36.55 
 
 
550 aa  155  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102326  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2127  histidine kinase  36.82 
 
 
483 aa  155  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>